【技术实现步骤摘要】
用于评估甲状腺癌风险的标志物、探针组合物、系统及其应用
[0001]本申请涉及生物
,尤其涉及一种用于评估甲状腺癌风险的标志物、探针组合物、系统及其应用。
技术介绍
[0002]据2020年GLOBOCAN数据库统计,甲状腺癌的年龄标准化发病率为每10.1/10万女性和3.1/10万男性,且发病率以每年0.5%的速度增长。每年年龄标准化死亡率为0.5/10万女性和0.3/10万男性。与其他癌症不同的是,甲状腺癌发病率虽然高且增长,但是死亡率较稳定。而其高发病率更多归因于临床检测手段的普及和全民健康意识的提高。
[0003]甲状腺癌是公认的“懒癌”,除了表现为无症状外,还表现为大多数甲状腺癌的30年生存率可达95%。甲状腺癌从病理学上分为分化型癌(包含乳头状甲状腺癌(PTC)和滤泡状甲状腺癌(FTC)),髓样甲状腺癌(MTC)和未分化甲状腺癌ATC,其中PTC占所有甲状腺癌的85%~90%,也是预后表现最好的一类,而ATC预后最差。目前临床上治疗甲状腺癌的手段首选手术切除、随后采用放射性碘消融(131I),以及结 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于评估甲状腺癌风险的标志物,其中,所述标志物选自以下任意一种或两种以上:FAM20A基因、SGPL1基因、RNF144A基因、SLC25A2基因、PCDHB7基因、ADARB2
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AS1基因、C1QTNF4基因、SLC23A1基因和SHH基因。2.根据权利要求1所述的标志物,其中,所述标志物为FAM20A基因;或者所述标志物为SGPL1基因和C1QTNF4基因;或者所述标志物为SGPL1基因、C1QTNF4基因和FAM20A基因;或者所述标志物为FAM20A基因、SGPL1基因、SHH基因和ADARB2
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AS1基因;或者所述标志物为FAM20A基因、RNF144A基因、SHH基因、C1QTNF4基因和PCDHB7基因;或者所述标志物为FAM20A基因、SGPL1基因、RNF144A基因、ADARB2
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AS1基因、C1QTNF4基因和PCDHB7基因;或者所述标志物为FAM20A基因、SGPL1基因、RNF144A基因、ADARB2
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AS1基因、C1QTNF4基因、SLC23A1基因和SHH基因;或者所述标志物为FAM20A基因、SGPL1基因、RNF144A基因、SLC25A2基因、ADARB2
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AS1基因、C1QTNF4基因、SLC23A1基因和SHH基因;或者所述标志物为FAM20A基因、SGPL1基因、RNF144A基因、SLC25A2基因、PCDHB7基因、ADARB2
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AS1基因、C1QTNF4基因、SLC23A1基因和SHH基因。3.根据权利要求1或2所述的标志物,其中,所述FAM20A基因的靶序列如SEQ ID NO:1
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SEQ ID NO:6中的任意一个所示,或者所述FAM20A基因的靶序列包括SEQ ID NO:1
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SEQ ID NO:6中的任意一个所示的序列;或者所述SGPL1基因的靶序列如SEQ ID NO:7
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SEQ ID NO:12中的任意一个所示,或者所述SGPL1基因的靶序列包括SEQ ID NO:7
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SEQ ID NO:12中的任意一个所示的序列;或者所述RNF144A基因的靶序列如SEQ.ID NO:13
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SEQ ID NO:18中的任意一个所示,或者所述RNF144A基因的靶序列包括SEQ ID NO:13
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SEQ ID NO:18中的任意一个所示的序列;或者所述SLC25A2基因的靶序列如SEQ ID NO:19
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SEQ ID NO:24中的任意一个所示,或者所述SLC25A2基因的靶序列包括SEQ ID NO:19
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SEQ ID NO:24中的任意一个所示的序列;或者所述PCDHB7基因的靶序列如SEQ ID NO:25
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SEQ ID NO:30中的任意一个所示,或者所述PCDHB7基因的靶序列包括SEQ ID NO:25
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SEQ ID NO:30中的任意一个所示的序列;或者所述ADARB2
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AS1基因的靶序列如SEQ ID NO:31
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SEQ ID NO:36中的任意一个所示,或者所述ADARB2
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AS1基因的靶序列包括SEQ ID NO:31
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SEQ ID NO:36中的任意一个所示的序列;或者所述C1QTNF4基因的靶序列如SEQ ID NO:37
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SEQ ID NO:42中的任意一个所示,或者所述C1QTNF4基因的靶序列包括SEQ ID NO:37
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SEQ ID NO:42中的任意一个所示的序列;或者所述SLC23A1基因的靶序列如SEQ ID NO:43
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SEQ ID NO:48中的任意一个所示,或者所述SLC23A1基因的靶序列包括SEQ ID NO:43
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SEQ ID NO:48中的任意一个所示的序列;或者所述SHH基因的靶序列如SEQ ID NO:49
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SEQ ID NO:54中的任意一个所示,或者所述SHH基因的靶序列包括SEQ ID NO:49
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SEQ ID NO:54中的任意一个所示的序列。4.一种探针组合物,其中,所述探针组合物包含靶向权利要求1~3中任一项所述标志物甲基化的探针。5.根据权利要求4所述的探针组合物,其中,所述探针组合物包含高甲基化的第一探针
组合物和低甲基化的第二探针组合物,所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域杂交,所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域杂交。6.用于检测标志物的核酸在制备用于评估甲状腺癌风险的试剂盒中的用途,其中,所述标志物选自以下任意一种或两种以上:FAM20A基因、SGPL1基因、RNF144A基因、SLC25A2基因、PCDHB7基因、ADARB2
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AS1基因、C1QTNF4基因、SLC23A1基因和SHH基因;优选地,所述FAM20A基因的靶序列如SEQ ID NO:1
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SEQ ID NO:6中的任意一个所示,或者所述FAM20A基因的靶序列包括SEQ ID NO:1
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SEQ ID NO:6中的任意一个所示的序列;或者所述SGPL1基因的靶序列如SEQ ID NO:7
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SEQ ID NO:12中的任意一个所示,或者所述SGPL1基因的靶序列包括SEQ ID NO:7
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SEQ ID NO:12中的任意一个所示的序列;或者所述RNF144A基因的靶序列如SEQ ID NO:13
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SEQ ID NO:18中的任意一个所示,或者所述RNF144A基因的靶序列包括SEQ ID NO:13
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SEQ ID NO:18中的任意一个所示的序列;或者所述SLC25A2基因的靶序列如SEQ ID NO:19
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SEQ ID NO:24中的任意一个所示,或者所述SLC25A2基因的靶序列包括SEQ ID NO:19
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SEQ ID NO:24中的任意一个所示的序列;或者所述PCDHB7基因的靶序列如SEQ ID NO:25
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SEQ ID NO...
【专利技术属性】
技术研发人员:关晋霞,杨亚东,李永君,周光朋,王秀秀,连明,郭媛媛,吴宁宁,彭勇飞,田继超,王小奇,
申请(专利权)人:博尔诚北京科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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