【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于医药化学，具体涉及降解ebna1的protac化合物及其制备方法和应用。
技术介绍
1、ebv是第一个被鉴定为与人类癌症相关的病毒，与多种人类恶性肿瘤有关，包括淋巴增殖性恶性肿瘤(如伯基特淋巴瘤(bl)和霍奇金淋巴瘤(hd))以及上皮肿瘤(包括鼻咽癌(npc)和胃癌)。ebna1是一种ebv编码的核抗原，在ebv基因组的维持和复制以及有丝分裂后的ebv基因组分离中起关键作用，也是唯一在所有类型的ebv感染细胞中表达的ebv蛋白，因此，靶向ebna1治疗将大大提升ebv+肿瘤防治水平。
2、protac(proteolysis-targeting chimeras)是一种利用泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system，ups)对靶蛋白进行降解的药物开发技术。在患者体内，protac的靶蛋白配体和靶蛋白结合，e3泛素连接酶配体和细胞内的e3泛素连接酶的底物结合区结合，从而通过linker把靶蛋白“拉近”到e3泛素连接酶旁边，实现ups系统将靶蛋白降解。
3、ups是人体自身的活性系统，是细胞内蛋白质降解的主要途径，可以参与人体80％的蛋白降解过程。2004年诺贝尔化学奖授予以色列科学家阿龙·西查诺瓦、阿弗拉姆·赫尔什科和美国科学家伊尔温·罗斯，以表彰他们发现了泛素调节的蛋白质降解。利用ups系统降解蛋白主要包括三个步骤：首先，泛素分子(ubiquitin，ub)通过共价结合和e1(泛素激活酶)结合，紧接着通过atp依赖的方式泛素分子被激活；随后，激活的泛素分子被传
4、人类基因组可以编码632个泛素连接酶，这些泛素连接酶可以被分成：ringfinger(really interesting new gene)、hect(homologous to e6-apcarboxylterminus)、rbr(ring-between-ring)和rcr(ringcys-relay)共四个家族，其中ring家族是在人体内最广泛表达的泛素连接酶。目前在药物设计领域经常被用为protac靶点的e3泛素连接酶包括vhl、crbn和iaps，这三种泛素连接酶都属于ring家族。在机制上，hect、rbr和rcr三个家族的成员具有至少一个有催化活性的半胱氨酸，可以和泛素c末端的氨基酸残基通过硫酯键结合。但是ring家族没有催化活性的半胱氨酸，因此需要借助e2酶的作用才能使泛素分子和底物蛋白结合。
5、protac具备三个十分重要的优点：第一，protac分子有高效催化降解功能，很低剂量就可以有很好的药效。比较于一些传统小分子抑制剂或抑制性多肽，protac在较小催化量下就能完成对目标蛋白的降解，所以有较高的安全性。只要在细胞内还存有少量的protac分子，药效就可以持续保持。第二，比较传统小分子和抗体的作用模式(需要抑制剂或单抗要有较高浓度才能够占据靶点的活性位点，阻断下游信号通路的转导)，protac不是影响蛋白的功能，是介导靶蛋白降解，所以不需要作用于蛋白的活性位点以抑制其活性，只需与靶蛋白有一定的结合率就可以。第三，传统小分子药物的耐药性是因为细胞合成了更多的靶蛋白而引起的，而protac是降解目标蛋白发挥作用，protac可以克服此类小分子药物耐药性的问题。尤其值得关注的是，protac非常适用于病毒蛋白的特异性靶向降解。本专利技术中如果利用protac降解ebna1，应该会有很高的特异性和安全性，因为ebna1与体内其它蛋白没有同源关系，所以不会对人体正常组织造成危害。
6、linker是连接protac药物两个活性基团的重要结构，理论上不参与药效学的过程。随着对protac技术研究的不断深入，研究者发现linker结构本身的长度和分子层面结构对protac药物的活性有着非常重要的影响作用。但是目前还没有linker结构设计的通行的规则。
技术实现思路
1、本专利技术旨在至少解决上述现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术提出一种降解ebna1的protac化合物及其制备方法和应用，该protacs化合物能对ebna1产生良好的降解效果，可用于预防和/或治疗癌症。
2、本专利技术的第一方面，提供一种降解ebna1的protac化合物，所述protac化合物为式(i)所示的化合物或其药学上可接受的盐、其异构体、溶剂化物：
3、
4、linker为其中，环a为4-7元杂环基；
5、x1选自n或ch；
6、x2、x3各自独立地选自o、nh、或ch2、
7、m、n各自独立地选自0或1。
