用于分析物分析的系统和方法技术方案

本公开提供了用于分析分析物的方法和系统。分析分析物可包括使分析物与结合试剂接触，该结合试剂可包括：对该分析物具有特异性的结合探针，和核酸分子。可使该核酸分子变性，并且可收集指示该分析物的该变性的信号。这些收集的信号可用于检测、鉴定或定量该分析物。鉴定或定量该分析物。鉴定或定量该分析物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于分析物分析的系统和方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年12月29日提交的美国临时专利申请63/131，473号和于2021年4月9日提交的美国临时专利申请173，038号两者的权益，这两份申请的内容以引用方式整体并入本文。

技术介绍

[0003]微流体装置是包括小规模处理流体的结构的装置。通常，微流体装置以亚毫米级操作并处理微升、纳升或更少量的流体。微流体装置的一种应用是分析物分析，例如，数字聚合酶链式反应(dPCR)。具有多个分区的微流体装置可以用于dPCR。与定量实时PCR(qPCR)不同，其中通过将未知样品的PCR扩增速率与一组已知qPCR标准品的速率进行比较来定量模板，dPCR可以提供更高的灵敏度、更好的精度和更大的可再现性。
[0004]对于基因组研究人员和临床医生而言，dPCR在稀有突变检测、定量拷贝数变异和下一代测序文库定量中特别有效。具有细胞游离DNA和病毒载量定量的液体活检在临床环境中的潜在用途进一步提高了dPCR技术的价值。现有的dPCR解决方案已经使用了弹性体阀阵列、硅通孔方法和液滴在油中的微流体封装。尽管可用的dPCR平台的数目不断增加，但是当与依赖于对PCR扩增循环数目进行计数的旧qPCR技术相比时，dPCR一直处于劣势。吞吐量、易用性、性能和成本的组合是在dPCR市场上获得采用的主要障碍。

