一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用。本发明专利技术通过收集样本、进行全基因组扫描及数据分析，得到了与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物组合。在此基础上，本发明专利技术还提供了检测所述SNP标志组合物的引物和探针组合，以及能用于临床放射性脑损伤风险评估的试剂盒，联合年龄、肿瘤分期和脑部受照放疗剂量这三个因素，可以更加全面、精准地预测放射性脑损伤的发生风险，筛选出高危患者，以便针对放射性脑损伤高危患者提前采取保护措施，更有助于实现患者的放疗的个体化，减少放射性脑损伤对患者带来的不良影响，提高患者的长期生存质量，保证患者治疗效果。证患者治疗效果。证患者治疗效果。

【技术实现步骤摘要】
一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用


[0001]本专利技术属于放射肿瘤学和分子诊断
更具体地，涉及一种与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用。

技术介绍

[0002]放射性脑损伤是放射治疗所引起的最常见和最严重的不良反应之一，主要为不可逆的神经认知缺陷，包括学习和记忆功能障碍、进行性痴呆，极大地损害了患者的长期生活质量，严重时甚至危及生命。虽临床上可通过给予激素、神经节苷脂或胞二磷胆碱等药物治疗放射性脑损伤，但对大多数患者的疗效有限，只能减缓其进展。更为重要的还是针对放射性脑损伤高危患者提前采取保护措施，实现放射治疗的个体化，减少放射性脑损伤的发生，避免其带来的不良影响。
[0003]为了减少放射线对患者正常组织的损伤，放疗技术也在不断发展。目前，调强放疗(intensity modulated radiation therapy，IMRT)技术已经取代二维放射技术，被广泛地应用于临床治疗中。调强放疗的优点主要在于其能根据肿瘤靶区的形状，通过调节和控制射线在照射野内的强度分布产生不同剂量滴度来达到对肿瘤靶区给予致死性的高剂量照射，而对肿瘤周围正常组织则控制在正常耐受剂量以下。尽管技术的进步在一定程度上减少了不良反应的发生，但因部分患者对放射线更加的敏感，仍有2～16％的患者会发生放射性脑损伤。因此，开发可精准地对调强放疗引起的放射性脑损伤发生风险进行预测的产品，对高危个体提前采取针对性的预防措施，才是提高患者长期生存质量的重要方向。
[0004]现虽已有许多研究发现年龄、肿瘤的分期、放疗技术、脑部受照高剂量辐射等与放射性脑损伤的发生风险相关，也有基于上述相关因素进行放射性脑损伤发生风险预测的报道。然而，即使在相似的生理状态和治疗手段下，放射性脑损伤的发生及严重程度在不同的个体患者中仍存在差异。此外，之前的用于放射性脑损伤发生风险预测的产品多是基于常规放疗(二维放射治疗)，无法准确的知道患者脑部接受了多少放射剂量，缺少了放射剂量的校正，基于遗传因素对于放射性脑损伤的预测效果也会受限。即现有技术难以有效、精准地预测调强放疗中放射性脑损伤发生的风险。

