【技术实现步骤摘要】
本申请涉及遗传检测的，具体涉及棉鼠微卫星分子标记及其引物对与应用、棉鼠遗传检测的方法。
技术介绍
1、棉鼠，属于啮齿目、仓鼠科、棉鼠属，共有8个种属。刚毛棉鼠和黄腹棉鼠常被用作实验动物，以刚毛棉鼠更为常用。刚毛棉鼠有25个亚种，主要分布在美国南部、墨西哥和中美洲南方地区及南美洲北部。我国1972年引入棉鼠，并用于丝虫病的研究。
2、棉鼠（cotton rat， sigmodom hispidus）对包括病毒、细菌和寄生虫在内的多种人类病原体易感，尤其对呼吸道病原敏感，是呼吸道疾病研究的重要动物模型。棉鼠被认为是呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus, rsv）治疗方法和候选疫苗临床前评估的“金标准”。棉鼠感染rsv的概率比其它小鼠高100倍甚至以上，棉鼠用于rsv感染研究的一个优势是其肺部解剖学结构与人类相似，其细支气管的内层由纤毛柱状呼吸道上皮细胞（rsv感染的靶点）组成，棉鼠感染rsv后主要集中在鼻上皮、支气管和细支气管的呼吸道上皮中，这种症状与人类患者感染后症状相似度极高。与其他啮齿动物模型相比，棉鼠发生原发性结核分枝杆菌感染后，在组织学上更类似于人类的原发性结核分枝杆菌疾病特征。棉鼠是唯一一个易受呼吸道麻疹病毒（morbillivirus measles virus，mev）感染的啮齿动物，这种感染伴随着有丝分裂原刺激后体内b和t细胞反应的抑制。通过对棉鼠丝虫两性成虫、胚胎及各发育期微丝蚴形态学的研究和了解，为抗丝虫药物研发提供实验基础和动物模型。为
3、标准化的棉鼠不仅可为药学研究和开发提供标准化的实验材料，极大地促进医药的研发，而且对于整合实验动物资源，促进实验动物新资源增量有重要作用。要使培育的棉鼠符合标准，为生命科学和医学研究提供一种新型的合格实验动物，研究建立实验动物棉鼠质量控制标准就显得尤为迫切。但是，国内外尚无棉鼠遗传检测方法的报道。
技术实现思路
1、为了弥补现有技术的不足，本申请提供了棉鼠微卫星分子标记及其引物对与应用、棉鼠遗传检测的方法。
2、第一方面，本申请提供了棉鼠微卫星分子标记（short tandem repeats，str），所述棉鼠微卫星分子标记选自30个str位点的任意一种或多种，所述30个str位点分别为：所述30个str位点分别为：spf104、spf105、spf108、spf109、spf111、spf112、spf001、spf014、spf023、spf025、spf035、spf036、spf037、spf040、spf048、spf049、spf051、spf060、spf064、spf069、spf073、spf076、spf077、spf080、spf084、spf030、spf082、spf072、spf078、spf092；所述30个str位点的核苷酸序列分别对应为seq id no. 1至seq id no. 30所示。
3、本申请基于微卫星位点标记技术，提供了棉鼠微卫星分子标记及其引物对与应用，并将其用于棉鼠遗传检测中。用微卫星标记侧翼序列设计引物进行pcr扩增，由于重复次数的不同形成片段长度不同，经毛细电泳分离，成像表现出不同的电泳带型。由于微卫星具有丰富的多态性、位点数量多并且分布广，检测方法简便、快速、稳定性好和结果可靠等优点，被认为是物种遗传多样性评估的最佳分子标记，已广泛地应用于生物群体遗传特性的检测中。
4、优选地，所述30个str位点的核心序列分别为：
5、所述spf104位点的核心序列为aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa；
6、所述spf105位点的核心序列为tttttttttttttttttttttttttttt；
7、所述spf108位点的核心序列为aaaaaaaaaaaaaa；
8、所述spf109位点的核心序列为ggggggggggggggggggg；
9、所述spf111位点的核心序列为ccccccccccccc；
10、所述spf112位点的核心序列为ccccccccccc；
11、所述spf001位点的核心序列为tctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctc；
12、所述spf014位点的核心序列为tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg；
13、所述spf023位点的核心序列为gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt；
14、所述spf025位点的核心序列为acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac；
15、所述spf035位点的核心序列为cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca；
16、所述spf036位点的核心序列为acacacacacacacacacacacacacacacacacaaacacac；
17、所述spf037位点的核心序列为gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt；
18、所述spf040位点的核心序列为agagagagagagagagagagagagagagag；
19、所述spf048位点的核心序列为gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt；
20、所述spf049位点的核心序列为acacacacacacacacacacacacacacacacac；
21、所述spf051位点的核心序列为gagagagagagagagagagagagagagagagagaga；
22、所述spf060位点的核心序列为gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaagaga；
23、所述spf064位点的核心序列为tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg；
24、所述spf069位点的核心序列为acacacacacacacacacacac；
25、所述spf073位点的核心序列为cacacacacgcgcgcacacacacacacacacacacacacacacacacacaca；
26、所述spf076位点的核心序列为gtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt；<本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.棉鼠微卫星分子标记，其特征在于，所述棉鼠微卫星分子标记为27个STR位点：所述27个STR位点分别为：SPF104、SPF108、SPF109、SPF111、SPF112、SPF001、SPF014、SPF025、SPF035、SPF036、SPF037、SPF040、SPF048、SPF049、SPF051、SPF064、SPF069、SPF073、SPF076、SPF077、SPF080、SPF084、SPF030、SPF082、SPF072、SPF078、SPF092；所述27个STR位点的核苷酸序列分别对应为SEQ ID NO. 1、SEQ ID NO. 3-8、SEQ ID NO. 10-17、SEQ ID NO. 19-30所示。
2.根据权利要求1所述的棉鼠微卫星分子标记，其特征在于，所述27个STR位点的核心序列分别为：
3.用于PCR扩增权利要求1所述的棉鼠微卫星分子标记的引物对的组合，其特征在于，
4.根据权利要求3所述的棉鼠微卫星分子标记的引物对的组合，其特征在于，所述的引物对的上游引物5’端设带有荧光标记。
<...【技术特征摘要】
1.棉鼠微卫星分子标记，其特征在于，所述棉鼠微卫星分子标记为27个str位点：所述27个str位点分别为：spf104、spf108、spf109、spf111、spf112、spf001、spf014、spf025、spf035、spf036、spf037、spf040、spf048、spf049、spf051、spf064、spf069、spf073、spf076、spf077、spf080、spf084、spf030、spf082、spf072、spf078、spf092；所述27个str位点的核苷酸序列分别对应为seq id no. 1、seq id no. 3-8、seq id no. 10-17、seq id no. 19-30所示。
2.根据权利要求1所述的棉鼠微卫星分子标记，其特征在于，所述27个str位点的核心序列分别为：
3.用于pcr扩增权利要求1所述的...
【专利技术属性】
技术研发人员：王妍，张晓晴，张桐，陈红，谢飞，张静，薛林，朱明强，战大伟，
申请(专利权)人：斯贝福北京生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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