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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于药理学,尤其涉及一种基于网络药理学确定健脾祛湿中药核心活性成分和作用机理的方法。
技术介绍
1、脾虚湿盛是指脾虚内湿阻滞的病理。脾主运化水湿,主升,为喜燥恶湿之脏,脾虚则运化功能低下,引起水湿停滞。水湿的停滞又反过来妨碍脾的运化,二者互为因果,相互加重。其主要症状有饮食减少、胃脘满闷、大便泄泻,甚或恶心欲吐,口粘不渴;肢体倦怠,甚或浮肿,舌苔厚腻,脉缓等。临证治疗常以健脾益气,渗湿止泻之法治之[1,2]。茯苓、薏苡仁、白术、苍术、白扁豆、佩兰、砂仁、黄芪和陈皮是中医临床上典型的健脾祛湿药物[3]。相关研究表明,应用中医药对脾虚湿盛引起的腹胀、腹泻治疗疗效显著,而且副作用小,安全可靠[1]。但是,中医临床治疗脾虚湿盛以多机制、多靶点为特征。因此,难于确定相关治疗的核心药物活性成分及其主要作用机制。目前,中医药治疗脾虚湿盛的核心药物成分及主要作用机制尚未见报道。
2、网络药理学是基于系统生物学的理论,同时结合计算机分析、生物信息学等多学科,对生物系统内药物与靶点相互作用进行网络化分析,从而识别主要活性药物成分及其靶点并进行机理分析的新学科。网络药理学从多靶点研究策略入手,多层次、多角度实现药物作用的综合网络分析,不仅能快速、高效、准确地分析中药作用靶点和机制,还能挖掘出中药复方的主要活性成分,为传统中药研究和现代药理学之间搭建了重要而有效的桥梁。
技术实现思路
1、基于以上背景,本专利技术提供一种基于网络药理学确定健脾祛湿中药核心活性成分和作用机理的方法,其基
2、本专利技术提供的技术方案为:
3、一种基于网络药理学确定健脾祛湿中药核心活性成分及其作用机理的方法,其包括如下步骤:
4、s1:筛选健脾祛湿中药成分:
5、在tcmsp数据库中检索“茯苓”、“薏苡仁”、“白术”、“苍术”、“白扁豆”、“佩兰”、“砂仁”、“黄芪”、“芡实”和“陈皮”的化学成分并进行活性成分筛选,获得健脾祛湿中药活性成分信息;
6、s2:获取活性成分靶点:
7、在tcmsp数据库中通过检索得到的活性成分界面,点击相关靶点选项,检索得出健脾祛湿中药的活性成分相关靶点,将靶点名由蛋白质名称校正为基因名称;
8、s3:构建活性成分-相关靶点的网络:
9、将健脾祛湿中药的靶点上传至cytoscape3.9.1软件中,构建“活性成分-相关靶点”网络,进行可视化分析;
10、s4:构建蛋白质相互作用网络构建:
11、在string数据库中检索到健脾祛湿中药相关靶点,利用multiple proteins方法,将物种选定为homo sapiens,得到蛋白质相互作用网络图;
12、s5:go及kegg通路富集分析:
13、基于生物学信息注释数据库进行靶点的go和kegg通路富集分析。所述中药系统药理数据库及分析平台选自tcmsp,筛选条件为ob≥30%、dl≥0.18(ob:口服生物利用度,dl:类药性)。
14、s6:筛选健脾祛湿中药相关靶点网络中的hubgene:
15、将string数据库的资料以excel格式导入到cytoscape3.9.1软件中,应用hubgene插件从蛋白质相互作用网络中筛选hubgene,从而识别健脾祛湿中药作用的核心靶点;
16、s7:确定健脾祛湿中药的核心活性成分:
17、通过步骤s6得到的hubgene导入到excel表格,找到与之相关的靶点,从而确定健脾祛湿中药的核心靶点。然后,根据核心靶点确定与之作用的核心活性成分。
18、本专利技术首次对中医健脾祛湿治疗的核心靶点及主要作用机理进行了系统研究。采取上述技术方案,具有的有益效果如下:
19、1)本专利技术应用网络药理学方法,并结合生物信息学技术和计算机网络技术,有效揭示中医健脾祛湿药物治疗核心药物活性成分及作用原理,为中医临床健脾祛湿治疗提供了科学的理论基础,同时为中医健脾祛湿临床治疗和科学研究提供了新的方法。
20、2)本专利技术为中西医结合治疗脾虚湿盛导致的相关疾病的治疗提供新的理论依据。
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1.一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,其包括如下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,所述中药系统药理数据库及分析平台选自TCMSP,筛选条件为OB≥30%、DL≥0.18。
3.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤S2中以关键词“茯苓”、“薏苡仁”、“白术”、“苍术”、“白扁豆”、“佩兰”、“砂仁”、“黄芪”、“芡实”和“陈皮”在TCMSP数据库中通过检索得到的活性成分界面;将靶点名校正为基因名称的操作为:在通用蛋白质数据库Uniprot中查找蛋白质基因名,在检索区输入蛋白的名称,物种选择为“Human”,即得到蛋白质对应的基因名称。
4.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤S3中活性成分-相关靶点的具体操作为:将步骤S2得到的活性成分相关靶点整理进Excel中,利用Excel表构建健脾祛湿中药活性成分与相
5.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤S4中潜在靶点的检索数据库选自STRING数据库。
6.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤S5采用Meatscape数据库进行靶点的GO和KEGG通路富集分析的具体操作为:将靶点代入生物学信息注释数据库,采用Min Overlap:3;P Value Cutoff:0.01;Min Enrichment:1.5为筛选条件,选取排名前10的条目进行可视化分析。
7.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤S6利用Cytoscape 3.9.1中的插件来进行Hubgene的搜索。
8.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤S7利用步骤S6得到的Hubegne进行Excel表格的推导,得到健脾祛湿中药的核心成分。
...【技术特征摘要】
1.一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,其包括如下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,所述中药系统药理数据库及分析平台选自tcmsp,筛选条件为ob≥30%、dl≥0.18。
3.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤s2中以关键词“茯苓”、“薏苡仁”、“白术”、“苍术”、“白扁豆”、“佩兰”、“砂仁”、“黄芪”、“芡实”和“陈皮”在tcmsp数据库中通过检索得到的活性成分界面;将靶点名校正为基因名称的操作为:在通用蛋白质数据库uniprot中查找蛋白质基因名,在检索区输入蛋白的名称,物种选择为“human”,即得到蛋白质对应的基因名称。
4.根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析健脾祛湿中药核心活性成分的作用机理的方法,其特征在于,步骤s3中活性成分-相关靶点的具体操作为:将步骤s2得到的活性成分相关靶点整理进excel中,利用excel表构建健脾祛湿中药活性成分与相关靶点的关系,并上传至cytos...
【专利技术属性】
技术研发人员:王玉林,耿剑睿,焦信达,胡三川,
申请(专利权)人:大连医科大学,
类型:发明
国别省市:
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