生物医学大数据操作系统及生物医学大数据分析方法技术方案

本申请公开了一种生物医学大数据操作系统及生物医学大数据分析方法，该操作系统包括核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库和数据仓库。外围组件提供了用户与该操作系统的交互接口。集成开发环境用于基于核心框架开发第一生物医学上层应用。应用仓库用于提供第二生物医学上层应用，数据仓库用于提供生物医学数据。如此，集成开发环境支持开发者更方便地开发适合生物医学的应用。应用仓库和数据仓库能够支持该操作系统的应用生态、数据生态。核心框架为该操作系统的核心部分，能够实现该操作系统中各种功能的组织和统筹管理，如基于核心框架执行生物医学分析项目时，可运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析。数据分析。数据分析。

【技术实现步骤摘要】
生物医学大数据操作系统及生物医学大数据分析方法


[0001]本申请涉及计算机
，具体涉及一种生物医学大数据操作系统以及一种生物医学大数据分析方法。

技术介绍

[0002]生物医学信息分析工作具有数据量大、分析工具众多，以及多范围协作、跨平台重现的特点和需求。在当前生物医学分析的应用中，多是将应用、功能、分析等都绑定在一个特定平台上，无法实现易移植、整合资源等目标。因此，亟需一个实现生物医学信息分析的操作系统来实现以上目标。

