经工程化的益生菌组合物及其用途制造技术

本文提供了包含经工程化的微生物的组合物和方法以及它们在胃肠道中局部降解抗生素以防止或限制有益菌群死亡的用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本专利技术的领域涉及益生菌组合物及其在正在用抗生素治疗或被指示用抗生素治疗的受试者中促进健康肠道微生物群(gut microbiota)的用途。

技术介绍

1、抗生素是拯救生命的药物，但它们的使用对健康的肠道微生物群产生负面影响。最值得注意的是，住院患者中的抗生素使用代表了感染艰难梭菌(clostridiumdifficile)的最高风险因素。

2、艰难梭菌是医疗机构中腹泻的主要原因，占抗生素相关腹泻的10％-20％。艰难梭菌感染的死亡率估计为1％-2.5％，在美国每年导致15,000-30,000例死亡(ananthakrishnan,a.n.“clostridium difficile infection:epidemiology,riskfactors and management,”nat rev gastroenterol hapatol,8:17-26(2011)；parkes,g.c.等，“the mechanisms and efficacy of probiotics in the prevention ofclostridi本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种组合物，所述组合物包含经工程化以降解哺乳动物肠道中的抗生素的微生物，其中，所述微生物还经工程化以降低其经工程化的抗生素降解能力的水平传播的可能性。

2.如权利要求1所述的组合物，其中，所述微生物的经工程化的抗生素降解能力包括降解所述抗生素的酶活性的表达和分泌。

3.如权利要求2所述的组合物，其中，所述酶在分离的第一核酸构建体和第二核酸构建体上以第一部分和第二部分编码，其中，两个构建体单独都不编码具有活性的抗生素降解酶，并且其中，需要所述酶的两个部分来提供抗生素降解活性，从而降低经工程化的抗生素降解活性的水平传播的可能性。

4.如权利要求1-3中...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种组合物，所述组合物包含经工程化以降解哺乳动物肠道中的抗生素的微生物，其中，所述微生物还经工程化以降低其经工程化的抗生素降解能力的水平传播的可能性。

2.如权利要求1所述的组合物，其中，所述微生物的经工程化的抗生素降解能力包括降解所述抗生素的酶活性的表达和分泌。

3.如权利要求2所述的组合物，其中，所述酶在分离的第一核酸构建体和第二核酸构建体上以第一部分和第二部分编码，其中，两个构建体单独都不编码具有活性的抗生素降解酶，并且其中，需要所述酶的两个部分来提供抗生素降解活性，从而降低经工程化的抗生素降解活性的水平传播的可能性。

4.如权利要求1-3中任一项所述的组合物，其中，所述微生物是细菌或酵母。

5.如权利要求3或4所述的组合物，其中，所述第一构建体和第二构建体将所述酶的第一部分和第二部分编码为各自包含特异性结合对的分别成员的第一融合多肽和第二融合多肽。

6.如权利要求5所述的组合物，其中，所述第一融合多肽和第二融合多肽由所述微生物分泌到其周围环境中。

7.如权利要求5或6所述的组合物，其中，所述第一融合多肽和第二融合多肽经由所述特异性结合对的分别成员的结合促进所述酶的第一部分和第二部分的物理相互作用以及抗生素降解酶促活性的重构。

8.如权利要求5-7中任一项所述的组合物，其中，所述特异性结合对的分别成员促进所述第一融合多肽和第二融合多肽之间的共价键合。

9.如权利要求1-8中任一项所述的组合物，其中，所述抗生素降解活性包括β-内酰胺酶酶活性、金黄色葡萄球菌mph(c)基因酶活性、金黄色葡萄球菌林可酰胺核苷酸转移酶lnu(a)基因酶活性、屎肠球菌lnu(b)基因酶活性或大肠埃希氏菌ereb基因酶活性。

10.如权利要求9所述的组合物，其中，所述β-内酰胺酶是tem1β-内酰胺酶。

11.如权利要求10所述的组合物，其中，所述tem1β-内酰胺酶在分离的第一核酸构建体和第二核酸构建体上以第一部分和第二部分编码，其中，所述第一核酸构建体编码β-内酰胺酶片段(blf)1，包含seq id no:1或seq id no:3；并且，所述第二核酸构建体编码blf2，包含seq id no:5或seq id no:7。

12.如权利要求3-11中任一项所述的组合物，其中，所述第一构建体和第二构建体分别将所述酶的第一部分和第二部分编码为第一融合多肽和第二融合多肽，所述融合多肽各自包含spytag/spycatcher特异性结合对的分别成员。

13.如权利要求1-12中任一项所述的组合物，其中，所述微生物是经工程化的公认安全(gras)微生物。

14.如权利要求1-13中任一项所述的组合物，其中，所述微生物是经工程化的乳酸菌。

15.如权利要求1-14中任一项所述的组合物，其中，所述微生物是经工程化的乳酸乳球菌。

16.如权利要求1-15中任一项所述的组合物，所述组合物处于用于口服递送的剂型。

17.活的冻干微生物，所述微生物如权利要求1-16中任一项所述。

18.如权利要求1-17中任一项所述的组合物，所述组合物被配制为丸剂、片剂或胶囊剂。

19.一种治疗细菌感染的方法，所述方法包括给予抗生素和权利要求1-18中任一项所述的组合物。

20.如权利要求19所述的方法，其中，胃肠外递送或口服递送所述抗生素。

21.如权利要求19或20所述的方法，其中，静脉内递送所述抗生素。

22.如权利要求19-21中任一项所述的方法，其中，在给予所述抗生素之前给予所述组合物。

23.如权利要求19-22中任一项所述的方法，其中，胃肠外递送所述抗生素，并且在递送所述抗生素之前或在递送所述抗生素的同时给予所述组合物。

24.如权利要求19-23中任一项所述的方法，其中，口服给予所述组合物。

25.如权利要求19或20所述的方法，其中，在口服给予所述抗生素之前口服给予所述组合物。

26.如权利要求19-25中任一项所述的方法，其中，所述抗生素为β-内酰胺类抗生素，并且所述组合物中的微生物经工程化以表达β-内酰胺酶。

27.如权利要求19-26中任一项所述的方法，其中，所述抗生素选自青霉素、青霉素g、青霉素v、苯唑西林、萘夫西林、双氯西林、阿莫西林、氨苄青霉素、替卡西林、哌拉西林、头孢唑...

【专利技术属性】
技术研发人员：安德烈斯·费尔南多·库比略斯，詹姆斯·J·柯林斯，
申请(专利权)人：哈佛大学校长及研究员协会，
类型：发明
国别省市：