技术实现思路

[0005]本文提供了可以用于检测、鉴定或定量一种分析物或多种分析物的方法和系统。本公开提供了用于样品制备、核酸扩增、分析物分析、多重分析物分析或它们的任何组合的方法、系统和装置。与其它系统和方法相比，本文所描述的方法、系统和装置可以允许以降低的成本或复杂性来检测、鉴定或定量分析物。
[0006]在一方面，本公开提供了用于鉴定分析物的方法，该方法包括：(a)使结合试剂与分析物接触，结合试剂包括：(i)对分析物具有结合特异性的结合探针，和(ii)核酸分子；(b)使核酸分子或其衍生物的至少一部分变性；以及(c)检测指示变性的信号，以鉴定分析物。
[0007]在一些实施方案中，分析物与支持物偶联。在一些实施方案中，分析物通过固定在支持物上的捕获剂与支持物偶联。在一些实施方案中，捕获剂是抗体。在一些实施方案中，结合试剂是抗体。在一些实施方案中，分析物是蛋白质。
[0008]在一些实施方案中，分析物是样品中多种分析物中的一种分析物，并且其中结合试剂是多种结合试剂中的一种结合试剂。在一些实施方案中，该方法还包括使另外的结合试剂与另外的分析物接触，另外的结合试剂包括：(i)对另外的分析物具有结合特异性的另外的结合探针，和(ii)另外的核酸分子。在一些实施方案中，另外的核酸分子与核酸分子不同。在一些实施方案中，该方法还包括使另外的核酸分子或其衍生物变性。在一些实施方案中，该方法还包括检测指示使另外的核酸或其衍生物变性的另外的信号，以鉴定另外的分
析物。在一些实施方案中，该方法还包括将多种结合试剂分配到多个分区中。
[0009]在一些实施方案中，该方法还包括使用微流体装置以将多种结合试剂分配到多个分区中。在一些实施方案中，该方法还包括对多个分区中的一个或多个分区进行成像，以检测信号。在一些实施方案中，该方法还包括测定含有核酸分子的多个分区，其中含有核酸分子的多个分区用于定量分析物。
[0010]在一些实施方案中，核酸分子可逆地与结合探针偶联。在一些实施方案中，该方法还包括在(b)之前，使核酸分子从结合探针去偶联。在一些实施方案中，该方法还包括在(b)之前，使核酸分子的一部分从结合探针去偶联。在一些实施方案中，在(a)之后，结合试剂与分析物偶联。在一些实施方案中，该方法还包括通过洗涤去除未偶联的结合试剂。在一些实施方案中，该方法还包括使核酸分子经历受控加热，以使核酸分子变性。在一些实施方案中，该方法还包括在(b)之前，扩增核酸分子。在一些实施方案中，该方法还包括处理信号以产生变性曲线，变性曲线用于鉴定分析物。在一些实施方案中，核酸分子包括嵌入染料，信号源自嵌入染料。在一些实施方案中，信号是光信号。
[0011]在一些实施方案中，该方法还包括使另外的结合试剂与分析物接触，另外的结合试剂包括：(i)对分析物具有结合特异性的另外的结合探针，和(ii、)另外的核酸分子。在一些实施方案中，该方法还包括使核酸分子和另外的核酸分子与夹板寡核苷酸(splinter oligo)接触，以使核酸分子与另外的核酸分子偶联。在一些实施方案中，该方法还包括连接核酸分子和另外的核酸分子，以产生连接的核酸分子。在一些实施方案中，该方法还包括在(b)之前，扩增连接的核酸分子。
[0012]在另一方面，本公开提供了用于鉴定分析物的系统，该系统包括：被配置成收集和处理用于鉴定分析物的信号的检测单元；操作性地耦接到检测单元的一个或多个处理器，其中该一个或多个处理器被单独地或集体地编程或以其它方式被配置成：(i)使结合试剂与分析物接触，结合试剂包括(a)对分析物具有结合特异性的结合探针，和(b)核酸分子；(ii)使核酸分子或其衍生物的至少一部分变性；以及(iii)指导检测单元检测指示核酸分子的变性的信号，以鉴定分析物。
[0013]在一些实施方案中，该系统还包括被配置成与分析物偶联的支持物。在一些实施方案中，支持物包含固定在支持物上的捕获剂，并且其中捕获剂被配置成与分析物偶联。在一些实施方案中，捕获剂是抗体。在一些实施方案中，结合试剂是抗体。在一些实施方案中，分析物是蛋白质。
[0014]在一些实施方案中，该系统还包括微流体装置，该微流体装置包括多个分区。在一些实施方式中，多个分区被配置成分配包含结合试剂的混合物。在一些实施方案中，检测单元被配置成对多个分区中的一个或多个分区进行成像。在一些实施方案中，该系统还包括处理单元，该处理单元被配置成扩增核酸分子。在一些实施方案中，该系统还包括加热单元，该加热单元被配置用于将核酸分子受控加热以使核酸分子变性。在一些实施方案中，一个或多个处理器被单独地或集体地编程或以其它方式配置成产生核酸分子的变性曲线，该变性曲线能够用于鉴定分析物。
[0015]根据以下具体实施方式，本领域的技术人员将显而易知本公开的额外方面和优势，在具体实施方式中仅示出和描述本公开的说明性实施方案。如将认识到，本公开能够具有其它不同的实施方案，并且其若干细节能够在各种明显的方面进行修改，所有这些都不
脱离本公开。因此，附图和说明书本质上被视为是说明性的而非限制性的。
[0016]通过引用并入
[0017]本说明书中提及的所有公布、专利和专利申请均以引用的方式并入本文，其程度与每个单独的公布、专利或专利申请被具体且单独地指示以引用的方式并入的程度相同。在通过引用的方式并入的公开和专利或专利申请与本说明书中所包含的公开内容相抵触的情况下，本说明书意欲替代或优先于任何这类矛盾材料。
附图说明
[0018]本专利技术的新颖特征在所附权利要求中具体地阐述。通过参考以下阐述其中利用本专利技术原理的说明性实施方案本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于鉴定分析物的方法，所述方法包括：(a)使结合试剂与所述分析物接触，所述结合试剂包括：(i)对所述分析物具有结合特异性的结合探针，和(ii)核酸分子；(b)使所述核酸分子或其衍生物的至少一部分变性；以及(c)检测指示所述变性的信号，以鉴定所述分析物。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述分析物与支持物偶联。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述分析物通过固定在所述支持物上的捕获剂与所述支持物偶联。4.根据权利要求3所述的方法，其中所述捕获剂是抗体。5.根据权利要求1所述的方法，其中所述结合试剂是抗体。6.根据权利要求1所述的方法，其中所述分析物是蛋白质。7.根据权利要求1所述的方法，其中所述分析物是样品中多种分析物中的一种分析物，并且其中所述结合试剂是多种结合试剂中的一种结合试剂。8.根据权利要求7所述的方法，所述方法还包括使另外的结合试剂与另外的分析物接触，所述另外的结合试剂包括：(i)对所述另外的分析物具有结合特异性的另外的结合探针，和(ii)另外的核酸分子。9.根据权利要求8所述的方法，其中所述另外的核酸分子与所述核酸分子不同。10.根据权利要求8所述的方法，所述方法还包括使所述另外的核酸分子或其衍生物变性。11.根据权利要求10所述的方法，所述方法还包括检测指示所述使所述另外的核酸或其衍生物变性的另外的信号，以鉴定所述另外的分析物。12.根据权利要求7所述的方法，所述方法还包括将所述多种结合试剂分配到多个分区中。13.根据权利要求12所述的方法，所述方法还包括使用微流体装置以将所述多种结合试剂分配到所述多个分区中。14.根据权利要求12所述的方法，所述方法还包括对所述多个分区中的一个或多个分区进行成像，以检测所述信号。15.根据权利要求14所述的方法，所述方法还包括测定含有所述核酸分子的多个分区，其中含有所述核酸分子的所述多个分区用于定量所述分析物。16.根据权利要求1所述的方法，其中所述核酸分子可逆地与所述结合探针偶联。17.根据权利要求16所述的方法，所述方法还包括在(b)之前，使所述核酸分子从所述结合探针去偶联。18.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括在(b)之前，使所述核酸分子的一部分从所述结合探针去偶联。19.根据权利要求1所述的方法，其中，在(a)之后，所述结合试剂与所述分析物偶联。20.根据权利要求19所述的方法，所述方法还包括通过洗涤去除未偶联的结合试剂。21.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括使所述核酸分子经历受控加热，以使所述核酸分子变性。22.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括在(b)之前，扩增所述核酸分子。
23.根据权利要求1所述的方法，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：H，
申请(专利权)人：康比纳蒂股份有限公司，
类型：发明
国别省市：