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用于辅助区分甲状腺良恶性肿瘤的数据处理装置及其应用制造方法及图纸

技术编号:40666648 阅读:5 留言:0更新日期:2024-03-18 19:01
本发明专利技术公开了用于辅助区分甲状腺良恶性肿瘤的数据处理装置及其应用。本发明专利技术要求保护一种用于辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤的数据处理装置,包括用于建立数学模型的单元X(含有数据采集模块、数据分析处理模块和模型输出模块)和用于确定待测样本类型的单元Y(含有数据输入模块、数据运算模块、数据比较模块和结论输出模块)。本发明专利技术揭示了相较于甲状腺良性肿瘤,甲状腺癌患者组织中CUX2基因的低甲基化现象,本发明专利技术对提高甲状腺癌早期诊疗效果和降低甲状腺癌死亡率,及指导制定合理的临床治疗方案均有重要科学意义和重要临床应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及医疗信息学领域,特别涉及用于辅助区分甲状腺良恶性肿瘤的数据处理装置及其应用


技术介绍

1、甲状腺癌(thyroid cancer)为最常见的内分泌系统恶性肿瘤,可包括甲状腺乳头状癌、滤泡性甲状腺癌、未分化甲状腺癌和髓样癌。其中,乳头状癌(papillary thyroidcancer,ptc)最为常见,占所有甲状腺恶性肿瘤的90%以上[xing,mingzhao;haugen,bryanr;schlumberger,martin(2013).progress in molecular-based management ofdifferentiated thyroid cancer.the lancet,381(9871),1058–1069.]。根据统计,成人甲状腺结节的患病率约为5-10%,其中60岁以上的人群最为严重,可高达50-70%[guth s,theune u,aberle j,et al.very high prevalence of thyroid nodules detected byhigh frequency(13mhz)ultrasound examination.eur jclin invest 2009;39:699-706.]。影像学检查是一种比较普遍的甲状腺诊断方法,该方法大多依靠医生经验判断,存在着一定的结果误差,且影像学会对人身体有一定的辐射伤害。细针穿刺活检也是临床上常见的甲状腺癌诊断技术,该方法可根据穿刺物的细胞学形态对结节的良恶性进行评估。由于甲状腺良恶性肿瘤的细胞学特征经常会发生重叠,因此有约10-30%的细针穿刺诊断为不明确的细胞学结果[cibas es,ali sz.the 2017bethesda system for reportingthyroid cytopathology.thyroid.2017;27(11):1341-6.]。不确定的穿刺结果导致约60%患者遭受过度治疗或者漏诊[stewart r,leang yj,bhatt cr,grodski s,serpell j,leejc.quantifying the differences in surgical management of patients withdefinitive and indeterminate thyroid nodule cytology.eur j surg oncol.2020;46(2):252-7.]。这不仅增加了患者经济和身心负担,还占据了大量公共卫生资源,导致医疗保健系统的巨额财务成本。

2、表观遗传学为一种不涉及dna序列改变但是可遗传的基因表达调控方式,并且能够遗传给下一代[nicoglou a,merlin f.epigenetics:a way to bridge the gapbetween biological fields.stud hist philos biol biomed sci.2017;66:73-82]。dna甲基化是表观遗传调控的重要方式之一,是指在dna甲基化转移酶作用下,在基因组cpg二核苷酸的胞嘧啶5’碳位共价键结合一个甲基基团[bird a.perceptions ofepigenetics.nature.2007;447:396-398]。大量研究表明,dna甲基化能够引起染色质结构、dna构象、dna稳定性及dna与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因的表达[mooreld,le t,fan g.dna methylation and its basic function.neuropsychopharmacology.2013;38:23-38]。

3、dna甲基化标志物是现阶段最佳的肿瘤体外早诊分子标志物,目前,临床上关于甲状腺癌诊断标志物的灵敏度和特异性都很有限,尤其是缺乏早期诊断标志物,因此更为敏感、特异的早期分子标记物亟待发掘。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是提供用于辅助区分甲状腺良恶性肿瘤的数据处理装置及其应用。

2、第一方面,本专利技术要求保护一种用于辅助区分a类型样本和b类型样本的数据处理装置。所述a类型样本和所述b类型样本为如下任一种:

3、(e1)甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤;

4、(e2)甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤;

5、(e3)甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤;

6、(e4)不同亚型的甲状腺恶性肿瘤;

7、(e5)不同分期的甲状腺恶性肿瘤。

8、本专利技术所要求保护的数据处理装置包括单元x和单元y;

9、所述单元x用于建立数学模型,包括数据采集模块、数据分析处理模块和模型输出模块;

