靶向爱泼斯坦-巴尔病毒的TCR-T细胞疗法制造技术

提供识别或结合爱泼斯坦

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】靶向爱泼斯坦
‑
巴尔病毒的TCR
‑
T细胞疗法


[0001]本公开大体上涉及工程化细胞和其组合物，特别是包含基因工程化T细胞受体(TCR)的T细胞。本文还公开了使用所述组合物治疗癌症的方法。

技术介绍

[0002]爱泼斯坦巴尔病毒(Epstein
‑
Barr virus；EBV)是可感染人类的疱疹病毒家族的成员。EBV最常通过体液、主要是唾液传播。EBV可引起传染性单核细胞增多症(mononucleosis)，也称为mono，以及包括癌症的其它疾病。EBV已进化出模仿抗原激活的B细胞的天然分化途径的生命周期，使病毒能够进入其潜伏感染的部位。在增殖感染的B细胞中，爱泼斯坦
‑
巴尔病毒(EBV)执行基因表达程序，即“生长”或“潜伏期III”程序。这种类型的潜伏期发现于体外EBV诱导的类淋巴母细胞细胞系(LCL)、移植后淋巴增殖性疾病(Brink AA,1997,J Clin Pathol 50:911
–
918.)以及原发性和持续性EBV感染期间淋巴器官中的EBV感染的B细胞中，其中这个程序被认为通过受感染的细胞的增殖导致EBV载量的扩增(Young LS,2004,Nat Rev Cancer 4:757
–
768；Hochberg D,2004,Proc Natl Acad Sci U S A101:239
–
244)。称为潜伏膜蛋白(LMP1、LMP2A、LMP2B)和爱泼斯坦
‑<br/>巴尔核抗原(EBNA1、
‑
2、
‑
3A、
‑
3B、
‑
3C、
‑
LP)的几种免疫原性EBV抗原在潜伏期III EBV感染的B细胞中表达。
[0003]EBV感染与某些类型的癌症相关。已在患有鼻咽癌(Mutirangura等人,Clin Cancer Res.4:665
‑
9(1998)；Lo等人,Cancer Res.59:1188
‑
91(1999))、淋巴瘤(Lei等人,Br J Haematol.111:239
‑
46(2000)；Gallagher等人,Int J Cancer.84:442
‑
8(1999)；Dronet等人,J Med Viral.57:383
‑
9(1999))、乳腺癌(Bonnet,M.等人,J.Natl.Cancer Inst.,91:1376
‑
1381(1999))和肝细胞癌(Sugawara,Y.等人,Virology,256:196
‑
202(1999))的患者中发现EBV DNA。
[0004]作为针对癌症的免疫疗法的模式的过继细胞转移(ACT)已在治疗血液系统恶性肿瘤和恶性黑色素瘤方面显示出显著的成功。使用表达嵌合抗原受体(CAR)的基因修饰的T细胞以特异性靶向肿瘤相关抗原(TAA)如CD19或GD2的一种ACT形式已在用于治疗例如B细胞恶性肿瘤等疾病的临床试验中显示出令人鼓舞的结果。尽管CAR T细胞疗法在患有血液系统恶性肿瘤的患者中的这种已记录的成功，但针对实体瘤仅观察到适度的反应。因此，需要靶向EBV诱导的癌症的有效TCR
‑
T细胞疗法。

