非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法及系统技术方案

本发明专利技术涉及一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法及系统，包括：(1)数据准备：通过微生物组学数据，得到细菌的相对丰度、样本的分组信息；(2)构建微生物共生网络；(3)分析微生物共生网络；(4)挖掘功能模块。本发明专利技术将网络分析与宏基因组测序技术相结合，对于发现微生物群落的构建过程和群落的稳定维持中所必须的微生物关系，推断各种相互关系对宿主健康影响等提供了丰富的研究手段。网络分析能够揭示菌群中非随机的物种共发生模式，使物种间的直接互作或生态位共享特征得到较好的重现，对于理解微生物群落的组建机制、生态系统的功能以及识别群落中的关键物种至关重要。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法及系统，属于微生物测定和检验的。

技术介绍

1、人体微生物和环境微生物分别在维持人体健康和生物地球化学循环中起着至关重要的作用。微生物群落是许多微生物的集合体，其中绝大部分的微生物(超过99％)是不可通过传统培养方法进行培养的。为了充分揭示微生物群落中微生物的作用，高通量测序技术被用来获取微生物群落的序列信息。目前已经建立了基于微生物宏基因组数据的统计分析流程，实现了对微生物组大数据快速有效的处理，解析出微生物群落的物种组成和功能组成以及不同组之间的差异菌。

2、在自然环境中，微生物并不是以分离的个体形式存在，而是通过直接或间接的相互作用形成复杂的共发生网络。微生物之间的相互作用包括互利共生、共栖、寄生、捕食、偏害共栖和竞争等类型，相互作用会对参与者产生正向、负向和中性三种影响。同样地，环境影响群落的组成，因此微生物-环境之间也存在着密切的交互。微生物体积小、数量大、代谢旺盛、繁殖迅速，造成微生物群落在组成和功能上极高的复杂度，然而，在生态系统中直接探究这些不同的相互作用类型非本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，包括步骤如下：

2.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，步骤(2)中，细菌与细菌的相互作用关系是指细菌与细菌的显著性相关性关系，边的权重是指两种细菌的spearman相关性系数；

3.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，步骤3.1.1中，通过比较微生物共生网络全局指标，来评估各组样本菌群之间相互作用关系的差异，包括：

4.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功...

【技术特征摘要】

1.一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，包括步骤如下：

2.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，步骤(2)中，细菌与细菌的相互作用关系是指细菌与细菌的显著性相关性关系，边的权重是指两种细菌的spearman相关性系数；

3.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，步骤3.1.1中，通过比较微生物共生网络全局指标，来评估各组样本菌群之间相互作用关系的差异，包括：

4.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特征在于，步骤3.1.2中，

5.根据权利要求1所述的一种非对照人群依赖的微生物网络分析的功能模块的挖掘方法，其特...

【专利技术属性】
技术研发人员：冯强，王怡华，侯庆振，
申请(专利权)人：山东大学，
类型：发明
国别省市：