碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质技术

本申请公开了碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质，应用于基因测序技术领域，所述碱基簇亮度检测方法包括：在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，其中，所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇；根据所述局部背景像素点，确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值；根据所述背景亮度值，对所述待检测碱基簇进行亮度检测，得到亮度检测结果。本申请解决了对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低的技术问题。效率低的技术问题。效率低的技术问题。

【技术实现步骤摘要】
碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质


[0001]本申请涉及基因测序
，尤其涉及一种碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质。

技术介绍

[0002]随着科技的不断发展，高通量测序俨然已经成为了基因测序的核心技术手段，在基因序列的碱基簇与荧光染料进行化学反应后，通过微型照相机可对生成的荧光簇进行拍摄得到相应的荧光图像，再基于碱基簇亮度值识别出隶属于不同簇的碱基，其中，对于碱基的识别是实现高精度基因测序的重要环节之一。
[0003]碱基识别即提取出荧光图像中碱基簇的亮度，而碱基簇亮度通常由测量亮度减去背景亮度得到，所以，在荧光图像中提取出背景亮度便可得到碱基簇亮度，目前，通常将荧光图像中的荧光簇区域和背景区域进行分割，再对背景区域进行全局平均，以得到背景亮度，但是，由于对荧光图像进行分割需要对荧光图像中的所有像素点进行计算阈值，而高复杂度的计算量将导致计算耗时长，进而使得易出现限制测序通量的情况，所以，当前对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低。

