【技术实现步骤摘要】
本公开涉及基因测序,尤其涉及一种文库扩增单克隆纯度表征方法。
技术介绍
1、现阶段高通量测序技术发展迅速,已成为目前生命研究的常用的分析方法,它具有通量高、检测速度快、灵活多用、成本低的特点,这种技术需要dna文库中的单个分子在带有微反应室(如微坑)的芯片中进行扩增放大信号,从而实现同时检测几十万到几百万的dna分子的目的。
2、在扩增前,需要将dna文库均匀的杂交到带有微坑的芯片表面,而dna文库中的dna分子进入到微坑的数量符合泊松分布,即一定浓度的dna文库随机杂交到芯片的微坑中,使泊松分布的λ为1时(即达到最高单克隆率),36%的微坑中有1个dna分子,36%的微坑中没有dna分子,28%的微坑中有2个及2个以上的dna分子。
3、在后续的扩增过程中,微坑中的多个分子会同时扩增,产生包含多种dna文库模板的多克隆,会严重影响测序准确度。单克隆纯度低于某一阈值时,将直接影响后续测序信号的分辨,甚至无法达到测序的目的,对测序通量影响很大,因此,亟需要开发一种方法来表征文库扩增后的单克隆纯度。
【技术保护点】
1.一种文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤S1中,所述文库的数量至少为4种,步骤S2中,所述测序引物的数量至少为4种。
3.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤S3中,将所述多种文库按相同比例进行混合。
4.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤S5中的测序反应为3'端开放的测序反应。
5.根据权利要求4所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤S5中,每个循环延伸的碱基个数为M
<...【技术特征摘要】
1.一种文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤s1中,所述文库的数量至少为4种,步骤s2中,所述测序引物的数量至少为4种。
3.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤s3中,将所述多种文库按相同比例进行混合。
4.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤s5中的测序反应为3'端开放的测序反应。
5.根据权利要求4所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤s5中,每个循环延伸的碱基个数为m,m≥3。
6.根据权利要求1所述的文库扩增单克隆纯度表征方法,其特征在于,步骤s5中,...
【专利技术属性】
技术研发人员:沈晨,乔朔,陈子天,康力,李昂,
申请(专利权)人:赛纳生物科技北京有限公司,
类型:发明
国别省市:
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