10、所述数据采集模块被配置为采集n1个所述a类型样本和n2个所述b类型样本的cux2基因甲基化水平数据;

11、所述数据分析处理模块被配置为接收来自于所述数据采集模块的所述n1个a类型样本和n2个b类型样本的cux2基因甲基化水平数据,按照a类型和b类型的分类方式,通过二分类逻辑回归法建立数学模型,确定分类判定的阈值;

12、其中,n1和n2均可为10以上正整数,如100以上。

13、所述模型输出模块被配置为接收来自于所述数据分析处理模块建立的所述数学模型,并进行输出;

14、所述单元y用于确定待测样本类型,包括数据输入模块、数据运算模块、数据比较模块和结论输出模块;

15、所述数据输入模块被配置为输入待测者的cux2基因甲基化水平数据;

16、所述数据运算模块被配置为接收来自于所述数据输入模块的所述待测者的cux2基因甲基化水平数据,并将所述待测者的cux2基因甲基化水平数据代入所述单元x中的所述数据分析处理模块建立的所述数学模型,计算得到检测指数;

17、所述数据比较模块被配置为接收来自于所述数据运算模块计算得到的检测指数,并将所述检测指数与所述单元x中的所述数据分析处理模块中确定的所述阈值进行比较;

18、所述结论输出模块被配置为接收来自于所述数据比较模块的比较结果,并根据所述比较结果输出所述待测样本的类型是a类型还是b类型的结论。

19、进一步地,(e2)和(e4)中所述不同亚型可为病理分型,如组织学分型。

20、进一步地,(e3)和(e5)中所述不同分期可为临床分期。

21、在本专利技术的具体实施方式中,(e2)中所述甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤具体可为如下任一种:甲状腺良性肿瘤和甲状腺乳头状癌、甲状腺良性肿瘤和甲状腺滤泡癌、甲状腺良性肿瘤和甲状腺髓样癌、甲状腺良性肿瘤和甲状腺未分化癌。

22、在本专利技术的具体实施方式中,(e3)中所述甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤具体可为如下任一种:甲状腺良性肿瘤和ⅰ期甲状腺恶性肿瘤、甲状腺良性肿瘤和ⅱ期甲状腺恶性肿瘤、甲状腺良性肿瘤和ⅲ期甲状腺恶本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于辅助区分A类型样本和B类型样本的数据处理装置,所述A类型样本和所述B类型样本为如下任一种:

2.一种系统,包括:

3.一种计算机可读存储介质,其特征在于:所述计算机可读存储介质存储有用于执行下述步骤的计算机程序:

4.根据权利要求1所述的数据处理装置或权利要求2所述的系统或权利要求3所述的计算机可读存储介质,其特征在于:

5.根据权利要求4所述的数据处理装置或系统或计算机可读存储介质,其特征在于:所述全部或部分CpG位点为如下任一所示CpG位点:

6.根据权利要求2或4或5所述的系统,其特征在于:所述用于检测CUX2基因甲基化水平的试剂包含用于扩增CUX2基因全长或部分片段的引物组合;

7.一种甲基化生物标志物,其特征在于:所述甲基化生物标志物的核苷酸序列为CUX2基因中如下(A1)-(A4)所示片段中的全部或部分CpG位点的甲基化水平:

8.如下任一应用:

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于:用于检测权利要求7所述甲基化生物标志物的甲基化水平的物质包含用于扩增CUX2基因全长或部分片段的引物组合;

10.根据权利要求2-9中任一所述的数据处理装置或系统或计算机可读介质或甲基化生物标志物或应用,其特征在于:检测所述CUX2基因甲基化水平为检测肿瘤组织样本中所述CUX2基因甲基化水平;或

...

【技术特征摘要】

1.一种用于辅助区分a类型样本和b类型样本的数据处理装置,所述a类型样本和所述b类型样本为如下任一种:

2.一种系统,包括:

3.一种计算机可读存储介质,其特征在于:所述计算机可读存储介质存储有用于执行下述步骤的计算机程序:

4.根据权利要求1所述的数据处理装置或权利要求2所述的系统或权利要求3所述的计算机可读存储介质,其特征在于:

5.根据权利要求4所述的数据处理装置或系统或计算机可读存储介质,其特征在于:所述全部或部分cpg位点为如下任一所示cpg位点:

6.根据权利要求2或4或5所述的系统,其特征在于:所述用于检测cux2基因甲基化水平的试剂...

【专利技术属性】
技术研发人员:张筝张晶
申请(专利权)人:腾辰生物科技上海有限公司
类型:发明
国别省市:

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