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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于植物分子生物学领域,具体涉及适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因及其专用引物和应用。
技术介绍
1、枫香属(liquidambar)属于金缕梅科(hamamelidaceae),属内4种2变种,分别为枫香树(liquidambarformosana hance)、缺萼枫香(liquidambar aclycina chang)、北美枫香(liquidambarstyraciflua l.)、苏合香(liquidambar orientalis mill.)。枫香树为我国特有乡土树种,是南方地区的重要造林树种与景观树种,喜温暖湿润气候,性喜光,耐干旱瘠薄。枫香树主要产于中国秦岭及淮河以南各省,东南亚亚热带地区常见分布。
2、随着城市发展和社会进歩,人们已经不能仅仅满足于单纯的绿色景观,而是对五彩缤纷的彩色景观有了更多的追求,彩叶植物也逐渐被人们所认知和喜爱,城市绿化对彩叶树种的需求也越发增多。我国植物资源丰富,彩叶树种选育工作进展如火如荼,但与国外相比,我国在彩叶品种的培育与应用仍处于起步阶段。当前的应用状况在各项园林绿化工程中的比例不到5%,而欧美一些发达国家已经达到35%。其原因也是由于我国林木种质资源基础研究力量投入尚为薄弱,林木物种种内变异丰富,种质资源复杂多样,许多重要性状和种内变异类型仍有较大发掘利用空间,科学地鉴定、评价并应用,是林木种质资源工作者亟待需要研究的问题。
3、枫香树因叶色丰富而备受推崇,新品种选育工作主要聚焦于叶色变异,叶片呈紫色与红色的新品种居多。但是,目
技术实现思路
1、针对现有技术中存在的不足,本专利技术目的在于提供适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,该基因能够满足实时荧光定量检测枫香树不同组织转录表达水平的要求,提高了枫香树不同组织基因表达分析研究的稳定性和可靠性。本专利技术的另一目的是提供一种上述内参基因的专用引物。本专利技术还有一目的是提供一种上述内参基因或专用引物的应用。
2、为了解决上述技术问题,本专利技术所采用的技术方案如下:
3、适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,选自lifubq基因和lifact基因,所述lifubq基因的序列如seq id no.1所示,所述lifact基因的序列如seq id no.2所示。
4、所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,所述的枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
5、所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,所述的lifubq基因,其特异性扩增引物序列如下:
6、lifubq正向引物5’-aggagtgccctaatgccgagtg-3’
7、lifubq反向引物5’-cagccttctgataaacgtaagtcaa-3’。
8、所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,所述的lifact基因,其特异性扩增引物序列如下:
9、lifact正向引物5’-ccatcctccgtcttgaccttg-3’
10、lifact反向引物5’-agctgctcttggcagtctcca-3’。
11、适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的特异性引物,选自以下引物对:
12、lifubq正向引物5’-aggagtgccctaatgccgagtg-3’,
13、lifubq反向引物5’-cagccttctgataaacgtaagtcaa-3’;
14、lifact正向引物5’-ccatcctccgtcttgaccttg-3’,
15、lifact反向引物5’-agctgctcttggcagtctcca-3’。
16、所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的特异性引物,所述枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
17、用于枫香树不同组织荧光定量pcr的试剂盒,至少包括以下物质中的一种:
18、引物试剂1:lifubq正向引物5’-aggagtgccctaatgccgagtg-3’,
19、lifubq反向引物5’-cagccttctgataaacgtaagtcaa-3’;
20、引物试剂2:lifact正向引物5’-ccatcctccgtcttgaccttg-3’,
21、lifact反向引物5’-agctgctcttggcagtctcca-3’;
22、基因标样1:lifubq基因,序列如seq id no.1所示;
23、基因标样2:lifact基因,序列如seq id no.2所示。
24、所述的用于枫香树不同组织荧光定量pcr的试剂盒,所述枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实、茎。
25、lifubq基因和/或lifact基因作为内参基因组合在枫香树不同组织荧光定量pcr中的应用,所述不同组织包括枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
26、特异性引物在枫香树不同组织荧光定量pcr中的应用,所述不同组织包括枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎;所述特异性引物序列为:
27、lifubq正向引物5’-aggagtgccctaatgccgagtg-3’,
28、lifubq反向引物5’-cagccttctgataaacgtaagtcaa-3’;
29、和/或
30、lifact正向引物5’-ccatcctccgtcttgaccttg-3’,
31、lifact反向引物5’-agctgctcttggcagtctcca-3’。
32、有益效果:与现有技术相比,本专利技术的优点在于:
33、1)本专利技术以枫香树的5个不同组织为实验材料,包括叶片、叶柄、叶芽、果实、茎,依次通过荧光定量pcr分析,扩增曲线和熔解曲线分析,linregpcr扩增效率分析,bestkeeper、genorm、normfinder、delta ct和reffinder基因表达稳定性分析,最终获得适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的2个表达稳定的内参基因,分别为lifubq和lifact。其中,lifubq基因的基因序列如seq id no.1所示,lifact基因的基因序列如seq本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的内参基因,其特征在于,选自LifUBQ基因和LifACT基因,所述LifUBQ基因的序列如SEQ ID NO.1所示,所述LifACT基因的序列如SEQ IDNO.2所示。
2.根据权利要求1所述的适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的内参基因,其特征在于,所述的枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
3.根据权利要求1所述的适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的内参基因,其特征在于,所述的LifUBQ基因,其特异性扩增引物序列如下:
4.根据权利要求1所述的适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的内参基因,其特征在于,所述的LifACT基因,其特异性扩增引物序列如下:
5.适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的特异性引物,其特征在于,选自以下引物对:
6.根据权利要求5所述的适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的特异性引物,其特征在于,所述枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
7.用于枫香树不同组织荧光定量PCR的试剂盒,其特征在于,至少包括以下
8.根据权利要求7所述的用于枫香树不同组织荧光定量PCR的试剂盒,其特征在于,所述枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实、茎。
9.LifUBQ基因和/或LifACT基因作为内参基因组合在枫香树不同组织荧光定量PCR中的应用,所述不同组织包括枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
10.特异性引物在枫香树不同组织荧光定量PCR中的应用,所述不同组织包括枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎;所述特异性引物序列为:
...【技术特征摘要】
1.适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,其特征在于,选自lifubq基因和lifact基因,所述lifubq基因的序列如seq id no.1所示,所述lifact基因的序列如seq idno.2所示。
2.根据权利要求1所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,其特征在于,所述的枫香树不同组织选自枫香树的叶片、叶柄、叶芽、果实和茎。
3.根据权利要求1所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,其特征在于,所述的lifubq基因,其特异性扩增引物序列如下:
4.根据权利要求1所述的适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的内参基因,其特征在于,所述的lifact基因,其特异性扩增引物序列如下:
5.适用于枫香树不同组织荧光定量pcr的特异性引物,其特征在...
【专利技术属性】
技术研发人员:周芳伟,杨少宗,石从广,张燕琴,
申请(专利权)人:浙江省林业科学研究院,
类型:发明
国别省市:
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