一种制造技术

本申请实施例属于生物医药技术领域，涉及一种

【技术实现步骤摘要】
一种DNA融合基因测序数据的分析方法及应用


[0001]本申请涉及生物医药
，尤其涉及一种
DNA
融合基因测序数据的分析方法及应用
。

技术介绍

[0002]肿瘤细胞会存在异于正常细胞的染色体结构，是由于
DNA(
脱氧核糖核酸
)
双链断裂和重新连接而引发的染色体重排，包括一些染色体大片段的缺失
、
倒位及易位，使得两个在原始基因组中相距距离远的基因其部分或全部序列经重排后处于上下游位置，最终导致在基因组中两个原始基因序列重新排列形成一个新基因
。
[0003]目前报道较多癌症的发生与融合基因密切相关，如非小细胞肺癌当中存在多种融合基因
。
针对这些融合基因，美国
FDA(Food and Drug Administration
食品药品管理部门
)
获批了一些针对特定融合基因的治疗药物
。
所以准确的判断融合基因的类型在癌症的整体治疗过程中尤为关键
。r/>[0004]随本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种
DNA
融合基因测序数据的分析方法，其特征在于，包括下述步骤：从原始比对文件中获取同时存在
M
序列和
S
序列的测序序列，并记录所述测序序列中的
M
序列比对到人类参考基因组的第一比对信息；提取所述测序序列中的
S
序列，并记录所述
S
序列比对到人类参考基因组的第二比对信息；根据所述第一比对信息获取第一碱基序列，根据所述第二比对信息获取第二碱基序列；将所述第一碱基序列和所述第二碱基序列进行拼接，得到融合基因碱基序列；提取所述原始比对文件中的所有测序序列，将提取出的测序序列与所述融合基因碱基序列进行比对，得到比对结果；对所述比对结果进行分析，得到融合基因的测序数据
。2.
根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述第一比对信息包括第一染色体信息和第一位置信息，所述第二比对信息包括第二染色体信息和第二位置信息
。3.
根据权利要求2所述的分析方法，其特征在于，所述第一染色体信息为所述
M
序列末尾碱基在人类参考基因组中的第一比对染色体；所述第一位置信息为所述
M
序列末尾碱基在所述第一比对染色体中的比对位置，记为末尾碱基位置；及所述第二染色体信息为所述
S
序列起始碱基在人类参考基因组中的第二比对染色体；所述第二位置信息为所述
S
序列起始碱基在所述第二比对染色体中的比对位置，记为起始碱基位置
。4.
根据权...

【专利技术属性】
技术研发人员：蒋析文，梁志坤，周南，方鹏，陈家慧，
申请(专利权)人：广州达安基因股份有限公司，
类型：发明
国别省市：