【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
技术实现思路
1、本专利技术的专利技术人已经开发了一些方法和组件,可以用于显著降低将预先确定的预测关系、决策面或差异靶标寡核苷酸模式(例如基因表达模式与特定状态之间的基因调控特征)转换为有用的诊断或预测结果的复杂性。
2、本文描述的方法使用分析的分子本身来反映复杂数学和人工智能(当前用于分析在例如医学诊断中常规获得的标准靶寡核苷酸模式,例如表达数据)。
3、所公开的方法易于使用,不需要特别专业的仪器,并且样品制备标准。一旦通过常规程序优化了必要的组件,实际上将这些方法付诸实践(例如在诊断/预测中)就非常简单,并且在一些实施例中需要简单的多重pcr扩增反应和两个荧光团的读数。这与目前的方法相反,其需要例如使用多个荧光团扩增一些rna物种,确定每个荧光团的数量,然后将这些数据输入到一个复杂的生物信息学系统,该系统比较每个rna物种的相对水平以确定“状态”。例如,如果预测关系、决策面或差异靶标寡核苷酸模式(如差异基因调控特征)是基于10个基因的相对表达,目前要么需要分别确
...【技术保护点】
1.一种扩增样品中至少第一和至少第二靶标多核苷酸的方法,其中所述方法包括:提供:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法包括提供第二引物,任选地其中;
3.根据权利要求1或2中任一项所述的方法,其中所述第一靶标多核苷酸的扩增动力学与所述第一调整竞争多核苷酸的扩增动力学不同,或与所述第一调整竞争多核苷酸的扩增动力学基本不相似。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中当靶标多核苷酸的初始数量与引物延伸之前的调整竞争多核苷酸的数量相同或基本相同时,所产生的靶标产物多核苷酸的数量不同于所产生的调整竞争产物多核苷酸的数量。
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种扩增样品中至少第一和至少第二靶标多核苷酸的方法,其中所述方法包括:提供:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法包括提供第二引物,任选地其中;
3.根据权利要求1或2中任一项所述的方法,其中所述第一靶标多核苷酸的扩增动力学与所述第一调整竞争多核苷酸的扩增动力学不同,或与所述第一调整竞争多核苷酸的扩增动力学基本不相似。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中当靶标多核苷酸的初始数量与引物延伸之前的调整竞争多核苷酸的数量相同或基本相同时,所产生的靶标产物多核苷酸的数量不同于所产生的调整竞争产物多核苷酸的数量。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中:
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述第一靶标多核苷酸的扩增速率和所述第二靶标多核苷酸的扩增速率匹配预定义的权重。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中待扩增的所述第一调整竞争多核苷酸的序列与待扩增的所述第一靶标多核苷酸的序列共享少于95%、90%、88%、85%、80%、75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%的序列同一性;并且任选地其中
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中:
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,其中检测出一个或多个靶标产物,任选地一个或多个靶标pcr产物;和一个或多个调整竞争产物,任选地一个或多个竞争多核苷酸pcr产物,任选地其中
10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法,其中所述方法包括提供一个或多个探针组,其中每个探针组包含至少一个标记有第一标签的探针多核苷酸和至少一个标记有第二标签的探针多核苷酸,
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述至少一个标记有所述第一标签的探针能够与所述第一靶标产物杂交;并且所述至少一个标记有第二标签的探针能够与所述第一调整竞争产物杂交。
12.根据权利要求10或11中任一项所述的方法,其中所述至少一个标记有所述第一标签的探针能够与所述第一调整竞争产物杂交;和
13.根据权利要求10至12中任一项所述的方法,其中在单个探针组中存在:
14.根据权利要求10至13中任一项所述的方法,其中所述方法包括提供至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95个或至少100个不同的探针组,
15.根据权利要求10至14中任一项所述的方法,其中存在于所述探针上的唯一标签是所述第一标签和所述第二标签。
16.根据权利要求10至15中任一项所述的方法,其中所述第一和第二标签是荧光团,
17.根据权利要求10至16中任一项所述的方法,其中
18.根据权利要求10至17中任一项所述的方法,其中所述
19.根据权利要求10至18中任一项所述的方法,其中在扩增之后确定由所述第一探针检测到的所述产物的量和由所述第二探针检测到的所述产物的量。
20.根据权利要求19所述的方法,其中将每个探针的相对量与标准曲线进行比较以确定一种或多种状态的相对概率。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的方法,其中所述方法包括通过获取所使用的所有荧光团的单一读数来检测所有扩增产物的相对丰度。
22....
【专利技术属性】
技术研发人员:G·格尔茨,M·斯蒂文斯,
申请(专利权)人:帝国理工创新有限公司,
类型:发明
国别省市:
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