一种与牦牛乳品质性状相关的制造技术

本发明专利技术属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种与牦牛乳品质性状相关的

【技术实现步骤摘要】
一种与牦牛乳品质性状相关的SNP位点及应用


[0001]本专利技术属于分子生物学检测
，具体涉及一种与牦牛乳品质性状相关的
SNP
位点及应用
。

技术介绍

[0002]牦牛主要集中在青藏高原及周围高寒地区，是唯一能在高寒地区利用牧草资源产生经济效益的牛种，为当地牧民提供了绝大部分的生产生活资料，对藏区的经济发展及牧民生活水平提升具有重要意义
。
其牦牛乳是一种天然的“浓缩乳”，在化学特性上其干物质
、
乳脂肪
、
乳蛋白等营养成分含量均比其他普通乳高
。
因其营养丰富，牦牛乳也成为各种奶制品生产的原料，乳制品黄油与奶酪是藏区牧民维生素和主要营养物质的重要来源
。
近年来牦牛乳的产量逐年上升，人们对牦牛乳的关注也明显增加，但目前对牦牛乳的研究还处于初步阶段
。
[0003]单核苷酸多态性
(Single nucleotide polymorphism,SNP)
即为在全基因组序列上某一单个核苷酸的突变造成的
DNA
序列的变异
。
这种变异主要有单个基因的转换
、
颠换
、
缺失和插入这四类，但以转换
(Transition)
和颠换
(Transversion)
居多
。
转换是指嘌呤碱基
(A
与
G)、
嘧啶碱基
(Tr/>与
C)
之间相互替代，颠换则是嘌呤和嘧啶之间的替换
。
在编码区出现的
SNP
会影响基因的功能导致生物性状的改变，因此可以作为与某些性状相关的生物标记
。
因其具有高密度
、
稳定遗传以及可自动化分析等特点，可用于标记辅助育种
、
连锁分析和生物多样性的研究
。
[0004]CCSER1(coiled
‑
coil serine rich protein 1)
基因也被命名为
FAM190A(family with sequence similarity 190
，
member A)
，作为一种调节蛋白基因
。
作为正常有丝分裂的调节或结构成分，当
CCSER1
基因表达量发生变化时，会引起染色体的不稳定
。
此外，牦牛
CCSER1
基因是位于第6号染色体上的重要功能基因之一
。
国内外对
CCSER1
基因的研究较少，对
CCSER1
的功能及作用机制的认识都还处在初步阶段
。

技术实现思路

[0005]基于上述技术问题，本专利技术的目的在于提供一种与牦牛乳品质性状相关的
SNP
分子标记，具有快速准确，检测成本低的特点
。
具体包括以下内容：
[0006]第一方面，本专利技术提供了一种与牦牛乳品质性状相关的
SNP
分子标记，所述
SNP
分子标记位于牦牛参考基因组
Bosgu_v3.0
版本
European Nucleotide Archive
登录号为
GCA_005887515.1
的第6号染色体的第
91449783
位，突变碱基为
C
或
G。
[0007]第二方面，本专利技术提供了一种检测与牦牛乳品质性状相关的
SNP
分子标记的试剂在检测牦牛乳品质性状中的应用，所述
SNP
分子标记位于牦牛参考基因组
Bosgu_v3.0
版本
European Nucleotide Archive
登录号为
GCA_005887515.1
的第6号染色体的第
91449783
位，突变碱基为
C
或
G。
[0008]优选地，根据所述
SNP
分子标记的突变碱基，将牦牛个体基因型分为
CC、CG
和
GG
；所
Nucleotide Archive
登录号为
GCA_005887515.1
的第6号染色体的第
91449783
位，突变碱基为
C
或
G
；
[0031]根据基因分型检测，将牦牛个体基因型分为
CC、CG
和
GG
，所述基因型
CG
或者
GG
的牦牛个体的乳酪蛋白和蛋白质显著高于基因型
CC
的个体
(p<0.05)
，且所述基因型
CG
的牦牛个体的非脂乳固体和酸度显著高于基因型
CC
的个体
(p<0.05)
；
[0032]通过
PCR
与基因测序法可快速鉴定对应性状，能够用于牦牛分子标记辅助育种，且不受牦牛品种
、
年龄的限制，因此，生产中可优先选择该位点基因型为
CG
或
GG
型个体作为亲本进行规模养殖，大大加快对牦牛乳品质性状选择的准确性和有效性，提高牦牛养殖的经济效益
。
附图说明
[0033]图1为本专利技术实施例中三种基因型测序峰图
。
具体实施方式
[0034]本专利技术通过对牦牛
CCSER1
基因片段上，连续设计多对引物对牦牛
DNA
进行
PCR
扩增，对其进行基因测序，其中一对引物
(SEQ ID NO.2
和
SEQ ID NO.3)
扩增的目的片段
(
序列为
SEQ ID NO.1)
进行基因型分析时发现了一个
SNP
位点，共有三种3种基因型，通过
MEGA 11.0
和
BioEdit
软件分析，筛查出一个
SNP
位点位于序列
SEQ ID NO.1
的片段的第
202
碱基处
。
再通过
SPSS25.0
软件分析牦牛个体的突变位点的基因型与乳品质性状的相关性，发现基因型
CG
或者
GG
的牦牛个体的乳酪蛋白和蛋白质显著高于基因型
CC
的个体
(p<0.05)
，基因型
CG
的牦牛个体的非脂乳固体和酸度显著高于基因型
CC...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种与牦牛乳品质性状相关的
SNP
分子标记，其特征在于，所述
SNP
分子标记位于牦牛参考基因组
Bosgu_v3.0
版本
European Nucleotide Archive
登录号为
GCA_005887515.1
的第6号染色体的第
91449783
位，突变碱基为
C
或
G。2.
检测与牦牛乳品质性状相关的
SNP
分子标记的试剂在检测牦牛乳品质性状中的应用，其特征在于，所述
SNP
分子标记位于牦牛参考基因组
Bosgu_v3.0
版本
European Nucleotide Archive
登录号为
GCA_005887515.1
的第6号染色体的第
91449783
位，突变碱基为
C
或
G。3.
检测与牦牛乳品质性状相关的
SNP
分子标记的试剂在牦牛乳品质性状早期选育中的应用，其特征在于，所述
SNP
分子标记位于牦牛参考基因组
Bosgu_v3.0
版本
European Nucleotide Archive
登录号为
GCA_005887515.1
的第6号染色体的第
91449783
位，突变碱基为
C
或
G。4.
如权利2或3所述的应用，其特征在于，根据所述
SNP
分子标记的突变碱基，将牦牛个体基因型分为
CC、CG
和
GG
；所述基因型
CG
或
GG
牦牛个体的乳酪蛋白和蛋白质显著高于基因型
CC
；所述基因型
CG
牦牛个体的非脂乳固体和酸度显著高于基因型
CC。5.
如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述试剂包括用于扩增含有所述
SNP
分子标记的核苷酸序列的引物对
。6.
如权利要求5所述的应用，其特征在于，所述含有
SNP
分子标记的核苷酸序列如
SEQ ID NO.1
所示，所述的
SNP
分子标记位于第
202

【专利技术属性】
技术研发人员：梁春年，杨国武，吴晓云，马晓明，喇永富，阎萍，杨树猛，包鹏甲，郭宪，褚敏，丁考仁青，葛倩芸，裴杰，熊琳，
申请(专利权)人：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，
类型：发明
国别省市：