碱基簇亮度校正方法、装置、电子设备及可读存储介质制造方法及图纸

本申请公开了碱基簇亮度校正方法、装置、电子设备及可读存储介质，应用于基因测序技术领域，所述碱基簇亮度校正方法包括：若检测到目标碱基簇图像中待校正碱基簇存在亮度串扰碱基簇，则获取所述亮度串扰碱基簇相对于所述待校正碱基簇的亮度串扰方向；确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表，其中，所述亮度值映射表用于存储与所述待校正碱基簇相距不同像素距离下的亮度串扰碱基簇的第一实际亮度值与亮度校正值之间的映射关系；在所述亮度值映射表中查询所述第一实际亮度值对应的亮度校正值；根据所述亮度校正值，对所述待校正碱基簇的第二实际亮度值进行校正，得到亮度校正结果。本申请解决了对于碱基簇进行亮度校正的校正精准性低的技术问题。正精准性低的技术问题。正精准性低的技术问题。

【技术实现步骤摘要】
碱基簇亮度校正方法、装置、电子设备及可读存储介质


[0001]本申请涉及基因测序
，尤其涉及一种碱基簇亮度校正方法、装置、电子设备及可读存储介质。

技术介绍

[0002]随着科技的不断发展，高通量测序俨然已经成为了基因测序的核心技术手段，在基因序列的碱基簇与荧光染料进行化学反应后，通过微型照相机可对生成的荧光簇进行拍摄得到相应的荧光图像，再基于碱基簇亮度值识别出隶属于不同簇的碱基，其中，对于碱基的识别是实现高精度基因测序的重要环节之一。
[0003]目前，对于碱基的识别通常依赖于碱基簇亮度成像函数建立碱基簇间的亮度串扰模型，通过最小化亮度串扰得到亮度校正矩阵，进而通过亮度校正矩阵校正对不同荧光图像区域内的碱基簇亮度进行校正，最终实现碱基簇间的亮度串扰校正，但是，由于碱基簇在生物芯片上是随机形成的，进而导致同一区域内的碱基簇间的距离并不完全相同，这就使得依赖于同一亮度校正矩阵对某一图像区域内的碱基簇进行亮度校正时仍易出现亮度串扰的情况，所以，当前对于碱基簇进行亮度校正的校正精准性低。

