一种蛋白质突变效应预测方法、装置、设备及介质制造方法及图纸

技术编号:40513195 阅读:25 留言:0更新日期:2024-03-01 13:29
本申请公开了一种蛋白质突变效应预测方法、装置、设备及介质,涉及蛋白质序列技术领域,包括:获取待预测蛋白质序列,将待预测蛋白质序列输入至预设突变效应预测模型;通过预设突变效应预测模型提取待预测蛋白质序列的三维结构特征信息和序列特征信息,以基于三维结构特征信息和序列特征信息获取待预测蛋白质序列的结构特征向量和突变指纹预测值;通过预设突变效应预测模型对结构特征向量和突变指纹预测值进行计算,以得到待预测蛋白质序列的基于三维结构的目标预测值,以便基于目标预测值确定待预测蛋白质序列的蛋白质突变效应结果。更全面地理解突变对蛋白质结构和功能的影响,并提高突变效应预测的准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及蛋白质序列,特别涉及一种蛋白质突变效应预测方法、装置、设备及介质


技术介绍

1、预测蛋白质突变效应是一个复杂的任务,因为突变可能涉及多种类型的结构和功能变化,这些变化可能相互关联并受到多种因素的影响。传统的蛋白质突变效应预测方法主要基于经验规则和统计分析。这些方法可以提供有限的预测准确性,但对于理解和预测复杂的突变效应仍然存在局限性。此外,传统的预测方法通常需要大量的实验数据来进行训练和验证,这不仅增加了成本和时间,而且也可能限制其泛化能力。此外,mlde(machine-learning-guided directed evolution,机器学习指导的定向进化)提供了一种从蛋白质序列提取信息用于突变效应预测的方法。该方法接受一个蛋白质序列以及突变位点作为输入,计算在指定突变位点上的所有组合突变的适应度(即目标性质)值。gvp-msa(geometricvector perception-multiple sequence alignment,几何向量感知机-多序列比对)则是基于蛋白质的结构文件训练一个端到端的神经网络模型。该方法结合结构本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,所述获取待预测蛋白质序列,将所述待预测蛋白质序列输入至预设突变效应预测模型,包括:

3.根据权利要求1所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,所述通过所述预设突变效应预测模型提取所述待预测蛋白质序列的三维结构特征信息,包括:

4.根据权利要求1所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,通过所述预设突变效应预测模型提取所述待预测蛋白质序列的序列特征信息,包括:

5.根据权利要求4所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,所述通过所...

【技术特征摘要】

1.一种蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,所述获取待预测蛋白质序列,将所述待预测蛋白质序列输入至预设突变效应预测模型,包括:

3.根据权利要求1所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,所述通过所述预设突变效应预测模型提取所述待预测蛋白质序列的三维结构特征信息,包括:

4.根据权利要求1所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,通过所述预设突变效应预测模型提取所述待预测蛋白质序列的序列特征信息,包括:

5.根据权利要求4所述的蛋白质突变效应预测方法,其特征在于,所述通过所述预设突变效应预测模型的序列特征...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘珂张慧锋李加忠于铁妹潘俊锋刘建
申请(专利权)人:深圳瑞德林生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:

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