技术实现思路

[0005]本公开提供一种工程化T细胞，其包含编码抗LMP2 TCR的核酸，其中所述抗LMP2 TCR是与肿瘤中LMP2特异性结合的基因工程化T细胞受体(TCR)。
[0006]在一方面，本文提供一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其包含含有可变α(Va)区和的α链和含有可变β(Vb)区的β链。在一些实施方案中，Va区包含互补决定区1(CDR1)、互补决定区2(CDR2)和互补决定区3(CDR3)。在一些实施方案中，Va区的CDR3包含氨基酸序列X1GX2SGYSTL，其中X1是E、T、Q、V或N；X2是D、G、N或E。在一些实施方案中，Vb区包含
CDR1、CDR2和CDR3。在一些实施方案中，Vb区的CDR3包含氨基酸序列X3X4QGGX5X6X7X8，其中X3是S、T、N或R；X4是T、R、Y、G、V、Q、F、S或P；X5是N、G、H、T、S、A、I或W；X6是Y、N、D、E、R或I，；X7是G、Q、N、Y；X8是Y、F、或G。
[0007]在一些实施方案中，Va区由来自人TRAV基因区段和人TRAJ基因区段的重排的序列编码，和Vb区由来自人TRBV基因区段、任选地人TRBD基因区段和人TRBJ基因区段的重排的序列编码。在一些实施方案中，TRAV基因区段是TRAV17；TRAJ基因区段是TRAJ11；TRBV基因区段是TRBV6
‑
5；TRBD基因区段是TRBD1或TRBD2；和TRBJ基因区段是TRBJ2
‑
1或TRBJ1
‑
2。
[0008]在一些实施方案中，Va CDR1区包含与TSINN(SEQ ID NO:1)为至少80％同一性的氨基酸序列，Va CDR2区包含与IRSNERE(SEQ ID NO:2)为至少80％同一性的氨基酸序列，Vb CDR1区包含与MNHEY(SEQ ID NO:4)为至少80％同一性的氨基酸序列，和Vb CDR2区包含与SVGAGI(SEQ ID NO:5)为至少80％同一性的氨基酸序列。
[0009]在一些实施方案中，Va CDR1区包含与选择的Va CDR1氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，Va CDR2区包含与选择的Va CDR2氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，Va CDR3区包含与选择的Va CDR3氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，Vb CDR1区包含与选择的Vb CDR1氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，Vb CDR2区包含与选择的Vb CDR2氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，Vb CDR3区包含与选择的Vb CDR3氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，选择的Va CDR 1、2和3以及Vb CDR 1、2和3氨基酸序列是以下中的一种：
[0010](1)选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:1
‑
3，和选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:4
‑
6；
[0011](2)选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:7
‑
9，和选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:10
‑
12；
[0012](3)选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:13
‑
15，和选择的V本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其包含含有可变α(Va)区和的α链和含有可变β(Vb)区的β链，其中(a)所述Va区包含互补决定区1(CDR1)、互补决定区2(CDR2)和互补决定区3(CDR3)，其中所述Va区的所述CDR3包含氨基酸序列X1GX2SGYSTL，其中所述X1是E、T、Q、V或N，所述X2是D、G、N或E；和(b)所述Vb区包含CDR1、CDR2和CDR3，其中所述Vb区的所述CDR3包含氨基酸序列X3X4QGGX5X6X7X8，其中所述X3是S、T、N或R，所述X4是T、R、Y、G、V、Q、F、S或P，所述X5是N、G、H、T、S、A、I或W，所述X6是Y、N、D、E、R或I，所述X7是G、Q、N、Y，所述X8是Y、F、或G。2.根据权利要求1所述的T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其中所述Va区由来自人TRAV基因区段和人TRAJ基因区段的重排的序列编码，和所述Vb区由来自人TRBV基因区段、任选地人TRBD基因区段和人TRBJ基因区段的重排的序列编码，其中所述TRAV基因区段是TRAV17；所述TRAJ基因区段是TRAJ11；所述TRBV基因区段是TRBV6
‑
5；所述TRBD基因区段是TRBD1或TRBD2；和所述TRBJ基因区段是TRBJ2
‑
1或TRBJ1
‑
2。3.根据权利要求1或2所述的T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其中所述Va CDR1区包含与TSINN(SEQ ID NO:1)为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR2区包含与IRSNERE(SEQ ID NO:2)为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR1区包含与MNHEY(SEQ ID NO:4)为至少80％同一性的氨基酸序列，和所述Vb CDR2区包含与SVGAGI(SEQ ID NO:5)为至少80％同一性的氨基酸序列。4.根据权利要求1
‑
3中任一项所述的T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其中所述Va CDR1区包含与选择的Va CDR1氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR2区包含与选择的Va CDR2氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR3区包含与选择的Va CDR3氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列；和其中所述Vb CDR1区包含与选择的Vb CDR1氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR2区包含与选择的Vb CDR2氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR3区包含与选择的Vb CDR3氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列；其中所述选择的Va CDR 1、2和3以及Vb CDR 1、2和3氨基酸序列是以下中的一种：(1)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:1
‑
3，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:4
‑
6；(2)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:7
‑
9，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:10
‑
12；
(3)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:13
‑
15，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:16
‑
18；(4)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:19
‑
21，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:22
‑
24；(5)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:25
‑
27，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:28
‑
30；(6)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:31
‑
33，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:34
‑
36；(7)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:37
‑
39，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:40
‑
42；(8)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:43
‑
45，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:46
‑
48；(9)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:49
