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用于肉牛基因分型检测的分子标记组合及应用制造技术

技术编号:40561558 阅读:8 留言:0更新日期:2024-03-05 19:24
本申请提供一种用于肉牛基因分型检测的分子标记组合、分子探针组合、基因芯片、试剂盒及其应用和构建肉牛基因库的方法及肉牛个体识别的方法。本申请的标记组合包括如表1所示的5000个SNP位点。根据本申请实施例的技术方案,基于5000个SNP位点,可进行多品种肉牛个体识别,适用于多个肉牛品种,解决了目前肉牛个体精准鉴定方案存在的不足,可满足生物资产贷款、牛只保险、个体溯源及精准识别的产业应用需要。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及家畜个体识别精准鉴定,具体涉及用于肉牛基因分型检测的分子标记组合及应用


技术介绍

1、肉牛个体价值大,肉牛养殖属于重资产投资行业。为缓解养殖户的经济压力,各金融平台也相继出台了生物资产抵押贷款政策和肉牛养殖保险业务,并逐渐已成为畜牧业的常规业务需求。

2、在上述业务中,常存在生物资产转移或灭失的情况。为确认申报牛只是已投保或抵押个体,产业实践中常需开展牛只个体的精准鉴定工作。但是,传统个体识别技术精确性低,微卫星等分子技术检测难度大,少量snp(single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)位点产品无法满足多品种的精准鉴定需要。

3、此外,在肉牛产品的溯源中,也需要一种能够进行个体精准溯源的方案。


技术实现思路

1、根据本申请的一方面,提供一种用于肉牛基因分型检测的分子标记组合,包括:如表1所示的5000个snp位点。

2、根据本申请的另一方面,提供一种用于肉牛基因分型检测的分子探针组合,所述分子探针组合检测待测样品中如表1所示的5000个snp位点。

3、根据本申请的另一方面,提供一种用于肉牛基因分型检测的基因芯片,所述基因芯片包含前述的分子探针组合。

4、根据本申请的另一方面,提供一种用于肉牛基因分型检测的试剂盒,包括前述的分子探针组合或基因芯片。

5、根据本申请的另一方面,提供根据前述的分子标记组合或根据前述的分子探针组合或根据前述的基因芯片或根据前述的试剂盒在肉牛个体识别中的应用。

6、根据本申请的另一方面,提供一种构建肉牛基因库的方法,所述方法基于前述的分子标记组合或前述的分子探针组合或前述的基因芯片或前述的试剂盒,所述方法包括:

7、采集目标肉牛群体的组织样本;

8、对检测合格的样本构建测序文库;

9、对样本进行基因组测序和位点基因分型判定;

10、确认个体所述5000个snp位点的基因型。

11、根据一些实施例,所述基因型的格式包括:aa、tt、cc、gg、at、ac、ag、ta、tc、tg、ca、ct、cg、ga、gt、gc、na。

12、根据本申请的另一方面,提供前述的分子标记组合或前述的分子探针组合或前述的基因芯片或前述的试剂盒或前述的方法在肉牛产品溯源中的应用。

13、根据本申请的另一方面,提供一种肉牛个体识别的方法,包括:

14、采用前述的方法预先构建目标肉牛群体的肉牛基因库;

15、采集待确定肉牛个体的组织样本并确定所述5000个snp位点的基因型;

16、将所述待确定肉牛个体的基因型与所述肉牛基因库中所有样本进行两两比对;

17、采用下面的遗传相似度计算公式,根据阈值判定所述待确定肉牛个体是否为所述肉牛基因库中的一个:

18、gs=g_i j/g_ij×100%

19、其中,gs为待确定肉牛个体与对比样本之间的遗传相似度,g_i j为待确定肉牛个体与对比样本均检出且基因型一致的snp位点数,g_ij为待确定肉牛个体与对比样本均检出的snp位点总数。

20、根据一些实施例,前述方法还用于肉牛产品的溯源。

21、根据本申请实施例的技术方案,基于5000个snp位点,可进行多品种肉牛个体识别,适用于多个肉牛品种,解决了目前肉牛个体精准鉴定方案存在的不足,可满足生物资产贷款、牛只保险、个体溯源及精准识别的产业应用需要。

22、应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性的,并不能限制本申请。

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【技术保护点】

1.一种用于肉牛基因分型检测的分子标记组合,其特征在于,包括:如表1所示的5000个SNP位点。

2.一种用于肉牛基因分型检测的分子探针组合,其特征在于,所述分子探针组合检测待测样品中如表1所示的5000个SNP位点。

3.一种用于肉牛基因分型检测的基因芯片,其特征在于,所述基因芯片包含根据权利要求2所述的分子探针组合。

4.一种用于肉牛基因分型检测的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求2所述的分子探针组合或如权利要求3所述的基因芯片。

5.根据权利要求1所述的分子标记组合或根据权利要求2所述的分子探针组合或根据权利要求3所述的基因芯片或根据权利要求4所述的试剂盒在肉牛个体识别中的应用。

6.一种构建肉牛基因库的方法,其特征在于,所述方法基于根据权利要求1所述的分子标记组合或根据权利要求2所述的分子探针组合或根据权利要求3所述的基因芯片或根据权利要求4所述的试剂盒,所述方法包括:

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述基因型的格式包括:AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TA、TC、TG、CA、CT、CG、GA、GT、GC、NA。

8.根据权利要求1所述的分子标记组合或根据权利要求2所述的分子探针组合或根据权利要求3所述的基因芯片或根据权利要求4所述的试剂盒或根据权利要求6或7所述的方法在肉牛产品溯源中的应用。

9.一种肉牛个体识别的方法,其特征在于,包括:

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述方法还用于肉牛产品的溯源。

...

【技术特征摘要】

1.一种用于肉牛基因分型检测的分子标记组合,其特征在于,包括:如表1所示的5000个snp位点。

2.一种用于肉牛基因分型检测的分子探针组合,其特征在于,所述分子探针组合检测待测样品中如表1所示的5000个snp位点。

3.一种用于肉牛基因分型检测的基因芯片,其特征在于,所述基因芯片包含根据权利要求2所述的分子探针组合。

4.一种用于肉牛基因分型检测的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求2所述的分子探针组合或如权利要求3所述的基因芯片。

5.根据权利要求1所述的分子标记组合或根据权利要求2所述的分子探针组合或根据权利要求3所述的基因芯片或根据权利要求4所述的试剂盒在肉牛个体识别中的应用。

6.一种构建肉牛基因库的方法,其...

【专利技术属性】
技术研发人员:盖珂珂董林华
申请(专利权)人:北京牧国科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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