【技术实现步骤摘要】
基于高通量扩增子测序的革兰氏阴性细菌检测的组合物
[0001]本专利技术属于生物检测领域
。
具体地,涉及高通量扩增子测序检测的组合物,更具体地,涉及革兰氏阴性细菌的高通量扩增子测序检测的组合物
。
技术介绍
[0002]宏基因组学
(Metagenomics)
又叫微生物环境基因组学
、
元基因组学
。
它通过直接从环境样品中提取全部微生物的
DNA
,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能
。
宏基因组学在微生物组学的基础上发展而来的,不依赖于微生物的分离培养,可用于研究难培养或不可培养的微生物中的天然产物和处于沉默状态的天然产物,极大地提高了宏基因组样品中微生物资源的利用程度
。
通过对宏基因组样品进行深度测序分析,可以揭示或者评估环境中真实的物种多样性和遗传多样性,也可用于新型微生物活性物质
(
或新基因
)
的发
【技术保护点】
【技术特征摘要】 【专利技术属性】
1.
一种基于高通量扩增子测序检测革兰氏阴性细菌的组合物,包括如下所示引物组中的至少4个靶标:如
SEQ ID NO.1
~4所示的扩增鲍曼不动杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.5
~
14
所示的扩增产气克雷伯菌的引物组;如
SEQ ID NO.15
~
18
所示的扩增产酸克雷伯菌的引物组;如
SEQ ID NO.19
~
24
所示的扩增大肠埃希菌的引物组;如
SEQ ID NO.25
~
30
所示的扩增肺炎克雷伯菌的引物组;如
SEQ ID NO.31
~
38
所示的扩增副流感嗜血杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.39
~
42
所示的扩增卡他莫拉菌的引物组;如
SEQ ID NO.43
~
50
所示的扩增流感嗜血杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.51
~
54
所示的扩增摩根摩根菌的引物组;如
SEQ ID NO.55
~
58
所示的扩增脑膜脓毒伊丽莎白菌的引物组;如
SEQ ID NO.59
~
64
所示的扩增溶血嗜血杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.65
~
72
所示的扩增嗜肺军团菌的引物组;如
SEQ ID NO.73
~
76
所示的扩增铜绿假单胞菌的引物组;如
SEQ ID NO.77
~
80
所示的扩增嗜麦芽窄食单胞菌的引物组;如
SEQ ID NO.81
~
88
所示的扩增阴沟肠杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.89
~
92
所示的扩增粘质沙雷氏菌的引物组;如
SEQ ID NO.93
~
100
所示的扩增百日咳杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.101
~
104
所示的扩增奇异变形杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.105
~
112
所示的扩增新洋葱伯克霍尔德菌的引物组;或者如
SEQ ID NO.113
~
118
所示的扩增洋葱伯克霍尔德菌的引物组
。2.
根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,包括如上所示引物组中的至少8个靶标
。3.
根据权利要求2所述的组合物,其特征在于,包括:如
SEQ ID NO.1
~4所示的扩增鲍曼不动杆菌的引物组;如
SEQ ID NO.5
~
14
所示的扩增产气克雷伯菌的引物组;如
SEQ ID NO.15
~
18
所示的扩增产酸克雷伯菌的引物组;如
SEQ ID NO.19
~
24
所示的扩增大肠埃希菌的引物组;如
SEQ ID NO.25
~
30
所示的扩增肺炎克雷伯菌的引物组;如
技术研发人员:谭涛,杨丽,邓小龙,刘佳,戴立忠,陈姮玉,
申请(专利权)人:长沙圣维数智生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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