‑
51，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:52
‑
54；(10)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:61
‑
63，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:64
‑
66；(11)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:67
‑
69，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:70
‑
72；(12)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:73
‑
75，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:76
‑
78；(13)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:79
‑
81，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:82
‑
84；或(14)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:85
‑
87，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:88
‑
90。5.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其包含含有可变α(Va)区的α链，其中所述Va区包含互补决定区1(CDR
‑
1)、互补决定区2(CDR
‑
2)和互补决定区3(CDR
‑
3)，其中所述Va CDR1区包含与SEQ ID NO:55为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR2区包含与SEQ ID NO:56为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR3区包含与SEQ IDNO:57为至少80％同一性的氨基酸序列；和含有可变β(Vb)区的β链，其中所述Vb区包含互补决定区1(CDR
‑
1)、互补决定区2(CDR
‑
2)和互补决定区3(CDR
‑
3)，其中所述Vb CDR1区包含与SEQ ID NO:58为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR2区包含与SEQ ID NO:59为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR3区包含与SEQ IDNO:60为至少80％同一性的氨基酸序列。6.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的TCR或其抗原结合片段，其中所述TCR或其抗原结合片段结合或识别由主要组织相容性复合体(MHC)分子呈递的LMP2(FLYALALLL)(SEQ ID NO:139)的肽表位。7.根据权利要求6所述的TCR或其抗原结合片段，其中所述MHC分子是HLA
‑
A2分子。8.根据权利要求1所述的T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其中所述Va区由来自人TRAV基因区段和人TRAJ基因区段的重排的序列编码，和所述Vb区由来自人TRBV基因区段、
任选地人TRBD基因区段和人TRBJ基因区段的重排的序列编码，其中所述TRAV基因区段是TRAV21；所述TRAJ基因区段是TRAJ33；所述TRBV基因区段是TRBV10
‑
2；所述TRBD基因区段是TRBD1或TRBD2；和所述TRBJ基因区段是TRBJ2
‑
7。9.根据权利要求1或8所述的T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其中所述Va CDR1区包含与SEQ ID NO:143为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR2区包含与SEQ ID NO:144为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR3区包含与SEQ ID NO:145为至少80％同一性的氨基酸序列；和其中所述Vb CDR1区包含与SEQ ID NO:146为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR2区包含与SEQ ID NO:147为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR3区包含与SEQ ID NO:148为至少80％同一性的氨基酸序列。10.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其包含含有可变α(Va)区的α链，其中所述Va区包含互补决定区1(CDR
‑
1)、互补决定区2(CDR
‑
2)和互补决定区3(CDR
‑
3)，其中所述Va CDR1区包含与SEQ ID NO:143为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR2区包含与SEQ ID NO:144为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR3区包含与SEQ ID NO:145为至少80％同一性的氨基酸序列；和含有可变β(Vb)区的β链，其中所述Vb区包含互补决定区1(CDR
‑
1)、互补决定区2(CDR
‑
2)和互补决定区3(CDR
‑
3)，其中所述Vb CDR1区包含与SEQ ID NO:146为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR2区包含与SEQ ID NO:147为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR3区包含与SEQ ID NO:148为至少80％同一性的氨基酸序列。11.根据权利要求1和8
‑
10中任一项所述的TCR或其抗原结合片段，其中所述TCR或其抗原结合片段结合或识别由主要组织相容性复合体(MHC)分子呈递的LMP2 CLGGLLTMV(SEQ ID NO:167)和/或SLGGLLTMV(SEQ IDNO:168)的肽表位。12.根据权利要求11所述的TCR或其抗原结合片段，其中所述MHC分子是HLA
‑
A2分子。13.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合片段，其包含含有可变α(Va)区的α链，其中所述Va区包含互补决定区1(CDR
‑
1)、互补决定区2(CDR
‑
2)和互补决定区3(CDR
‑
3)，其中所述Va CDR1区包含与选择的Va CDR1氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR2区包含与选择的Va CDR2氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Va CDR3区包含与选择的Va CDR3氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列；和含有可变β(Vb)区的β链，其中所述Vb区包含互补决定区1(CDR
‑
1)、互补决定区2(CDR
‑
2)和互补决定区3(CDR
‑
3)，其中所述Vb CDR1区包含与选择的Vb CDR1氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR2区包含与选择的Vb CDR2氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列，所述Vb CDR3区包含与选择的Vb CDR3氨基酸序列为至少80％同一性的氨基酸序列；其中所述选择的Va CDR 1、2和3以及Vb CDR 1、2和3氨基酸序列是以下中的一种：(1)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:91、92和93，和所述
选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:94、95和96；(2)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:97、98和99，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:100、101和102；(3)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:103、104和105，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:106、107和108；(4)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:149、150和151，和所述选择的Vb CDR 1、2和3氨基酸序列分别记载于SEQ ID NOs:152、153和154；和(5)所述选择的Va CDR 1、2和3氨基酸序列分别记...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴海阳，周杰，邓大川，李思，赵丽霞，张璐，陈锐，保罗，
申请(专利权)人：天科雅生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：