技术实现思路

[0004]本申请的主要目的在于提供一种碱基簇亮度校正方法、装置、电子设备及可读存储介质，旨在解决现有技术中对于碱基簇进行亮度校正的校正精准性低的技术问题。
[0005]为实现上述目的，本申请提供一种碱基簇亮度校正方法，所述碱基簇亮度校正方法包括：
[0006]若检测到目标碱基簇图像中待校正碱基簇存在亮度串扰碱基簇，则获取所述亮度串扰碱基簇相对于所述待校正碱基簇的亮度串扰方向；<br/>[0007]确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表，其中，所述亮度值映射表用于存储与所述待校正碱基簇相距不同像素距离下的亮度串扰碱基簇的第一实际亮度值与亮度校正值之间的映射关系；
[0008]在所述亮度值映射表中查询所述第一实际亮度值对应的亮度校正值；
[0009]根据所述亮度校正值，对所述待校正碱基簇的第二实际亮度值进行校正，得到亮度校正结果。
[0010]为实现上述目的，本申请还提供一种碱基簇亮度校正装置，所述碱基簇亮度校正装置包括：
[0011]获取模块，用于若检测到碱基簇图像中待校正碱基簇存在亮度串扰碱基簇，则获取所述亮度串扰碱基簇相对于所述待校正碱基簇的亮度串扰方向；
[0012]确定模块，用于确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表，其中，所述亮度值映射表用于存储与所述待校正碱基簇相距不同像素距离下的亮度串扰碱基簇的第一实际亮度值与亮度校正值之间的映射关系；
[0013]查询模块，用于在所述亮度值映射表中查询所述第一实际亮度值对应的亮度校正值；
[0014]校正模块，用于根据所述亮度校正值，对所述待校正碱基簇的第二实际亮度值进行校正，得到亮度校正结果。
[0015]本申请还提供一种电子设备，所述电子设备包括：至少一个处理器以及与所述至少一个处理器通信连接的存储器，所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的指令，所述指令被所述至少一个处理器执行，以使所述至少一个处理器能够执行如上述的碱基簇亮度校正方法的步骤。
[0016]本申请还提供一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质上存储有实现碱基簇亮度校正方法的程序，所述碱基簇亮度校正方法的程序被处理器执行时实现如上述的碱基簇亮度校正方法的步骤。
[0017]本申请还提供一种计算机程序产品，包括计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如上述的碱基簇亮度校正方法的步骤。
[0018]本申请提供了一种碱基簇亮度校正方法、装置、电子设备及可读存储介质，也即，若检测到目标碱基簇图像中待校正碱基簇存在亮度串扰碱基簇，则获取所述亮度串扰碱基簇相对于所述待校正碱基簇的亮度串扰方向；确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表，其中，所述亮度值映射表用于存储与所述待校正碱基簇相距不同像素距离下的亮度串扰碱基簇的第一实际亮度值与亮度校正值之间的映射关系；在所述亮度值映射表中查询所述第一实际亮度值对应的亮度校正值；根据所述亮度校正值，对所述待校正碱基簇的第二实际亮度值进行校正，得到亮度校正结果。
[0019]本申请在对碱基簇亮度进行校正时首先检测目标碱基簇图像中的待校正碱基簇是否存在亮度串扰碱基簇，进而若检测到存在亮度串扰碱基簇，则获取亮度串扰碱基簇相对于待校正碱基簇的亮度串扰方向，从而确定亮度串扰方向上的亮度值映射表，由于亮度值映射表中存储有与待校正碱基簇相距不同像素距离下的亮度串扰碱基簇的实际亮度值和亮度校正值之间的映射关系，进而可基于亮度串扰碱基簇的实际亮度值查询到对应的亮度校正值，最终通过亮度校正值对待校正碱基簇的实际亮度值进行校正，也即，通过预先设置于亮度值映射表中不同碱基簇间在对应亮度串扰方向的不同像素距离下的亮度校正值，对目标碱基簇图像中待校正碱基簇进行亮度校正。
[0020]由于碱基簇间的方向及像素距离皆已确定，即，精准定位了碱基簇间的相对位置关系，从而可真实反馈碱基簇间的亮度串扰程度，所以，可针对性地根据亮度串扰程度获取亮度值映射表中存储的亮度校正值，即可实现基于碱基簇间的不同亮度串扰方向和不同像素距离对待校正碱基簇进行校正的目的。
[0021]基于此，本申请通过预先将碱基簇间不同亮度串扰方向及不同像素距离下的亮度校正值设置于亮度值映射表中，进而在针对于目标碱基图像中待校正碱基簇进行亮度校正时，可基于亮度串扰碱基簇确定待校正碱基簇与亮度串扰碱基簇之间的亮度串扰方向，进而确定亮度串扰方向上的亮度值映射表，并获取存储于亮度值映射表中待校正碱基簇与亮度串扰碱基簇之间相距对应像素距离下的亮度校正值，最终通过亮度校正值校正待校正碱基簇的亮度值，从而实现了通过不同亮度校正值对目标碱基簇图像碱基簇间进行分簇校正的目的，即，克服了由于碱基簇在生物芯片上是随机形成的，进而导致同一区域内的碱基簇
间的距离并不完全相同，这就使得依赖于同一亮度校正矩阵对某一图像区域内的碱基簇进行亮度校正时仍易出现亮度串扰的情况的技术缺陷，所以，提升了对于碱基簇进行亮度校正的校正精准性。
附图说明
[0022]此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分，示出了符合本申请的实施例，并与说明书一起用于解释本申请的原理。
[0023]为了更清楚地说明本申请实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员而言，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0024]图1为本申请实施例一提供的碱基簇亮度校正方法的流程示意图；
[0025]图2为本申请实施例一提供的碱基簇亮度校正方法的预设碱基簇坐标系下的轴间夹角示意图；
[0026]图3为本申请实施例一提供的碱基簇亮度校正方法的碱基簇最亮碱基像素点的亮度值为10000时拟合得到横竖方向上的亮度串扰模型示意图；
[0027]图4为本申请实施例一提供的碱基簇亮度校正方法的碱基簇最亮碱基像素点的亮度值为6000时拟本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种碱基簇亮度校正方法，其特征在于，所述碱基簇亮度校正方法包括：若检测到目标碱基簇图像中待校正碱基簇存在亮度串扰碱基簇，则获取所述亮度串扰碱基簇相对于所述待校正碱基簇的亮度串扰方向；确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表，其中，所述亮度值映射表用于存储与所述待校正碱基簇相距不同像素距离下的亮度串扰碱基簇的第一实际亮度值与亮度校正值之间的映射关系；在所述亮度值映射表中查询所述第一实际亮度值对应的亮度校正值；根据所述亮度校正值，对所述待校正碱基簇的第二实际亮度值进行校正，得到亮度校正结果。2.如权利要求1所述碱基簇亮度校正方法，其特征在于，所述确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表的步骤包括：获取所述待校正碱基簇和所述亮度串扰碱基簇在预设碱基簇坐标系下的碱基簇连线轴，其中，所述预设碱基簇坐标系以所述待校正碱基簇为基准构建得到；根据所述碱基簇连线轴与所述预设碱基簇坐标系的碱基簇基准轴的轴间夹角，确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表。3.如权利要求2所述碱基簇亮度校正方法，其特征在于，所述根据所述碱基簇连线轴与所述预设碱基簇坐标系的碱基簇基准轴的轴间夹角，确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表的步骤包括：获取所述目标碱基簇图像的图像标识，以及获取所述轴间夹角和预设夹角阈值之间的夹角大小关系；以所述图像标识和所述夹角大小关系共同为索引，查询得到所述亮度串扰方向上的亮度值映射表。4.如权利要求1所述碱基簇亮度校正方法，其特征在于，在所述确定所述亮度串扰方向上的亮度值映射表的步骤之前，所述碱基簇亮度校正方法还包括：在预设碱基簇图像中获取至少一个孤立碱基簇；对于任一所述孤立碱基簇，在所述孤立碱基簇的碱基簇中心点对应的碱基簇相邻区域内提取至少一个区域碱基像素点，其中，所述碱基簇相邻区域为以所述碱基簇中心点为中心，预设像素距离为半径的区域；对各所述区域碱基像素点进行亮度值排序，得到亮度值排序结果；将各所述孤立碱基簇的亮度值排序结果共同拟合得到的模型拟合参数输入至预设亮度串扰模型，得到亮度串扰模型；根据所述亮度串扰模型在不同亮度串扰方向上输出的亮度校正值，建立亮度值映射表。5.如权利要求4所述碱基簇亮度校正方法，其特征在于，所述在预设碱基簇图像中获取至少一个孤立碱基簇的步骤包括：通过对所述预设碱基簇图像进行区域分割，得到区域碱基簇；在所述区域碱基簇的碱基簇面积小于预设面积阈值时，检测所述区域碱基簇的长短轴比值是否不大于预设比值阈值；若是，则将...

【专利技术属性】
技术研发人员：唐苏明，
申请(专利权)人：中元汇吉生物技术股份有限公司，
类型：发明
国别省市：