本发明专利技术公开通过从组织样本切片图像去除被判断为其他组织样本的组织样本区域的方式精制组织图像的方法及执行其的计算系统。根据本发明专利技术的一实施方式，本发明专利技术提供组织样本图像精制方法，其包括如下步骤：提取分别与包含在组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓(contour)；算出所提取的上述多个轮廓各自的中心点坐标；基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓；以及去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域。少一部分相应的区域。少一部分相应的区域。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】组织样本图像精制方法及执行其的计算系统
[0001]本专利技术涉及生物组织样本图像精制方法及执行其的计算系统。更详细地，涉及通过从组织样本切片图像去除被判断为其他组织样本的组织样本区域的方式精制组织图像的方法及执行其的计算系统。
技术介绍
[0002]病理学或病理科的主要业务之一为通过读取患者的生物组织切片图像来判断特定疾病的状态或征兆的诊断。现有的病理诊断方法通过如下方式进行，专家用肉眼来通过光学显微镜观察、读取从样本制成的诊断用病理切片图像。在使用连接在计算机的显微镜摄像头来将病理切片转换成数字影像之后，通过显示器进行观察并读取的方式为数字病理学的开端。近来，随着数字切片扫描仪的问世，广泛使用了将整个病理切片转换成数字影像并将其制成病理切片图像之后，通过计算机显示器观察上述图像并读取的方式。
[0003]并且，最近，随着机器学习的发达，正在积极进行计算机系统将识别或分类图像等业务自动化的研究。尤其，正在进行用于将专业医疗人员利用作为机器学习的一种的神经网络(例如，卷积神经网络(CNN)等)来执行的诊断自动化的研究，通常，通过利用生物样本图像的神经网络的诊断会利用生物图像。即，对相应生物图像的专业医疗人员注解特定疾病的状态(例如，是否显现疾病)，将这种注解的多个图像用作学习数据来学习神经网络。
[0004]另一方面，如图1所示，当在一个玻璃片放置多个组织样本来制作病理切片时，在通过这种方法制作的病理切片的情况下，可以用肉眼来通过光学显微镜观察这种病理切片。但是，当将其数字化并按各组织样本单位执行算法分析或通过人工智能的分析时，在作为分析对象的图像内有可能包括其他组织样本部分，从而无法准确训练诊断模型或者分析的结果并不准确。例如，在从放置生物组织来制作的玻璃切片生成的病理切片图像的情况下，在按组织样本自动分割图像的过程中，因自动分割算法的限制或错误而有可能包括其他组织样本。或者，在按组织样本单位手动分割图像的情况下，当将组织样本区域仅指定为四边形或椭圆等简单形态时，也同样存在有可能包括其他组织样本的问题。
[0005]因此，需要确认在按组织样本单位分割的图像中是否包括其他组织样本并将其去除的方法。
技术实现思路
[0006]技术问题
[0007]本专利技术所要解决的技术问题在于，提供通过接收组织样本切片图像并去除被判断为其他组织样本的组织样本区域的方式精制组织样本图像的方法及执行其的计算系统。
[0008]技术方案
[0009]根据本专利技术的一实施方式，本专利技术提供组织样本图像精制方法，其包括如下步骤：提取分别与包含在组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓(contour)；算出所提取的上述多个轮廓各自的中心点坐标；基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓
各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓；以及去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域。
[0010]在一实施例中，基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓的步骤可包括如下步骤：在上述多个轮廓中，将对应轮廓的中心点与上述组织样本图像的中心点之间的距离最短的轮廓确定为上述主组织轮廓。
[0011]在一实施例中，去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域的步骤可包括如下步骤：在上述多个轮廓中确定与上述组织样本图像的外围线相邻的边界相邻轮廓；以及在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应的区域，其中，上述去除对象轮廓并非上述边界相邻轮廓中的主组织轮廓。
[0012]在一实施例中，提取分别与包含在上述组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓的步骤可包括如下步骤：生成包含在上述组织样本图像的多个组织区域和非组织区域的值被区分为二进制值的与上述组织样本图像相应的二进制掩码图像；以及基于上述二进制掩码来提取上述多个轮廓。
[0013]在一实施例中，在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应的区域的步骤可包括如下步骤：在上述组织样本图像中，将与上述去除对象轮廓相应的区域置换成上述组织样本图像的背景色。
[0014]在一实施例中，在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应区域的步骤还可包括如下步骤：在上述组织样本图像中将并不与上述多个轮廓中的任一个相应的区域的平均色确定为上述组织样本图像的背景色。