技术实现思路

[0005]本专利技术要解决的技术问题是克服现有上述技术的缺陷和不足，提供一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物及其应用。
[0006]本专利技术的第一个目的是提供一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物。
[0007]本专利技术的第二个目的是提供用于检测所述的SNP标志物的引物和探针组合。
[0008]本专利技术的第三个目的是提供检测所述SNP标志物中的一个或几个的试剂在制备用于预测调强放疗引起的放射性脑损伤发生风险的产品中的应用。
[0009]本专利技术的第四个目的是提供一种用于预测调强放疗引起的放射性脑损伤发生风险的试剂盒。
[0010]本专利技术的第五个目的是提供一种用于预测调强放疗引起的放射性脑损伤发生风险的预测系统。
[0011]本专利技术上述目的通过以下技术方案实现：
[0012]本专利技术提供了一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物，所述标志物为rs115024532、rs72983425、rs744638、rs74395517、rs7651338、rs6778165、rs13098783、rs13098229、rs1487565、rs2168162、rs11956028、rs13160179、rs7752216、rs12718495、rs1996160、rs142427408、rs140305665、rs12547731、rs1509857、rs13295411、rs996621、rs11031136、rs12299219、rs656443、rs145844064、rs2143965、rs7156815、rs16941725、rs35309613、rs7499422、rs75346353、rs78344060、rs8107828、rs59700394、rs136422、rs738423、rs2350237、rs144375344中的一个或几个。
[0013]本专利技术还提供了一种用于检测所述的SNP标志物的引物和探针组合，包括如下组分：
[0014](1)用于检测rs11031136的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.1～2所示，探针序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示；
[0015](2)用于检测rs115024532的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.5～6所示，探针序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示；
[0016](3)用于检测rs11956028的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.9～10所示，探针序列如SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示；
[0017](4)用于检测rs12299219的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.13～14所示，探针序列如SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16所示；
[0018](5)用于检测rs12547731的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.17～18所示，探针序列如SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20所示；
[0019](6)用于检测rs12718495的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.21～22所示，探针序列如SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24所示；
[0020](7)用于检测rs13098229的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.25～26所示，探针序列如SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28所示；
[0021](8)用于检测rs13098783的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.29～30所示，探针序列如SEQ ID NO.31和SEQ ID NO.32所示；
[0022](9)用于检测rs13160179的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.33～34所示，探针序列如SEQ ID NO.35和SEQ ID NO.36所示；
[0023](10)用于检测rs13295411的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.37～38所示，探针序列如SEQ ID NO.39和SEQ ID NO.40所示；
[0024](11)用于检测rs136422的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.41～42所示，探针序列如SEQ ID NO.43和SEQ ID NO.44所示；
[0025](12)用于检测rs140305665的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.45～46所示，探针序列如SEQ ID NO.47和SEQ ID NO.48所示；
[0026](13)用于检测rs142427408的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.49～50所示，
探针序列如SEQ ID本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组与调强放疗引起的放射性脑损伤相关的SNP标志物，其特征在于，所述SNP标志物为rs115024532、rs72983425、rs744638、rs74395517、rs7651338、rs6778165、rs13098783、rs13098229、rs1487565、rs2168162、rs11956028、rs13160179、rs7752216、rs12718495、rs1996160、rs142427408、rs140305665、rs12547731、rs1509857、rs13295411、rs996621、rs11031136、rs12299219、rs656443、rs145844064、rs2143965、rs7156815、rs16941725、rs35309613、rs7499422、rs75346353、rs78344060、rs8107828、rs59700394、rs136422、rs738423、rs2350237、rs144375344中的一个或几个。2.一种用于检测权利要求1所述的SNP标志物的引物和探针组合，其特征在于，包括如下组分：(1)用于检测rs11031136的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.1～2所示，探针序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示；(2)用于检测rs115024532的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.5～6所示，探针序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示；(3)用于检测rs11956028的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.9～10所示，探针序列如SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示；(4)用于检测rs12299219的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.13～14所示，探针序列如SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16所示；(5)用于检测rs12547731的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.17～18所示，探针序列如SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20所示；(6)用于检测rs12718495的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.21～22所示，探针序列如SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24所示；(7)用于检测rs13098229的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.25～26所示，探针序列如SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28所示；(8)用于检测rs13098783的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.29～30所示，探针序列如SEQ ID NO.31和SEQ ID NO.32所示；(9)用于检测rs13160179的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.33～34所示，探针序列如SEQ ID NO.35和SEQ ID NO.36所示；(10)用于检测rs13295411的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.37～38所示，探针序列如SEQ ID NO.39和SEQ ID NO.40所示；(11)用于检测rs136422的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.41～42所示，探针序列如SEQ ID NO.43和SEQ ID NO.44所示；(12)用于检测rs140305665的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.45～46所示，探针序列如SEQ ID NO.47和SEQ ID NO.48所示；(13)用于检测rs142427408的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.49～50所示，探针序列如SEQ ID NO.51和SEQ ID NO.52所示；(14)用于检测rs144375344的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.53～54所示，探针序列如SEQ ID NO.55和SEQ ID NO.56所示；(15)用于检测rs145844064的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.57～58所示，探针序列如SEQ ID NO.59和SEQ ID NO.60所示；
(16)用于检测rs1487565的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.61～62所示，探针序列如SEQ ID NO.63和SEQ ID NO.64所示；(17)用于检测rs1509857的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.65～66所示，探针序列如SEQ ID NO.67和SEQ ID NO.68所示；(18)用于检测rs16941725的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.69～70所示，探针序列如SEQ ID NO.71和SEQ ID NO.72所示；(19)用于检测rs1996160的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.73～74所示，探针序列如SEQ ID NO.75和SEQ ID NO.76所示；(20)用于检测rs2143965的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.77～78所示，探针序列如SEQ ID NO.79和SEQ ID NO.80所示；(21)用于检测rs2168162的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.81～82所示，探针序列如SEQ ID NO.83和SEQ ID NO.84所示；(22)用于检测rs2350237的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.85～86所示，探针序列如SEQ ID NO.87和SEQ ID NO.88所示；(23)用于检测rs35309613的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.89～90所示，探针序列如SEQ ID NO.91和SEQ ID NO.92所示；(24)用于检测rs59700394的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.93～94所示，探针序列如SEQ ID NO.95和SEQ ID NO.96所示；(25)用于检测rs656443的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.97～98所示，探针序列如SEQ ID NO.99和SEQ ID NO.100所示；(26)用于检测rs67781655的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.101～102所示，探针序列如SEQ ID NO.103和SEQ ID NO.104所示；(27)用于检测rs7156815的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.105～106所示，探针序列如SEQ ID NO.107和SEQ ID NO.108所示；(28)用于检测rs72983425的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.109～110所示，探针序列如SEQ ID NO.111和SEQ ID NO.112所示；(29)用于检测rs738423的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.113～114所示，探针序列如SEQ ID NO.115和SEQ ID NO.116所示；(30)用于检测rs74395517的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.117～118所示，探针序列如SEQ ID NO.119和SEQ ID NO.120所示；(31)用于检测rs744638的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.121～122所示，探针序列如SEQ ID NO.123和SEQ ID NO.124所示；(32)用于检测rs7499422的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.125～126所示，探针序列如SEQ ID NO.127和SEQ ID NO.128所示；(33)用于检测rs75346353的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.129～130所示，探针序列如SEQ ID NO.131和SEQ ID NO.132所示；(34)用于检测rs7651338的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.133～134所示，探针序列如SEQ ID NO.135和SEQ ID NO.136所示；(35)用于检测rs7752216的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.137～138所示，探针
序列如SEQ ID NO.139和SEQ ID NO.140所示；(36)用于检测rs78344060的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.141～142所示，探针序列如SEQ ID NO.143和SEQ ID NO.144所示；(37)用于检测rs8107828的引物和探针，其引物序列如SEQ ID NO.145～146所示，探针序列如SEQ ID NO....

【专利技术属性】
技术研发人员：贾卫华，何永巧，杨大伟，王曈旻，
申请(专利权)人：中山大学肿瘤防治中心中山大学附属肿瘤医院，中山大学肿瘤研究所，
类型：发明
国别省市：