【技术实现步骤摘要】
本申请涉及生物，具体地，涉及一种用于诊断骨肉瘤不同预后亚型的预测系统。
技术介绍
1、骨肉瘤是骨中最常见的原发恶性肿瘤，每年发病率为2-3例/百万人，占人类恶性肿瘤的0.2％，占骨原发肿瘤的11.7％。它最常发生在青少年(每百万人4.4例)，这与生长突增相吻合。发病率的第二个高峰发生在大于65岁的成年人(每百万人4.2例)。80％～90％的骨肉瘤发生于长骨，最常见的部位是股骨远端和胫骨近端，其次是肱骨近端。此外，在两年内约85％的骨肉瘤转移倾向于扩散到肺部。然而，骨肉瘤的确切病因和发病机制尚不清楚。
2、由于骨肉瘤是高度侵袭性的恶性肿瘤，患者持续承受剧烈疼痛，病理性骨折的风险增加。无论肿瘤是原发的还是转移的，患者都需要接受包括严格的多药治疗和广泛的手术切除的治疗方案。尽管不断尝试完善既定的治疗方案，但在过去30年里，仍然难以改善骨肉瘤生存结果。骨肉瘤转移或复发预示预后不良，5年生存率低于30％。此外，骨肉瘤病例容易对强化化疗产生耐药性，导致严重的毒性和嗜中性粒细胞减少症、感染并发症和血小板减少症的发病率增加。
3、2021年，song等人根据肿瘤微环境(tumor microenvironment，tme)将骨肉瘤分为两种亚型，并描述了其亚型的免疫学特征，但骨肉瘤免疫治疗并没有较好的临床效果，亟需从其它角度来进行骨肉瘤分型并研究针对性治疗策略。
4、在初始活检时识别骨肉瘤患者的亚型有助于早期制定更精确的治疗策略，优化治疗疗效。为了完善目前的治疗方案，提供更个性化的治疗方案，需要在骨肉瘤患者中鉴
技术实现思路
1、本专利技术的目的是在骨肉瘤患者中鉴定出具有预后和分子差异的新的不同亚型，来完善目前的治疗方案，提供更个性化的治疗方案。
2、本专利技术提供了一种用于诊断骨肉瘤不同预后亚型的预测系统，该系统包括计算装置、用于输入骨肉瘤患者个体的多个标志物分子的表达量的输入装置和用于输出骨肉瘤亚型诊断结果的输出装置；其中，所述多个标志物分子包括slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15；所述计算装置包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序，以实现如式(1)所示的判别函数的算法：
3、f＝1.486a+0.541b-0.508c-0.552d式(1)
4、式(1)中，f表示风险分数，f返回值为0.35以上时表示骨肉瘤分型为预后不良亚型，f返回值小于0.35时表示骨肉瘤分型为预后较好亚型；a、b、c和d依次分别表示slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15的表达量。
5、可选地，所述多个标志物分子的表达量为即所检测肿瘤组织转录组测序(rna-seq)所得的每百万个检测序列中目的基因的转录本数目(tpm)，再进行分位数标准化(quantile normalization)所得的量值。
6、可选地，其中，该系统还包括多个标志物分子的表达量的检测装置。
7、可选地，其中，所述多个标志物分子的表达量为相对于内参基因的相对表达量，所述内参基因为bactin。
8、可选地，其中，所述多个标志物分子的表达量的检测装置包括标志物分子表达量检测芯片和芯片信号读取器，标志物分子表达量检测芯片包括分别检测slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15的表达量的探针。
9、可选地，其中，所述多个标志物的表达量的检测装置包括实时定量pcr仪和分子的实时定量pcr引物，分子的实时定量pcr引物包括分别检测slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15的表达量的实时定量pcr引物。
10、可选地，其中，所述预后不良亚型表现为旺盛的脂质代谢，而预后较好亚型表现为显著的破骨性骨吸收、免疫浸润和细胞增殖。。
11、本专利技术还提供了如上所述的系统在制备用于诊断不同亚型的骨肉瘤的医疗仪器中的用途。
12、本专利技术还提供了一种用于诊断不同亚型的骨肉瘤的标志物分子组合，该标志物分子组合包括slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15。