技术实现思路

[0003]有鉴于此，本申请提供一种生物医学大数据操作系统以及一种生物医学大数据分析方法，基于该生物医学大数据操作系统能够整合资源，降低各应用、各功能的协作复杂度。
[0004]为解决上述问题，本申请提供的技术方案如下：
[0005]第一方面，本申请提供一种生物医学大数据操作系统，所述系统包括：核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库和数据仓库；所述核心框架，用于执行生物医学分析项目，所述核心框架通过运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析；所述生物医学上层应用包括第一生物医学上层应用和第二生物医学上层应用；所述外围组件，用于提供用户与所述生物医学大数据操作系统的交互接口；所述集成开发环境，用于基于所述核心框架开发所述第一生物医学上层应用；所述应用仓库，用于提供所述第二生物医学上层应用；所述数据仓库，用于提供所述生物医学数据。
[0006]第二方面，本申请提供一种生物医学大数据分析方法，所述方法应用于生物医学大数据操作系统，所述系统包括：核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库和数据仓库；
[0007]所述方法包括：
[0008]所述核心框架在执行生物医学分析项目时，运行生物医学上层应用和调用生物医学数据；
[0009]基于所述生物医学上层应用和所述生物医学数据，完成生物医学数据分析；
[0010]其中，所述生物医学上层应用包括第一生物医学上层应用和第二生物医学上层应用；所述外围组件用于提供用户与所述生物医学大数据操作系统的交互接口；所述集成开发环境用于基于所述核心框架开发所述第一生物医学上层应用；所述应用仓库用于提供所述第二生物医学上层应用；所述数据仓库用于提供所述生物医学数据。
[0011]由此可见，本申请具有如下有益效果：
[0012]本申请提供了一种生物医学大数据操作系统，该生物医学大数据操作系统包括核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库以及数据仓库。核心框架用于执行生物医学分
析项目，在执行生物医学分析项目时，通过运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析。其中，生物医学上层应用包括第一生物医学上层应用和第二生物医学上层应用。外围组件用于提供用户与生物医学大数据操作系统的交互接口，能够通过交互接口实现对生物医学大数据操作系统的使用。集成开发环境用于基于核心框架开发第一生物医学上层应用，应用仓库用于提供第二生物医学上层应用。数据仓库用于提供生物医学数据。生物医学上层应用和生物医学数据均运行在核心框架上。
[0013]可知，本申请的生物医学大数据操作系统提供了集成开发环境，这可以支持开发者更方便地开发适合生物医学的上层应用，并且可以在共生的生态中发布这些应用。该生物医学大数据操作系统提供了应用仓库和数据仓库的框架功能，可以建立和支持应用生态、数据生态，提供可以引用应用和数据的能力。该生物医学大数据操作系统中的核心框架能够实现生物医学大数据操作系统中各种功能的组织和统筹管理，例如，可基于核心框架执行生物医学分析项目，在执行生物医学分析项目时，运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析。
附图说明
[0014]图1为本申请一实施例提供的生物医学大数据操作系统的结构示意图；
[0015]图2为本申请又一实施例提供的生物医学大数据操作系统的结构示意图；
[0016]图3为本申请一实施例提供的外围组件的结构示意图；
[0017]图4为本申请一实施例提供的核心框架的结构示意图；
[0018]图5为本申请又一实施例提供的生物医学大数据操作系统的结构示意图；
[0019]图6为本申请实施例提供的一种生物医学大数据分析方法的流程图。
具体实施方式
[0020]为使本申请的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂，下面结合附图和具体实施方式对本申请实施例作进一步详细的说明。
[0021]为了便于理解和解释本申请实施例提供的技术方案，下面将先对本申请的
技术介绍
进行说明。
[0022]生物医学信息分析工作具有数据量大、分析工具众多，以及多范围协作、跨平台重现的特点和需求。在当前生物医学分析的应用中，多是将应用、功能、分析等都绑定在一个特定平台上，无法实现易移植、整合资源等目标。因此，亟需一个实现生物医学信息分析的操作系统来实现以上目标。
[0023]本申请提供了一种生物医学大数据操作系统，该生物医学大数据操作系统包括核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库以及数据仓库。核心框架用于执行生物医学分析项目，在执行生物医学分析项目时，通过运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析。其中，生物医学上层应用包括第一生物医学上层应用和第二生物医学上层应用。外围组件用于提供用户与生物医学大数据操作系统的交互接口，能够通过交互接口实现对生物医学大数据操作系统的使用。集成开发环境用于基于核心框架开发第一生物医学上层应用，应用仓库用于提供第二生物医学上层应用。数据仓库用于提供生物医学数据。生物医学上层应用和生物医学数据均运行在核心框架上。
[0024]可知，本申请的生物医学大数据操作系统提供了集成开发环境，这可以支持开发者更方便地开发适合生物医学的上层应用，并且可以在共生的生态中发布这些应用。该生物医学大数据操作系统提供了应用仓库和数据仓库的框架功能，可以建立和支持应用生态、数据生态，提供可以引用应用和数据的能力。该生物医学大数据操作系统中的核心框架能够实现生物医学大数据操作系统中各种功能的组织和统筹管理，例如，可基于核心框架执行生物医学分析项目，在执行生物医学分析项目时，运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析。
[0025]可以理解的是，针对以上方案所存在的缺陷，均是申请人在经过实践并仔细研究后得出的结果。因此，上述问题的发现过程以及下文中本申请实施例针对上述问题所提出的解决方案，都应该是申请人在本申请过程中对本申请实施例做出的贡献。
[0026]为了便于理解本申请，下面结合附图对本申请实施例提供的生物医学大数据操作系统进行说明。
[0027]生物医学分析指的是使用计算机科学方法、算法和工具来分析和解释生物医学数据的过程。本申请实施例提供的生物医学大数据操作系统能够实现生物医学分析。
[0028]在本申请实施例中，生物医学大数据操作系统的部署较为灵活，生物医学大数据操作系统可以部署于任一符合预设条件的硬件资源本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种生物医学大数据操作系统，其特征在于，所述系统包括：核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库和数据仓库；所述核心框架，用于执行生物医学分析项目，所述核心框架通过运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析；所述生物医学上层应用包括第一生物医学上层应用和第二生物医学上层应用；所述外围组件，用于提供用户与所述生物医学大数据操作系统的交互接口；所述集成开发环境，用于基于所述核心框架开发所述第一生物医学上层应用；所述应用仓库，用于提供所述第二生物医学上层应用；所述数据仓库，用于提供所述生物医学数据。2.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述生物医学上层应用包括由一个或多个生物医学分析算子形成的生物医学分析工作流和/或由交互式编程环境开发的程序代码。3.根据权利要求2所述的系统，其特征在于，所述核心框架，还用于提供生物医学分析工作流执行引擎和交互式编程环境，提供生物医学分析工作流和所述交互式编程环境的调度执行，提供所述生物医学上层应用的封装规范和分发标准。4.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述生物医学大数据操作系统部署于任一符合预设条件的硬件资源上；所述硬件资源包括云平台、独立服务器、服务器集群、计算机设备中的一种或多种。5.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述核心框架包括：应用管理模块、数据管理模块、运行资源管理模块以及功能定义模块；所述应用管理模块，用于提供调度所述生物医学上层应用的功能；所述数据管理模块，用于提供调度所述生物医学数据的功能；所述运行资源管理模块，用于提供调度底层资源的功能；所述功能定义模块，用于通过所述应用管理模块调用所述生物医学上层应用，通过所述数据管理模块调用所述生物医学数据，通过所述运行资源管理模块调用所述底层资源，在执行所述生物医学分析项目时，使用所述生物医学上层应用、所述生物医学数据以及所述底层资源，完...

【专利技术属性】
技术研发人员：李亦学，张鑫，靖瑞锋，谭待，刘子青，于鸿磊，刘继龙，李召义，肖庆宇，陈易凡，李昭强，郎志坚，卢欣，杨广霞，程瑾瑜，肖华源，陈秭如，孙博文，周剑文，陈林，
申请(专利权)人：广州国家实验室，
类型：发明
国别省市：