一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法技术

本发明专利技术属于生物信息学领域，涉及一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法，将T细胞受体的决定性互补区的可变基因段、连接基因段以及氨基酸序列进行充分融合，旨在提高决定性互补区的分类能力。该方法使用了一种新型的预处理方法，使得决定性互补区的基因类型和氨基酸序列数据合并为一种新数据，并对可变基因段和连接基因段各使用两个卷积神经网络模块同时提取特征，根据卷积提取到的特征对决定性互补区进行分类。该方法包括基因类型和氨基酸序列预处理、特征提取模块的构建和特征分类模块的构建三个步骤。该方法可有效融合决定性互补区的基因类型和氨基酸序列特征，取得更优的分类效果，对临床治疗和免疫过程的研究具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息学领域，涉及一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法。

技术介绍

1、决定性互补区位于t细胞受体的可变区域的可变基因片段与连接基因片段的相邻处。决定性互补区的功能与可变基因片段的类型、链接基因片段的类型以及它自身的氨基酸序列有直接关系。

2、不同的决定性互补区使得t细胞能够识别不同的抗原，因此准确分类决定性互补区对于人体免疫功能、疾病治疗具有重要意义。

3、目前大多数的决定性互补区分类方法都只基于决定性互补区的氨基酸序列，而少部分使用基因类型和氨基酸序列的方法则将这两种数据分开处理，无法使两者有效融合。因此如何将决定性互补区的可变基因片段的类型、连接基因片段的类型以及它自身的氨基酸序列进行充分的融合并分类成为当前该领域的一大难点。

技术实现思路

1、为了克服上述困难，本专利技术提出了一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法，本方法将t细胞受体的决定性互补区的可变基因段、连接基因段以及氨基酸序列进行充分融合，提高了分类性能。</p>

2、一种本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法，其特征在于，使用了一种新型的预处理方式将决定性互补区的基因类型和氨基酸序列进行有效的融合，从而形成一种新的数据，并提出相应的深度学习模型来对数据所包含的特征进行充分提取，包括基因类型和氨基酸序列预处理、特征提取模块的构建和特征分类模块的构建三个步骤，其具体步骤如下：

2.根据权利要求1所述的一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法，其特征在于，将原子序列中的每一个原子的独热编码与它的三维空间坐标相结合得到该原子的坐标热度编码，使用词向量代表将氨基酸序列中的各个氨基酸，将氨基酸序列转换为其对应的词向量矩阵后，分别...

【技术特征摘要】

1.一种基于基因类型和氨基酸序列的决定性互补区分类方法，其特征在于，使用了一种新型的预处理方式将决定性互补区的基因类型和氨基酸序列进行有效的融合，从而形成一种新的数据，并提出相应的深度学习模型来对数据所包含的特征进行充分提取，包括基因类型和氨基酸序列预处理、特征提取模块的构建和特征分类模块的构建三个步骤，其具体步骤如下：

2.根据权利要求1所...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘峻江，周树森，臧睦君，刘通，柳婵娟，王庆军，
申请(专利权)人：鲁东大学，
类型：发明
国别省市：