【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】表示数字数据的寡核苷酸
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于
2020
年
10
月6日提交的澳大利亚临时专利申请第
2020903611
号的优先权,所述澳大利亚临时专利申请的内容通过引用整体并入本文
。
[0003]本公开涉及创建用于表示数字数据的寡核苷酸序列
。
技术介绍
[0004]在过去的二十年中,假冒和盗版显著增加,几乎在全球每个国家和几乎所有经济部门都可以发现假冒和盗版产品
。
对假冒程度和此类产品价值的估计各不相同
。
然而,
2013
年全球假冒和盗版产品贸易的价值估计为
4610
亿美元
(OECD
和
EUIPO,2016,
假冒和盗版产品贸易:经济影响图
(Trade in Counterfeit and Pirated Goods:Mapping the Economic Impact))。
例如,假药每年导致一百万人死亡,并给行业造成
2000
亿美元的损失
。
最近的研究估计,每年销售的药物中有
10
%是假药,随着网上药店和
3D
打印药物的兴起,这一数字预计将会增加
。
[0005]应对这些挑战的一种方法可以是用编码
DNA
标签来标记产品
。
然而,这通常要求原始 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.
一种用于创建用于表示数字数据的寡核苷酸序列的方法,所述方法包括:从第一组多个寡核苷酸序列中为所述数据的多个部分中的每个部分选择一个寡核苷酸序列,所述多个寡核苷酸序列被配置成由一个寡核苷酸序列产生电时域信号,所述电时域信号能够与来自另一个寡核苷酸序列的电时域信号区分开,所述电时域信号指示在任何一个时间点存在于电传感器中的一个或多个核苷酸的电特性;以及将用于所述数据的多个部分中的每个部分的所述一个寡核苷酸序列组合成表示用于编码所述数字数据的单个寡核苷酸分子的单个寡核苷酸序列
。2.
根据权利要求1所述的方法,其中所述电传感器包括纳米孔
。3.
根据权利要求1或2所述的方法,其中所述方法进一步包括通过从多个候选序列中选择所述多个寡核苷酸序列来确定所述第一组
。4.
根据权利要求3所述的方法,其中从多个候选序列中选择所述多个寡核苷酸序列是基于第一候选序列与第二候选序列之间的距离进行的
。5.
根据权利要求4所述的方法,其中确定所述第一组包括计算来自所述第一候选序列的第一模拟电时域信号与来自所述第二候选序列的第二模拟电时域信号之间的距离
。6.
根据权利要求4或5所述的方法,其中计算所述距离包括计算将所述第一模拟电时域信号匹配到经历使误差最小化的时域变换的所述第二模拟电时域信号的所述误差
。7.
根据权利要求4至6中任一项所述的方法,其中计算所述距离是基于动态时间弯曲或相关性优化弯曲进行的
。8.
根据权利要求4至7中任一项所述的方法,其中确定所述第一组包括跨不同的核苷酸组合进行格形搜索
(Trellis search)。9.
根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括在所述多个寡核苷酸序列中的每两个之间插入间隔子序列
。10.
根据权利要求9所述的方法,其中所述间隔子序列的长度足以针对所述第一组中的第二寡核苷酸序列产生来自所述间隔子序列的可预测干扰,而不是前面的第一寡核苷酸序列
。11.
根据权利要求9或
10
所述的方法,其中在任何一个时间点存在于所述电传感器中的所述一个或多个核苷酸包括在任何一个时间点存在于所述电传感器中的
f
个核苷酸,并且所述间隔子序列的长度为
k
s
,其中
f≤k
s
≤2f。12.
根据权利要求9至
11
中任一项所述的方法,其中所述间隔子序列包括以下中的一项或多项:
·
包含集合
{A}
或
{T}
之一的均聚物
·
包含两种交替的单体核苷酸
{A,T}
或
{A,C}
或
{A,G}
的交替共聚物
·
包含两种交替的二聚体核苷酸
{AA,TT}
或
{AA,CC}
或
{AA,GG}
的交替共聚物
·
包含三种交替的三聚体核苷酸
{AAA,TTT}
或
{AAA,CCC}
或
{AAA,GGG}
的交替共聚物
·
包含四种交替的四聚体核苷酸
{AAAA,TTTT}
或
{AAAA,CCCC}
或
{AAAA,GGGG}
的交替共聚物
·
含有一个或多个
{AAAG}
和
/
或
{AAG}
重复序列的序列
·
含有一个或多个
{TGA}
重复序列的序列
·
含有集合
{Z,P,S,B}
的一个或多个
AEGIS
碱基的序列
。13.
根据权利要求9至
12
中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括从包括多于一个间隔子序列的第二组间隔子序列中选择所述间隔子序列,以编码另外的数字数据
。14.
根据权利要求9至
13
中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括重复所述方法以创建多于一个寡核苷酸分子,所述寡核苷酸分子包括位于寡核苷酸序列之间的间隔子序列,选择所述间隔子序列以在所述多于一个寡核苷酸分子之间创建索引
。15.
根据权利要求9至
14
中任一项所述的方法,其中所述方法包括重复所述方法以创建多于一个寡核苷酸分子,所述寡核苷酸分子包括位于寡核苷酸序列之间的间隔子序列,选择所述间隔子序列以混淆编码在所述多于一个寡核苷酸分子中的数据
。16.
根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括从所述单个寡核苷酸分子中解码所述数字数据
。17.
根据权利要求
16
所述的方法,其中解码包括:当所述单个寡核苷酸分子通过电传感器时,捕获指示在任何一个时间点存在于所述传感器中的一个或多个核苷酸的电特性的电时域信号;以及从捕获的电时域信号中的第一组中识别所述多个寡核苷酸序列
。18.
根据权利要求
17
所述的方法,其中从所述第一组中识别所述多个寡核苷酸序列包括将所述捕获的电时域信号与和所述第一组中的所述多个寡核苷酸序列相关的模拟电时域信号进行匹配
。19.
根据权利要求
16
至
18
中任一项所述的方法,其中解码进一步包括:识别所述捕获的电时域信号中的间隔子序列;在所识别的间隔子序列被识别的位置分割所述捕获的电时域信号;为每个分割识别所述第一组中的所述多个寡核苷酸序列之一
。20.
根据权利要求
16
至
19
中任一项所述的方法,其中解码是基于每个分割与所述第一组中的所述多个寡核苷酸序列之间的动态时间弯曲或相关性优化弯曲进行的
。21.
根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括:合成所述分子;以及将所述分子添加到产品中以进行所述产品的验证
。22.
根据权利要求
22
所述的方法,其中所述产品的验证包括:解码来自所述分子的所述数字数据;以及执行与所述数字数据有关的加密操作,并...
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