一种核苷二聚体及其制备方法和在DNA合成中的应用技术

技术编号:39156748 阅读:18 留言:0更新日期:2023-10-23 15:01
本发明专利技术提供了一种核苷二聚体及其制备方法和在DNA合成中的应用。本发明专利技术的核苷二聚体新结构采用甲基磷酸酯、β

【技术实现步骤摘要】
一种核苷二聚体及其制备方法和在DNA合成中的应用


[0001]本专利技术涉及DNA合成
,尤其是涉及一种核苷二聚体及其制备方法和在DNA合成中的应用,特别涉及一种新骨架核苷二聚体制备方法及其在DNA合成中的应用。
技术背景
[0002]合成生物学是一项颠覆性的前沿技术,被认为是继发现DNA的双螺旋结构及人类基因组计划后的第三次生物技术革命。合成生物学发展的核心是基因信息的读取、分析、设计、合成与编辑。从本质上来说,合成生物学是在分子水平上对生命系统的重新设计和改造。其中,DNA合成是合成基因组的核心环节,是合成生物学的基石。
[0003]寡核苷酸合成是DNA从头合成的起点。目前,广泛使用的寡核苷酸合成方法是由Marvin H.Caruthers等人于1987年专利技术的基于固相亚磷酰胺“脱保护、偶联、盖帽和氧化的四步法”的化学合成技术。该方法以多孔玻璃或聚苯乙烯作为固相载体,通过一个由活化、连接、封闭和氧化四步化学反应组成的循环反应连接每一个核苷酸,由3'端向5'端延伸合成寡核苷酸,最后对合成好的寡核苷酸用氨水进行切割和脱保护基处本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种核苷二聚体,其特征在于,所述核苷二聚体具有如下式I所示的结构:其中,B1和B2各自独立地选自取代或未取代的碱基。2.根据权利要求1所述的核苷二聚体,其特征在于,所述碱基选自天然碱基、经过修饰的碱基、天然碱基的保护形式或经过修饰的碱基的保护形式中的任意一种。3.根据权利要求1或2所述的核苷二聚体,其特征在于,所述碱基选自胞嘧啶基、鸟嘌呤基、腺嘌呤基、胸腺嘧啶基、尿嘧啶基、次黄嘌呤基、黄嘌呤基、脱氮腺嘌呤基、脱氮鸟嘌呤基、脱氮次黄嘌呤基、二氢尿嘧啶基或假尿嘧啶基中的任意一种。4.根据权利要求1

3中任一项所述的核苷二聚体,其特征在于,所述碱基的取代基选自卤素、羧基、羟基、酰胺基、氨基、巯基、未取代或R
a
取代的C1

C12直链或支链烷基、未取代或R
a
取代的C1

C12烷氧基、未取代或R
a
取代的C1

C12烷基羟基、未取代或R
a
取代的C1

C12烷基羰基、未取代或R
a
取代的C1

C12烷基酰胺基、未取代或R
a
取代的C1

C12烷氧基酰胺基、NR
N1
R
N2
、未取代或R
a
取代的C1

C12烷基羧基、未取代或R
a
取代的C3

C20环烷基、未取代或R
a
取代的C2

C20杂环烷基、未取代或R
a
取代的C6

C20芳基、未取代或R
a
取代的C2

C20杂芳基中的任意一种;其中,R
N1
、R
N2
各自独立地选自氢、氘、C1

C12直链或支链烷基中的任意一种;R
a
选自卤素、羧基、羟基、酰胺基、C1

C12直链或支链烷基、C1

C12烷氧基或C1

C12卤代烷基中的任意一种。5.根据权利要求1

4中任一项所述的核苷二聚体,其特征在于,所述B1和B2各自独立地选自如下基团,其中
“”
代表基团连接位置:代表基团连接位置:其中,R'、R”、R”'各自独立地选自氢、氘、卤素、氨基、C1

C6直链或支链烷基、C1

C6直链或支链烷基酰基、C6

C12芳基、C6

C12芳基酰基中的任意一种;优选地,所述R'、R”、R”'各自独立地选自氢、氨基、C1

C3直链或支链烷基、C1

C3直链或支链烷基酰基、苯基、苯基酰基中的任意一种;优选地,所述B1和B2各自独立地选自如下基团,其中代表基团连接位置:
6.根据权利要求1

5中任一项所述的核苷二聚体,其特征在于,所述核苷二聚体选自如下化合物中的任意一种:下化合物中的任意一种:7.一种根据权利要求1

6中任一项所述的核苷二聚体的制备方法,其特征在于,所述制备方法的合成路径如下所示:
其中,B1和B2各自独立地选自取代或未取代的碱基,R
p
为羟基保护基团。8.根据权利要求7所述的制备方法,其特征在于,所述制备方法包括以下步骤:(1)亚磷酰胺甲酯单体1和3'

OR
...

【专利技术属性】
技术研发人员:王升启何小羊石安喆邓新秀刘丽艳王飞
申请(专利权)人:中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
类型:发明
国别省市:

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