技术实现思路

[0004]本申请的主要目的在于提供一种碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质，旨在解决现有技术中对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低的技术问题。
[0005]为实现上述目的，本申请提供一种碱基簇亮度检测方法，所述碱基簇亮度检测方法包括：
[0006]在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，其中，所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇；
[0007]根据所述局部背景像素点，确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值；
[0008]根据所述背景亮度值，对所述待检测碱基簇进行亮度检测，得到亮度检测结果。
[0009]为实现上述目的，本申请还提供一种碱基簇亮度检测装置，所述碱基簇亮度检测装置包括：
[0010]选取模块，用于在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，其中，所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇；
[0011]确定模块，用于根据所述局部背景像素点，确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值；
[0012]检测模块，用于根据所述背景亮度值，对所述待检测碱基簇进行亮度检测，得到亮度检测结果。
[0013]本申请还提供一种电子设备，所述电子设备包括：至少一个处理器以及与所述至少一个处理器通信连接的存储器，所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的指令，所述指令被所述至少一个处理器执行，以使所述至少一个处理器能够执行如上述的碱
基簇亮度检测方法的步骤。
[0014]本申请还提供一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质上存储有实现碱基簇亮度检测方法的程序，所述碱基簇亮度检测方法的程序被处理器执行时实现如上述的碱基簇亮度检测方法的步骤。
[0015]本申请还提供一种计算机程序产品，包括计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如上述的碱基簇亮度检测方法的步骤。
[0016]本申请提供了一种碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质，也即，在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，其中，所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇；根据所述局部背景像素点，确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值；根据所述背景亮度值，对所述待检测碱基簇进行亮度检测，得到亮度检测结果。
[0017]本申请在携带待检测检测簇的目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，进而通过局部背景像素点确定待检测碱基簇对应的背景亮度值，即可通过局部背景像素点确定目标碱基簇图像的图像整体背景亮度，最终通过背景亮度值对待检测碱基簇的进行亮度检测，也即，在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，进而通过局部背景像素点得到待检测碱基簇的亮度检测结果。
[0018]由于局部背景像素点即可对待检测碱基簇进行亮度检测，即，减少了在检测待检测碱基簇亮度时所提取的背景像素点数量，与此同时，局部背景像素点是在目标碱基簇图像的全局像素点中选取得到的，也即，在检测待检测碱基簇亮度时无需对携带待检测碱基簇的目标碱基簇图像进行图像分割，所以，简化了在对待检测碱基簇进行亮度检测时的检测流程，即可实现基于局部像素点所确定的背景亮度值对待检测碱基簇进行亮度检测的目的。
[0019]基于此，本申请通过在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，进而通过局部背景像素点确定待检测碱基簇对应的背景亮度值，最终通过背景亮度值得到待检测碱基簇的亮度检测结果，从而实现了通过目标碱基簇图像中的局部背景像素点对待检测碱基簇进行亮度检测的目的，即，克服了由于对荧光图像进行分割需要对荧光图像中的所有像素点进行计算阈值，而高复杂度的计算量将导致计算耗时长，进而使得易出现限制测序通量的情况的技术缺陷，所以，提升了对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低。
附图说明
[0020]此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分，示出了符合本申请的实施例，并与说明书一起用于解释本申请的原理。
[0021]为了更清楚地说明本申请实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员而言，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0022]图1为本申请实施例一提供的碱基簇亮度检测方法的碱基簇亮度检测示意图；
[0023]图2为本申请实施例一提供的碱基簇亮度检测方法的流程示意图；
[0024]图3为本申请实施例一提供的碱基簇亮度检测方法的整体亮度均匀图像的示意图；
[0025]图4为本申请实施例一提供的碱基簇亮度检测方法的整体亮度离散图像的示意
图；
[0026]图5为本申请实施例一提供的碱基簇亮度检测方法的整体亮度均匀图像的像素点亮度值
‑
像素点序列号的曲线图；
[0027]图6为本申请实施例一提供的碱基簇亮度检测方法的整体亮度离散图像的划分示意图；
[0028]图7为本申请实施例二提供的碱基簇亮度检测方法的流程示意图；
[0029]图8为本申请实施例三提供的碱基簇亮度检测装置的结构示意图；
[0030]图9为本申请实施例四提供的电子设备的结构示意图。
[0031]本申请目的实现、功能特点及优点将结合实施例，参照附图做进一步说明。
具体实施方式
[0032]为使本专利技术的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂，下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动的前提下所获得的所有其它实施例，均属于本专利技术保护的范围。
[0033]实施例一
[0034]首先，应当理解的是，在高通量测序过程中，碱基识别将影响到识别出的碱基可行度，所以对于碱基的识别就显得尤为重要，例如，在进行碱基识别时通过碱基簇与不同荧光染料进行反应，进而通过激光本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种碱基簇亮度检测方法，其特征在于，所述碱基簇亮度检测方法包括：在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点，其中，所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇；根据所述局部背景像素点，确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值；根据所述背景亮度值，对所述待检测碱基簇进行亮度检测，得到亮度检测结果。2.如权利要求1所述碱基簇亮度检测方法，其特征在于，所述在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点的步骤包括：根据所述目标碱基簇图像的图像亮度方差，对所述目标碱基簇图像的图像类型进行检测；若检测到所述目标碱基簇图像为整体亮度均匀图像，则通过对所述整体亮度均匀图像的全局像素点进行亮度排序，得到所述局部背景像素点；若检测到所述目标碱基簇图像为整体亮度离散图像，则通过在所述整体亮度离散图像的全局像素点中进行亮度排序，得到所述局部背景像素点。3.如权利要求2所述碱基簇亮度检测方法，其特征在于，所述通过在所述整体亮度离散图像的全局像素点中进行亮度排序，得到所述局部背景像素点的步骤包括：将所述整体亮度离散图像的全局像素点划分为至少一个单元碱基簇图像的单元全局像素点；对于任一所述单元碱基簇图像，在所述单元碱基簇图像的单元全局像素点中进行亮度排序，得到像素点序列；根据所述像素点序列的序列号和预设序列号阈值之间的大小关系，在所述像素点序列选取所述单元碱基簇图像的单元局部背景像素点；将各所述单元碱基簇图像的单元局部背景像素点共同作为所述局部背景像素点。4.如权利要求3所述碱基簇亮度检测方法，其特征在于，所述像素点序列包括局部像素点序列和全局像素点序列，所述在所述单元碱基簇图像的单元全局像素点中进行亮度排序，得到像素点序列，包括：在所述单元碱基簇图像的单元全局像素点中提取局部像素点，对所述局部像素点进行亮度排序，得到所述局部像素点序列；或，对所述单元碱基簇图像的全局像素点进行排序，得到所述全局像素点序列。5.如权利要求4所述碱基簇亮度检测方法，其特征在于，所述在所述单元碱基簇...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘德健，
申请(专利权)人：中元汇吉生物技术股份有限公司，
类型：发明
国别省市：