一种鉴定玫红花黄芩的制造技术

本发明专利技术公开了一种鉴定玫红花黄芩的

【技术实现步骤摘要】
ID NO.5
所示的正向引物和核苷酸序列如
SEQ ID NO.6
所示的反向引物
。
[0009]本专利技术还提供上述的
InDel
分子标记或引物对在制备鉴定玫红花黄芩的产品中的应用
。
[0010]进一步地，所述产品为试剂或试剂盒
。
[0011]本专利技术还提供一种鉴定玫红花黄芩的产品，包括上述的引物对
。
[0012]进一步地，所述产品为试剂或试剂盒
。
[0013]本专利技术还提供上述的
InDel
分子标记
、
引物对或产品在鉴定玫红花黄芩中的应用
。
[0014]本专利技术还提供一种鉴定玫红花黄芩的方法，包括以下步骤：
[0015]提取得到待检黄芩的基因组
DNA
；
[0016]以所述基因组
DNA
为模板，利用上述的引物对进行
PCR
扩增，当扩增得到核苷酸序列如
SEQ ID NO.7
所示的片段时，所述待检黄芩即为玫红花黄芩
。
[0017]进一步地，所述
PCR
扩增的反应体系为：
DNA
模板1μ
L、
正向引物1μ
L、
反向引物1μ
L、2
×
Premix Taq 10
μ
L
和
ddH2O 7
μ
L。
[0018]进一步地，所述
PCR
扩增的反应条件为
95℃
预变性
3min
；
95℃30s
，
60℃30s
，
72℃30s
，
35
个循环；
72℃
延伸
5min。
[0019]本专利技术公开了以下技术效果：
[0020]本专利技术提供了一种可以鉴定玫红花黄芩的
InDel
分子标记
SbFIn1
，利用该
InDel
分子标记，可以通过检测黄芩植株的基因组
DNA
在黄芩全生长期确定黄芩的花色，不受花期限制
。
[0021]本专利技术还提供一种利用
InDel
分子标记
SbFIn1
鉴定玫红花黄芩的检测方法，其是一种简捷
、
准确
、
可大批量鉴定玫红花黄芩的方法，该方法技术要求简单，对仪器操作要求较低，常规分子实验室的常规仪器即可操作，且方法精准
、
高效
。
[0022]本专利技术为玫红花黄芩种质鉴别提供了依据，对于黄芩的杂交育种和品质改良具有重要的应用价值
。
附图说明
[0023]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图
。
[0024]图1为利用比较转录组结合代谢组对控制玫红花黄芩的基因进行分析的结果；
[0025]图2为玫红花和蓝紫花黄芩
SbF3'5'H
基因的序列对比结果，其中方框内表示基因
InDel
位点特异性；
[0026]图3为不同株系蓝紫花和玫红花黄芩
SbF3'5'H
基因的
InDel
位点差异，其中方框内表示基因
InDel
位点特异性；
[0027]图4为利用分子标记
SbFIn1
高通量鉴别玫红花黄芩和蓝紫花黄芩的结果
。
具体实施方式
[0028]现详细说明本专利技术的多种示例性实施方式，该详细说明不应认为是对本专利技术的限
制，而应理解为是对本专利技术的某些方面
、
特性和实施方案的更详细的描述
。
[0029]应理解本专利技术中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式，并非用于限制本专利技术
。
另外，对于本专利技术中的数值范围，应理解为还具体公开了该范围的上限和下限之间的每个中间值
。
在任何陈述值或陈述范围内的中间值，以及任何其他陈述值或在所述范围内的中间值之间的每个较小的范围也包括在本专利技术内
。
这些较小范围的上限和下限可独立地包括或排除在范围内
。
[0030]除非另有说明，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本专利技术所述领域的常规技术人员通常理解的相同含义
。
虽然本专利技术仅描述了优选的方法和材料，但是在本专利技术的实施或测试中也可以使用与本文所述相似或等同的任何方法和材料
。
本说明书中提到的所有文献通过引用并入，用以公开和描述与所述文献相关的方法和
/
或材料
。
在与任何并入的文献冲突时，以本说明书的内容为准
。
[0031]在不背离本专利技术的范围或精神的情况下，可对本专利技术说明书的具体实施方式做多种改进和变化，这对本领域技术人员而言是显而易见的
。
由本专利技术的说明书得到的其他实施方式对技术人员而言是显而易见得的
。
本专利技术说明书和实施例仅是示例性的
。
[0032]关于本文中所使用的“包含”、“包括”、“具有”、“含有”等等，均为开放性的用语，即意指包含但不限于
。
[0033]实施例1控制黄芩玫红花色基因的确定
[0034]为了确定控制黄芩玫红花色的基因，专利技术人前期利用比较转录组结合靶向代谢组学技术对黄芩蓝紫花和玫红花的花青素组成及基因表达差异进行检测及数据分析
。
发现蓝紫花中既含有呈现蓝紫色的飞燕草素类花青素，又有呈现红色的矢车菊素类花青素；而玫红花中仅含有呈现红色的矢车菊素类花青素，缺少飞燕草素类花青素
。
基因表达分析显示，玫红花中
SbF3'5'H
基因的表达量显著低于蓝紫花
(
图
1)。
[0035]实施例
2SbF3'5'H
基因编码区序列克隆
、
比对，特异性
InDel
位点分析
[0036]分别提取蓝紫花和玫红花黄芩花
RNA
，反转录为
cDNA
，根据转录组测序提供的
SbF3'5'H
基因序列设计基因扩增引物
(
引物序列由青岛派森诺生物科技有限公司合成
)
，其上
、
下游引物序列如下：
[0037]F35HF:5'
‑
ATGAATGTTTTTTTAATGATTAGCG
‑
3'(SEQ I本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种鉴定玫红花黄芩的
InDel
分子标记，其特征在于，所述
InDel
分子标记的核苷酸序列如
SEQ ID NO.7
所示
。2.
一种扩增权利要求1所述的
InDel
分子标记的引物对，其特征在于，包括核苷酸序列如
SEQ ID NO.5
所示的正向引物和核苷酸序列如
SEQ ID NO.6
所示的反向引物
。3.
一种如权利要求1所述的
InDel
分子标记或权利要求2所述的引物对在制备鉴定玫红花黄芩的产品中的应用
。4.
根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述产品为试剂或试剂盒
。5.
一种鉴定玫红花黄芩的产品，其特征在于，包括权利要求2所述的引物对
。6.
根据权利要求5所述的产品，其特征在于，所述产品为试剂或试剂盒
。7.
一种如权利要求1所述的
InDel
分子标记
、
权利要求2所述的引物对或权利要求5或6所述的产品在鉴定玫红花黄芩中的应用
。8.
一种鉴定玫红花黄芩的...

【专利技术属性】
技术研发人员：郭凤丹，林慧彬，王平，管仁伟，尹鑫，
申请(专利权)人：山东省中医药研究院，
类型：发明
国别省市：