13、优选地，其中，该标志物分子组合由slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15组成。
14、本专利技术还提供了检测标志物的表达量的试剂在制备用于诊断不同亚型的骨肉瘤的试剂盒中的用途，其中，所述标志物包括slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15。
15、通过上述技术方案，本专利技术应用支持向量机(svm)算法建立了一个亚型诊断模型(subtype diagnostic model，sdm)，并使用最小绝对收缩和选择算子(lasso)方法建立了一个4基因模型来识别不良结果，为进一步提高骨肉瘤精准医疗的疗效提供了有益的参考。
16、本专利技术的其他特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种用于诊断骨肉瘤不同预后亚型的预测系统，其特征在于，该系统包括计算装置、用于输入骨肉瘤患者个体的多个标志物分子的表达量的输入装置和用于输出骨肉瘤亚型诊断结果的输出装置；其中，所述多个标志物分子包括SLC8A3、PTPRZ1、CCR1和SIGLEC15；所述计算装置包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序，以实现如式(1)所示的判别函数的算法：
2.根据权利要求1所述的系统，其中，该系统还包括多个标志物分子的表达量的检测装置。
3.根据权利要求1或2所述的系统，其中，所述多个标志物分子的表达量为所检测肿瘤组织的转录组测序结果中，每百万个检测序列中目的基因的转录本数目进行分位数标准化所得的量值。
4.根据权利要求2所述的系统，其中，所述多个标志物分子的表达量的检测装置包括标志物分子表达量检测芯片和芯片信号读取器，标志物分子表达量检测芯片包括分别检测SLC8A3、PTPRZ1、CCR1和SIGLEC15的表达量的探针。
5.根据权利要求2所述的系统，其中，所述多个标志物的表
6.根据权利要求1或2所述的系统，其中，预后不良亚型表现为旺盛的脂质代谢，所述预后较好亚型表现为显著的破骨性骨吸收、免疫浸润和细胞增殖。
7.权利要求1～6中任意一项所述的系统在制备用于诊断不同亚型的骨肉瘤的医疗仪器中的用途。
8.一种用于诊断不同亚型的骨肉瘤的标志物分子组合，其特征在于，该标志物分子组合包括SLC8A3、PTPRZ1、CCR1和SIGLEC15。
9.根据权利要求8所述的标志物分子组合，其中，该标志物分子组合由SLC8A3、PTPRZ1、CCR1和SIGLEC15组成。
10.检测标志物的表达量的试剂在制备用于诊断不同亚型的骨肉瘤的试剂盒中的用途，其中，所述标志物包括SLC8A3、PTPRZ1、CCR1和SIGLEC15。
...【技术特征摘要】
1.一种用于诊断骨肉瘤不同预后亚型的预测系统，其特征在于，该系统包括计算装置、用于输入骨肉瘤患者个体的多个标志物分子的表达量的输入装置和用于输出骨肉瘤亚型诊断结果的输出装置；其中，所述多个标志物分子包括slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15；所述计算装置包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序，以实现如式(1)所示的判别函数的算法：
2.根据权利要求1所述的系统，其中，该系统还包括多个标志物分子的表达量的检测装置。
3.根据权利要求1或2所述的系统，其中，所述多个标志物分子的表达量为所检测肿瘤组织的转录组测序结果中，每百万个检测序列中目的基因的转录本数目进行分位数标准化所得的量值。
4.根据权利要求2所述的系统，其中，所述多个标志物分子的表达量的检测装置包括标志物分子表达量检测芯片和芯片信号读取器，标志物分子表达量检测芯片包括分别检测slc8a3、ptprz1、ccr1和siglec15的表达量的探针。
5.根据权利要求2所...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨冬，孙爱华，郑坤，侯雨杉，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，
类型：发明
国别省市：
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