【技术实现步骤摘要】
本申请属于基因检测领域，具体涉及一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法。
技术介绍
1、宏基因组测序(mngs)在感染性疾病诊断中发挥着重要作用，依靠生物信息学手段对mngs微生物进行筛选、过滤、比对、物种注释等系统的生物信息学分析，对临床感染疾病的精准诊疗具有重要的指导意义。在分子生物学实验中，基因完整性是极重要的质控指标之一，例如，全基因组测序、全外显子组测序和目标区域扩增子测序等，都要求基因完整，否则实验会面临结果变差甚至失败的风险。然而，现有的基因完整性检测方法普遍存在成本高、效率低等问题。
技术实现思路
1、为了解决上述技术问题，本申请提供了一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法。
2、包括以下步骤：
3、采集病原微生物的物种信息，其包括以细菌、真菌、寄生虫、病毒为搜索关键字，通过网络爬虫技术从病原微生物来源网站初步采集临床中病原微生物的物种信息，该物种信息包括该物种的中文名称和英文名称；
4、对病原微生物的物种信息进行校正；
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【技术保护点】
1.一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述对病原微生物的物种信息进行校正的过程为：
3.根据权利要求2所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述检索病原微生物基因组的过程为：
4.根据权利要求3所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述对细菌基因组进行过滤的过程为：
5.根据权利要求4所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述统计过滤之后的细菌...
【技术特征摘要】
1.一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述对病原微生物的物种信息进行校正的过程为：
3.根据权利要求2所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述检索病原微生物基因组的过程为：
4.根据权利要求3所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述对细菌基因组进行过滤的过程为：
5.根据权利要求4所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述统计过滤之后的细菌基因组的数目包括统计每一个物种的全部基因组的数目以及各物种中四个组装水平下基因组的数目，具体为：
6.根据权利要求5所述的一种临床病原微生物宏基因组完整性检测方法，其特征在于，所述按照优先级对原核生物的参考基因组进行筛选过滤的过程为：
7.根据权利要求...
【专利技术属性】
技术研发人员：李瑞琳，盖伟，拔素苹，关尚京，郑亚风，
申请(专利权)人：北京微岩医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：
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