【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学领域，具体涉及一个snp分子标记及其在青稞抽穗期性状辅助育种上的应用。
技术介绍
1、青稞(hordeum vulgare linn.var.nudum hook.f.)是禾本科大麦属大麦的变种，成熟时由于内外颖分离而使籽粒裸露，故又称裸大麦，在青藏高原地区统称青稞。青藏高原大片高寒地区能适应种植的作物类型少，而青稞生育期短、耐寒、抗旱，并能有效利用低积温生态条件，在海拔4500m以上的局部高寒地带，它是唯一可以正常成熟的作物。因此，青稞是青藏高原最大的优势特色农作物，也是藏区第一大粮食作物，其种植范围主要分布在青藏高原海拔3000m以上的藏区，每年青稞总播种面积约为24.5万公顷，产量约为100万吨。青藏高原高寒藏区作为青稞主产区，区域极端天气频繁发生，其低温、低热量、短无霜期等不利环境因素影响青稞长势而导致其产量低、品质差。生育期适宜的青稞尤其是早熟青稞可以充分利用有限生长期内的光温资源，避免低温冷害及霜冻危害，是保证高寒区青稞正常成熟而获得稳产、高产、优质青稞的关键途径。因此，培育早熟高产优质青稞是青藏高原高寒藏区青稞品种改良的重要育种目标。
2、青稞抽穗期是决定青稞品种的种植区域范围和季节适应性的重要农艺性状，合适的抽穗期能够保证青稞高效地利用光温资源，有效避免极端环境危害，从而提高青稞的产量和品质。此外，对禾本科植物小麦、水稻、大麦的大量研究和育种实践表明，抽穗期与成熟期呈正相关，因此，青稞抽穗期也可作为青稞成熟早晚的关键标志。
技术实现思路>
1、本专利技术所要解决的技术问题为：提供一个与青稞抽穗期性状紧密关联的snp分子标记及其应用。
2、本专利技术的技术方案为：与青稞抽穗期性状相关snp分子标记，所述snp分子标记位于seq id no.1所示核苷酸序列的第101位，该位点具有t/c多态性，当该位点基因型为tt时，具有相对较长的抽穗期。
3、上述所述的snp分子标记在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。
4、进一步地，所述分子辅助育种的方法为：提取待鉴定青稞基因组dna，以基因组dna为模板，设计基于所述snp分子标记的kasp正向引物f1、f2和通用反向引物r一起进行pcr扩增，利用荧光探针实现snp分型，当该位点基因型为tt时，具有相对较长的抽穗期。
5、进一步地，所述kasp正向引物f1的核苷酸序列如seq id no.2所示，kasp正向引物f2的核苷酸序列如seq id no.3所示，通用反向引物r的核苷酸序列如seq id no.4所示。
6、检测上述所述snp分子标记基因型的物质在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。
7、用于检测与青稞抽穗期性状相关snp分子标记的kasp引物，所述kasp引物由正向引物f1、f2和通用反向引物r构成，正向引物f1的核苷酸序列如seq id no.2所示，正向引物f2的核苷酸序列如seq id no.3所示，通用反向引物r的核苷酸序列如seq id no.4所示。
8、上述所述的kasp引物在检测上述所述的snp分子标记上的应用。
9、与现有技术相比，本专利技术具有以下有益效果：
10、本专利技术的snp分子标记与青稞抽穗期紧密关联，通过对该位点进行基因分型，当该位点基因型为tt时，即可判断该青稞种质具有相对较长的抽穗期，该snp分子标记可用于青稞抽穗期性状的分子辅助育种。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.与青稞抽穗期性状相关SNP分子标记，所述SNP分子标记位于SEQ ID No.1所示核苷酸序列的第101位，该位点具有T/C多态性，当该位点基因型为TT时，具有较长的抽穗期。
2.权利要求1所述的SNP分子标记在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述分子辅助育种的方法为：提取待鉴定青稞基因组DNA，以基因组DNA为模板，设计基于所述SNP分子标记的KASP正向引物F1、F2和通用反向引物R一起进行PCR扩增，利用荧光探针实现SNP分型，当该位点基因型为TT时，具有相对较长的抽穗期。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述KASP正向引物F1的核苷酸序列如SEQID No.2所示，KASP正向引物F2的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，通用反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。
5.检测权利要求1所述SNP分子标记基因型的物质在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。
6.用于检测与青稞抽穗期性状相关SNP分子标记的KASP引物，其特征在于，所述KA
7.权利要求6所述的KASP引物在检测权利要求1所述的SNP分子标记上的应用。
...【技术特征摘要】
1.与青稞抽穗期性状相关snp分子标记，所述snp分子标记位于seq id no.1所示核苷酸序列的第101位，该位点具有t/c多态性，当该位点基因型为tt时，具有较长的抽穗期。
2.权利要求1所述的snp分子标记在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述分子辅助育种的方法为：提取待鉴定青稞基因组dna，以基因组dna为模板，设计基于所述snp分子标记的kasp正向引物f1、f2和通用反向引物r一起进行pcr扩增，利用荧光探针实现snp分型，当该位点基因型为tt时，具有相对较长的抽穗期。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述kasp正向引物f1的核苷酸序...
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