8、为了设计能靶向ebna1的protac蛋白降解剂，专利技术人前期分析了现有报道的ebna1抑制剂vk-1760与ebna1蛋白的共晶结构，发现vk-1760的侧链炔基所连接苯环暴露于溶剂区，是连接e3连接酶配体的最合适位点(图2中a、b)。基于vk-1760共晶结构，专利技术人选用了更高活性的ebna1抑制剂vk-1850作为靶蛋白配体，将其与e3连接酶配体沙利度胺(thalidomide)进行适当的linker连接。设计合成了一系列的新型靶向ebna1的prtotac降解剂(图2中b)，如ep-1224及ep-1226(图2中c)。
9、本专利技术在选择e3连接酶时充分考虑到了以下几个方面的要点：(1)选择主要功能或者单一功能是诱导蛋白降解的e3连接酶，对设计的非蛋白相关的功能要引起重视。考虑到e3连接酶在细胞生物代谢过程中的作用，避免因过度激活带来较强的毒理反应的可能性；(2)在开发时要充分考虑e3连接酶的组织和细胞层面的分布，要选择和靶蛋白同时表达的e3连接酶去设计protac，从而高效的实现对靶蛋白的降解；(3)在选择e3连接酶的时候还要考虑到e3连接酶在人体内的表达量、活性以及其活性结构域等方面。因而，在本专利技术中，thalidomide作为crbn配体的一种相较于其他配体有以下几方面的固有优势：(1)特异性强；(2)分子量小以及(3)具有较好的成药性。
10、因此本专利技术选择了最优的thalidomide作为e3连接酶配体进行protacs设计。替换e3连接酶可能导致所设计化合物失去/减弱目标蛋白降解活性以及降低药物的理化性质。
11、目前已知的小分子抑制剂如vk-1727以及vk-0941等的体内外ebna1抑制活性差于vk-1850，因此本专利技术优选vk-1850作为合适的靶蛋白配体。
12、在本专利技术的一些实施方式中，环a与沙利度胺连接。
13、在本专利技术的一些实施方式中，环a为含有一个n原子的4-7元杂环基。其中，环a中的n原子与沙利度胺连接。
14、在本专利技术的一些实施方式中，环a选自本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种降解EBNA1的PROTAC化合物，其特征在于，所述PROTAC化合物为式(I)所示的化合物或其药学上可接受的盐、其异构体、溶剂化物：
2.根据权利要求1所述的PROTAC化合物，其特征在于，环A为含有一个N原子的4-7元杂环基；
3.根据权利要求1所述的PROTAC化合物，其特征在于，(X2)m为CH2或不存在；任选地，(X3)n为O或不存在。
4.根据权利要求1所述的PROTAC化合物，其特征在于，Linker选自
5.根据权利要求1所述的PROTAC化合物，其特征在于，所述PROTAC化合物选自：
6.如权利要求1～5中任一项所述的PROTAC化合物的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：
7.一种药物组合物，含有权利要求1～5中任一项所述的PROTAC化合物或其药学上可接受的盐、其异构体、溶剂化物。
8.根据权利要求7所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物还包括一种或多种第二治疗活性剂；
9.根据权利要求7所述的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物还包括药学上可接
10.如权利要求1～5中任一项所述的PROTAC化合物或其药学上可接受的盐、其异构体、溶剂化物或如权利要求7～9中任一项所述的药物组合物在制备用于预防和/或治疗癌症的药物中的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种降解ebna1的protac化合物，其特征在于，所述protac化合物为式(i)所示的化合物或其药学上可接受的盐、其异构体、溶剂化物：
2.根据权利要求1所述的protac化合物，其特征在于，环a为含有一个n原子的4-7元杂环基；
3.根据权利要求1所述的protac化合物，其特征在于，(x2)m为ch2或不存在；任选地，(x3)n为o或不存在。
4.根据权利要求1所述的protac化合物，其特征在于，linker选自
5.根据权利要求1所述的protac化合物，其特征在于，所述protac化合物选自：
6.如权利要求1～5中...
【专利技术属性】
技术研发人员：李欣，陈建军，刘长林，孙志强，
申请(专利权)人：南方医科大学深圳医院，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。