[0015]根据本专利技术的再一实施方式，本专利技术提供计算机系统，设置在数据处理装置并记录在介质，用于执行上述方法。
[0016]根据本专利技术的另一实施方式，本专利技术提供计算机可读记录介质，记录有用于执行上述方法的计算机程序。
[0017]根据本专利技术的还有一实施方式，本专利技术提供组织样本图像精制系统，其包括：处理器；以及存储器，存储计算机程序，当上述计算机程序通过上述处理器执行时，使得上述组织样本图像精制系统执行组织样本图像精制方法，上述组织样本图像精制方法包括如下步骤：提取分别与包含在组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓；算出所提取的上述多个轮廓各自的中心点坐标；基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓；以及去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域。
[0018]在一实施例中，基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓的步骤可包括如下步骤：在上述多个轮廓中，将对应轮廓的中心点与上述组织样本图像的中心点之间的距离最短的轮廓确定为上述主组织轮廓。
[0019]在一实施例中，去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域的步骤可包括如下步骤：在上述多个轮廓中确定与上述组织样本图像的外围线相邻的边界相邻轮廓；以及在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应的区域，其中，上述去除对象轮廓并非上述边界相邻轮廓中的主组织轮廓。
[0020]在一实施例中，提取分别与包含在上述组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓的步骤可包括如下步骤：生成包含在上述组织样本图像的多个组织区域和非组织区域的值被区分为二进制值的与上述组织样本图像相应的二进制掩码图像；以及基于上述二进制掩码来提取上述多个轮廓。
[0021]在一实施例中，在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应的区域的步骤可包括如下步骤：在上述组织样本图像中，将与上述去除对象轮廓相应的区域置换成上述组织样本图像的背景色。
[0022]专利技术的效果
[0023]根据本专利技术的技术思想，本专利技术可提供通过接收组织样本切片图像并去除被判断为其他组织样本的组织样本区域的方式精制组织样本图像的方法及执行其的计算系统。
[0024]并且，本专利技术具有如下效果，能够以通过本专利技术一实施例的精制组织样本图像的方法精制的图像更加准确地学习人工神经网络。
附图说明
[0025]为了更加充分地理解本专利技术详细说明中所引用的附图，提供对每个附图的简本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种组织样本图像精制方法，其特征在于，包括如下步骤：提取分别与包含在组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓；算出所提取的上述多个轮廓各自的中心点坐标；基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓；以及去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域。2.根据权利要求1所述的组织样本图像精制方法，其特征在于，基于上述组织样本图像的中心点坐标和上述多个轮廓各自的中心点坐标，在上述多个轮廓中确定主组织轮廓的步骤包括如下步骤：在上述多个轮廓中，将对应轮廓的中心点与上述组织样本图像的中心点之间的距离最短的轮廓确定为上述主组织轮廓。3.根据权利要求1所述的组织样本图像精制方法，其特征在于，去除在上述多个轮廓中与上述主组织轮廓之外的剩余轮廓的至少一部分相应的区域的步骤包括如下步骤：在上述多个轮廓中确定与上述组织样本图像的外围线相邻的边界相邻轮廓；以及在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应的区域，其中，上述去除对象轮廓并非上述边界相邻轮廓中的主组织轮廓。4.根据权利要求1所述的组织样本图像精制方法，其特征在于，提取分别与包含在上述组织样本图像的多个组织区域相应的多个轮廓的步骤包括如下步骤：生成包含在上述组织样本图像的多个组织区域和非组织区域的值被区分为二进制值的与上述组织样本图像相应的二进制掩码图像；以及基于上述二进制掩码来提取上述多个轮廓。5.根据权利要求1所述的组织样本图像精制方法，其特征在于，在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应的区域的步骤包括如下步骤：在上述组织样本图像中，将与上述去除对象轮廓相应的区域置换成上述组织样本图像的背景色。6.根据权利要求5所述的组织样本图像精制方法，其特征在于，在上述组织样本图像中去除与去除对象轮廓相应区域的步骤还包括如下步骤：在上述组织样本图像中将并不与上述多个轮廓中的任一个相应的区域的平均色确定为上述组织样本图像的背景色。7.一种计算机程序，其特征在于，设置在数据处理装置并记录在介质，用于执行根据权利要求1至6...
【专利技术属性】
技术研发人员：曺浚宁，郭兌荣，金善禹，
申请(专利权)人：第一百欧有限公司，
类型：发明
国别省市：
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