鉴别红螯螯虾遗传多样性的微卫星标记、引物及其应用制造技术

技术编号：40873011 阅读：4 留言：0更新日期：2024-04-08 16:40

本申请实施例公开了鉴别红螯螯虾遗传多样性的微卫星标记、引物及其应用。该微卫星标记选自Cq0002、Cq0009、Cq0016、Cq0019、Cq0022、Cq0031、Cq0041、Cq0044、Cq0083、Cq0084、Cq0086、Cq0099、Cq0100、Cq0104、Cq0112、Cq0117、Cq0135和Cq0159中的至少一项。该引物选自SEQ ID NO.1～36所示。该应用包括在红螯螯虾遗传学分析、育种和种质资源鉴定。该微卫星标记和/或引物对红螯螯虾养殖群体遗传多样性分析有助更好地了解红螯螯虾的遗传结构，从而为红螯螯虾的养殖资源育种、鉴定和保护提供更好的技术支持。

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【技术实现步骤摘要】

本申请涉及红螯螯虾，具体涉及鉴别红螯螯虾遗传多样性的微卫星标记、引物及其应用。

技术介绍

1、红螯螯虾(cherax quadricarinatus)又称澳洲淡水龙虾、红螯光壳螯虾，隶属甲壳纲、十足目、拟螯虾科、光壳虾属，原产于澳大利亚北部至巴布亚新几内亚南部，是多个国家的重要淡水经济虾种之一。与小龙虾相比，红螯螯虾体色呈青绿色，具有体形大、可食部分占比高、高蛋白低脂肪、氨基酸含量丰富、肉质鲜美，且养殖周期较短、适应能力强、病害少等特点，十分适合人工养殖。

2、为了解决当前红螯螯虾市场上种质混乱的问题，深入研究红螯螯虾养殖群体的遗传背景，对于提升我国红螯螯虾种质资源保育和管理、促进红螯螯虾的合理利用具有重要意义。

3、微卫星标记(simple sequence repeats，ssr)，是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列，由2～6个核苷酸的串联重复片段构成，由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富，因此微卫星标记的应用非常广泛。微卫星位点通常通过pcr扩增，扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。ssr分子标记技术广泛应用于中国对虾(fenneropenaeus chinensis)、鲤鱼(cyprinus carpio)等水生生物多态性和群体遗传多样性相关研究，是深入了解各种生物群体遗传结构的强有力工具。吴旭东等使用微卫星标记鉴定了三个鲶形目鱼类种群；张志伟等对草鱼(ctenopharyngodonidella)一个野生群体和两个养殖群体进行了遗传多样性分析；郑翔等利用

技术实现思路

1、本申请利用微卫星分子标记分析了红螯螯虾养殖群体的遗传多样性及遗传结构，为研究红螯螯虾养殖群体的遗传背景以培养优质的红螯螯虾养殖种质资源提供了支持。为此，本申请实施例至少公开了以下技术方案：

2、第一方面，实施例公开了红螯螯虾(cherax quadricarinatus)微卫星标记，选自cq0002、cq0009、cq0016、cq0019、cq0022、cq0031、cq0041、cq0044、cq0083、cq0084、cq0086、cq0099、cq0100、cq0104、cq0112、cq0117、cq0135和cq0159中的至少一项。

3、第二方面，实施例公开了红螯螯虾(cherax quadricarinatus)微卫星标记的引物，所述引物选自(a1)～(a18)中至少一项：(a1)如seq id no.19和20所述的引物对；(a2)如seq id no.21和22所述的引物对；(a3)如seq id no.23和24所述的引物对；(a4)如seqid no.25和26所述的引物对；(a5)如seq id no.27和28所述的引物对；(a6)如seq idno.29和30所述的引物对；(a7)如seq id no.31和32所述的引物对；(a8)如seq id no.33和34所述的引物对；(a9)如seq id no.35和36所述的引物对；(a10)如seq id no.37和38所述的引物对；(a11)如seq id no.39和40所述的引物对；(a12)如seq id no.41和42所述的引物对；(a13)如seq id no.43和44所述的引物对；(a14)如seq id no.45和46所述的引物对；(a15)如seq id no.47和48所述的引物对；(a16)如seq id no.48和50所述的引物对；(a17)如seq id no.51和52所述的引物对；(a18)如seq id no.53和54所述的引物对。

4、第三方面，实施例公开了一种试剂盒，包括第二方面所述的引物。

5、第四方面，实施例公开了一种检测红螯螯虾(cherax quadricarinatus)遗传学分析的方法，包括：合成第二方面所述的引物；利用所述引物对所述红螯螯虾的dna样本进行pcr扩增和荧光毛细管电泳，得到多态性扩增条带；对所述多态性扩增条带进行遗传学分析。

6、第五方面，实施例公开了第一方面所述的微卫星标记或第二方面所述的引物在红螯螯虾(cherax quadricarinatus)遗传学分析、育种和种质资源鉴定中的一种或多种中的应用。

7、第六方面，实施例公开了第一方面所述的微卫星标记或第二方面所述的引物在红螯螯虾(cherax quadricarinatus)遗传多样性分析、群体遗传结构分析、基因流分析、聚类分析和构建分子指纹图谱中的一种或多种。

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【技术保护点】

1.红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)微卫星标记，选自Cq0002、Cq0009、Cq0016、Cq0019、Cq0022、Cq0031、Cq0041、Cq0044、Cq0083、Cq0084、Cq0086、Cq0099、Cq0100、Cq0104、Cq0112、Cq0117、Cq0135和Cq0159中的至少一项。

2.根据权利要求1所述的微卫星标记，可选地，所述Cq0002的重复单元为“AC”，重复数为13；

3.红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)微卫星标记的引物，所述引物选自(a1)～(a18)中至少一项：

4.根据权利要求3所述的引物，所述微卫星标记选自(b1)～(b18)中至少一项；

5.一种试剂盒，包括权利要求3或4任一所述的引物。

6.一种检测红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)遗传学分析的方法，包括：

7.根据权利要求6所述的方法，所述遗传学分析包括遗传多样性分析、群体遗传结构分析、基因流分析和聚类分析。

8.根据权利

9.权利要求1～2任一所述的微卫星标记或权利要求3或4所述的引物在红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)遗传学分析、育种和种质资源鉴定中的一种或多种中的应用。

10.权利要求1～2任一所述的微卫星标记或权利要求3或4所述的引物在红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)遗传多样性分析、群体遗传结构分析、基因流分析、聚类分析和构建分子指纹图谱中的一种或多种。

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【技术特征摘要】

1.红螯螯虾(cherax quadricarinatus)微卫星标记，选自cq0002、cq0009、cq0016、cq0019、cq0022、cq0031、cq0041、cq0044、cq0083、cq0084、cq0086、cq0099、cq0100、cq0104、cq0112、cq0117、cq0135和cq0159中的至少一项。

2.根据权利要求1所述的微卫星标记，可选地，所述cq0002的重复单元为“ac”，重复数为13；

3.红螯螯虾(cherax quadricarinatus)微卫星标记的引物，所述引物选自(a1)～(a18)中至少一项：

4.根据权利要求3所述的引物，所述微卫星标记选自(b1)～(b18)中至少一项；

5.一种试剂盒，包括权利要求3或4任一所述的引物。

6.一种检测红螯螯虾(cher...

【专利技术属性】
技术研发人员：魏捷，于凌云，王亚坤，黄催雪，朱新平，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院珠江水产研究所，
类型：发明
国别省市：

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