System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种DM20及PLP1/DM20的表达检测方法技术_技高网

一种DM20及PLP1/DM20的表达检测方法技术

技术编号:40487415 阅读:5 留言:0更新日期:2024-02-26 19:19
本发明专利技术涉及一种DM20及PLP1/DM20的表达检测方法,可以分别针对总的PLP1(两种剪切体可同时检测,PLP1_T)、DM20特异性的剪切体(DM20_S)以及PLP1特异性的剪切体(PLP1_S)进行定量检测,用于分析PLP1不同剪切体的表达关系在神经发育障碍性疾病中指示作用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子检测领域,具体涉及一种dm20及plp1/dm20表达检测方法。


技术介绍

1、proteolipid protein 1(plp1)是构成中枢神经系统中髓鞘结构的跨膜脂蛋白,维持正常髓鞘结构以及轴突完整性。plp1基因经过可变剪接,可产生两种主要蛋白剪切体plp1和dm20,其中dm20与plp1(276个氨基酸)相比,胞内结构区缺少35个氨基酸。plp1可变剪接在中枢神经系统发育过程中受到严谨调控。plp1基因缺陷会导致伴x-染色体的神经紊乱相关的疾病,如佩梅病(pelizaeus–merzbacher disease,pmd)、x连锁痉挛性截瘫2型(x-linked spastic paraplegia type 2,spg2)。plp1基因点突变导致大约20%的pmd/spg2疾病,基因缺失可导致轻微的pmd/spg2疾病,而基因拷贝数变异是最常见的基因缺陷类型,导致大约60%-70%pmd疾病的发生。除此之外,也有研究者发现携带plp1基因重复突变的病人,其体内plp1两种剪切体的比例也发生了改变,这提示plp1/dm20表达调控与疾病的发生有着密切关联。plp1点突变会导致plp1特异性表达量改变而不影响dm20的表达,或者导致两种异构体表达水平均被改变,因此,通过特异性定量plp1和dm20表达水平,跟踪疾病的发展进程,有助于疾病的预测、诊断等。

2、plp1/dm20生物学功能还没有完全阐释清楚,研究发现plp1主要集中在少突胶质细胞中表达,其中dm20在胚胎期表达量较高,成年后少突胶质细胞主要表达plp1,因此,测定plp1/dm20表达量水平可为大脑正常发育的研究提供参考。鉴于plp1在髓鞘再生、退化,神经元轴突退化、轴突转运功能等方面有重要作用,plp1/dm20正确地表达调控能够稳定、保护髓鞘结构、保护神经元、促进轴突正常运输等。

3、目前plp1/dm20表达检测方法主要是通过q-pcr的方法定量plp1特异的剪切体(plp1_s,plp1 specific)和总的plp1(同时检测plp1和dm20两种剪切体),而针对dm20剪切体特异性(dm20_s,dm20 specific)检测的方法很少,文献中多数是通过plp1_s/plp1_t比值间接反映dm20_s表达情况;当然也有文献设计了探针的方法直接检测dm20,但探针方法设计繁琐,价格昂贵。


技术实现思路

1、针对以上诸多不足,本专利技术提供dm20及plp1/dm20表达检测方法,通过直接检测dm20_s表达的普通pcr,能够大幅度降低成本,适用于大规模dm20检测,对于相关疾病诊断、预防以及治疗有重要意义。

2、本专利技术的技术方案通过如下方式实现:提供一种dm20的表达检测方法,所述dm20的表达框包括反映dm20特异性的表达框dm20_s,使用q-pcr检测所述表达框dm20_s的表达情况,所述表达框dm20_s跨越plp1基因可变剪接的位置。

3、优选的,在本专利技术的一个实施例中,所述dm20的表达框由区段1和区段2组成,所述q-pcr检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物和所述下游引物的扩增区域跨越所述区段1和所述区段2的连接处;其中,所述区段1为如图1所示斜线填充的矩形框处,为plp1与dm20上游相同序列,所述区段2为如图1所示点状图案填充的矩形框处,为plp1与dm20下游相同系列。

4、优选的,在本专利技术的一个实施例中,使用的所述上游引物为:

5、gcctgagcgcaacgtttg

6、使用的所述下游引物为:

7、acaccatacattctggcatcag。

8、优选的,在本专利技术的一个实施例中,所述q-pcr检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物或者所述下游引物跨越所述区段1和所述区段2的连接处。

9、优选的,在本专利技术的一个实施例中,所述上游引物跨越所述区段1和所述区段2的连接处;

10、使用的所述上游引物为:

11、gcctgagcgcaacgtttg

12、使用的所述下游引物为:

13、acaccatacattctggcatcag。

14、本专利技术还提供一种plp1/dm20的表达检测方法,使用q-pcr同时检测待检样本中plp1和dm20的表达情况共用同一对上下游引物,qpcr扩增片段优选为plp1_t。

15、优选的,在本专利技术的一个实施例中,使用的所述上游引物为:

16、aactgcctctttcttcttcct

17、使用的所述下游引物为:

18、cagatggtggtcttgtagtcg

19、此外,本专利技术还提供一种plp1特异性表达检测方法,使用q-pcr仅检测待检样本中plp1的表达情况。

20、优选的,在本专利技术的一个实施例中,使用q-pcr仅检测待检样本中plp1的表达情况,针对不同物种选择对应的上下游引物,其中引物对1可用来检测小鼠plp1,引物对2可以用来检测人类plp1。

21、使用的所述上游引物1为:

22、gttccagaggccaacatcaagctc

23、使用的所述下游引物1为:agccatacaacagtcagggcatag。

24、使用的所述上游引物2为:

25、aatggctaggacatcccga

26、使用的所述下游引物2为:

27、ggtccaggtgttgaagtaaatg。

28、有益效果如下:

29、本专利技术提供了一种可以分别针对总的plp1(两种剪切体可同时检测,plp1_t)、dm20特异性的剪切体(dm20_s)以及plp1特异性的剪切体(plp1_s)进行定量检测,用于分析plp1不同剪切体的表达关系在神经发育障碍性疾病中指示作用。

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【技术保护点】

1.一种DM20的表达检测方法,其特征在于,所述DM20的表达框包括反映DM20特异性的表达框DM20_S,使用Q-PCR检测所述表达框DM20_S的表达情况,所述表达框DM20_S跨越PLP1基因可变剪接的位置。

2.根据权利要求1所述的DM20的表达检测方法,其特征在于,所述DM20的表达框由区段1和区段2组成,所述Q-PCR检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物和所述下游引物的扩增区域跨越所述区段1和所述区段2的连接处;其中,所述区段1为PLP1与DM20上游相同序列,所述区段2为PLP1与DM20下游相同系列。

3.根据权利要求1所述的DM20的表达检测方法,其特征在于,使用的所述上游引物为:

4.根据权利要求1所述的DM20的表达检测方法,其特征在于,所述Q-PCR检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物或者所述下游引物跨越所述区段1和所述区段2的连接处。

5.根据权利要求4所述的DM20的表达检测方法,其特征在于,所述上游引物跨越所述区段1和所述区段2的连接处;

6.一种PLP1/DM20的表达检测方法,其特征在于,使用Q-PCR同时检测待检样本中PLP1和DM20的表达情况,共用同一对上下游引物,其扩增区域位于区段1或者区段2;其中,所述区段1为PLP1与DM20上游相同序列,所述区段2为PLP1与DM20下游相同系列。

7.根据权利要求6所述的PLP1/DM20的表达检测方法,其特征在于,使用的所述上游引物为:

8.一种PLP1特异性表达检测方法,其特征在于,使用Q-PCR仅检测待检样本中PLP1的表达情况,所述Q-PCR检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物和所述下游引物至少一条引物在区段3,所述PLP1的表达框由区段1、区段2和区段3组成,扩增片段为PLP1_S;其中,所述区段1为PLP1与DM20上游相同序列,所述区段2为PLP1与DM20下游相同系列,所述区段3为PLP1与DM20差异序列。

9.根据权利要求8所述的PLP1的表达检测方法,其特征在于,使用的所述上游引物1为:

...

【技术特征摘要】

1.一种dm20的表达检测方法,其特征在于,所述dm20的表达框包括反映dm20特异性的表达框dm20_s,使用q-pcr检测所述表达框dm20_s的表达情况,所述表达框dm20_s跨越plp1基因可变剪接的位置。

2.根据权利要求1所述的dm20的表达检测方法,其特征在于,所述dm20的表达框由区段1和区段2组成,所述q-pcr检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物和所述下游引物的扩增区域跨越所述区段1和所述区段2的连接处;其中,所述区段1为plp1与dm20上游相同序列,所述区段2为plp1与dm20下游相同系列。

3.根据权利要求1所述的dm20的表达检测方法,其特征在于,使用的所述上游引物为:

4.根据权利要求1所述的dm20的表达检测方法,其特征在于,所述q-pcr检测使用的扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物或者所述下游引物跨越所述区段1和所述区段2的连接处。

5.根据权利要求4所述的dm20的表达检测方法,其特征在于,所述上游引物跨越所述...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈岳文马双双陈宇易婉盈原琳
申请(专利权)人:香港科技大学深圳研究院
类型:发明
国别省市:

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