等温扩增核酸的结果判定方法、系统、设备及存储介质技术方案

本发明专利技术提出了一种等温扩增核酸的结果判定方法、系统、设备及存储介质，在上样后待测样本确定样本源后确定目标基因的方法包括：获取反应检测体系中每单位时间点采集的用于绘制非线性函数曲线的信号数据集；收集某一时刻前的第一信号数据集，通过第一信号数据集的信号增速判断非线性函数曲线存在或不存在扩增分界点，确定所述某一时刻的非线性函数曲线类型；收集某一时刻前的第二信号数据集，通过第二信号数据集的信号同比增速确定对于非线性函数曲线类型匹配的准确度以及是否符合阳性样本特征。本发明专利技术通过设置的多级判定方法输出判定结果，可提高等温扩增核酸结果判定的效率和准确性，还能应用于其他反应结果判定，具有较好的应用前景。较好的应用前景。较好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】
等温扩增核酸的结果判定方法、系统、设备及存储介质


[0001]本专利技术涉及计算机
，具体涉及一种等温扩增核酸的结果判定方法、系统、设备及存储介质。

技术介绍

[0002]目前核酸扩增和检测技术在生物技术、基础科学、医学研究等领域内均有广泛的应用研究。核酸扩增检测是通过酶的作用将待检核酸序列进行扩增，然后检出的方法。核酸扩增技术包括常规PCR、实时荧光PCR、数字PCR以及目前临床伴随诊断(POCT)技术流行的等温扩增技术，如LAMP、CPA技术等。
[0003]上述检测方法会产生大量的原始数据值，数据处理方法的不同可能会显著的影响最终的结果，无法精确判定检测结果，例如在公开号为CN112852929A的专利文献中提供了一种用于检测DNA的组合产品，尽管可以通过搭配多种等温扩增方法并通过单链探针放大实现信号放大，但是对于数据处理方法可能对处理检测数据的判别结果产生影响时的容错性还需进一步研究。

技术实现思路

[0004]为解决现有技术中等温扩增核酸检测结果判定存在的缺陷，本专利技术提出一种等温扩增核酸的结果判定方法本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，在上样后待测样本通过内标确定样本源，所述上样反应后通过靶标基因确定目标基因的方法包括：获取与所述反应后相关的信号数据集，所述信号数据集包括反应检测体系中每单位时间点采集的信号数据，所述信号数据用于绘制非线性函数曲线；收集某一时刻前的第一信号数据集，通过所述第一信号数据集的信号增速判断所述非线性函数曲线存在或不存在扩增分界点，以及确定所述某一时刻的所述非线性函数曲线类型，所述第一信号数据集至少包括四个连续的信号数据；收集所述某一时刻前的第二信号数据集，通过所述第二信号数据集的信号同比增速确定对于所述非线性函数曲线类型匹配的准确度以及是否符合阳性样本特征，所述第二信号数据集至少包括四个连续的第一信号数据集。2.根据权利要求1所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述在上样后待测样本通过内标确定样本源包括：通过IC内标确定待测样本是否符合样本来源的测试要求，若是，继续执行检测，若否，则终止检测。3.根据权利要求1所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述上样反应后通过靶标基因确定目标基因为判定所述靶标基因的非线性函数曲线是否符合阳性S型曲线特征，若是则终止检测并输出阳性检测结果，若否则遍历全部非线性函数曲线直至输出阳性检测结果后终止检测，若遍历全部扩增曲线无阳性检测结果则输出阴性检测结果。4.根据权利要求1所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述收集某一时刻前的第一信号数据集，基于某一时刻收集所述某一时刻前相邻单位时间间隔的信号数据作为第一信号数据集。5.根据权利要求4所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述通过所述第一信号数据集的信号增速判断所述非线性函数曲线存在或不存在扩增分界点包括：通过信号增速公式计算所述第一信号数据集中全部时间点的信号数据对应的信号增速，所述信号增速的计算公式为：；其中，表示某一时刻信号数据对应的信号增速，表示某一时刻对应的信号数据，表示某一时刻的前i个单位时间点的信号数据，t表示某一时刻对应的时间点，i表示某一时刻的前i个单位时间点对应的时间点；判断所述第一信号数据集中连续单位时间间隔的信号数据对应的信号增速与第一阈值间的数量关系，若信号增速大于或等于第一阈值，则将本次判断结果记为一次，并累加进第一累积值中，若信号增速小于第一阈值，则终止检测并重新采集其他时刻前的第一信号数据集；预设第一累积阈值，若所述第一累积值大于或等于所述第一累积阈值，则确定所述非线性函数曲线存在扩增分界点，记录所述扩增分界点对应的时间点Findex并执行下一步检测，若否则所述非线性函数曲线不存在扩增分界点，返回重新采集第一信号数据集进行检
测直至出现扩增分界点。6.根据权利要求5所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述确定所述某一时刻的所述非线性函数曲线类型包括：若所述非线性函数曲线存在扩增分界点，计算所述时间点Findex到所述信号数据第0时刻间的距离长度F0t；预设所述非线性函数曲线的基线期时间段对应的最小长度BMinlen；比较所述距离长度F0t与最小长度BMinlen间的数量关系，若所述距离长度F0t大于或等于最小长度BMinlen，则确定所述某一时刻的所述非线性函数曲线类型为S型曲线，若否，则终止检测并重新采集其他时刻前的第一信号数据集。7.根据权利要求6所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述收集所述某一时刻前的第二信号数据集，通过所述第二信号数据集的信号同比增速确定对于所述非线性函数曲线类型匹配的准确度以及是否符合阳性样本特征包括:基于确定的所述某一时刻的时间起点，收集某一时刻前若干相邻的相同单位时间点间隔的第一信号数据集组成第二信号数据集；计算所述第二信号数据集中所述相同单位时间点间隔的第一信号数据集所中信号数据的均值，通过相邻单位时间点间隔的均值计算所述第二信号数据集中每个第一信号数据集对应的信号同比增速;判断所述第二信号数据集中连续单位时间间隔的第一信号数据集对应的信号同比增速与第二阈值间的数量关系，若信号同比增速大于或等于第二阈值，则将本次判断结果记为一次，并累加进第二累积值中，若信号同比增速小于第二阈值，则终止检测并重新采集信号数据；预设第二累积阈值，若所述第二累积值大于或等于所述第二累积阈值，则确定所述非线性函数曲线为阳性曲线，若否，则终止检测并重新采集信号数据。8.根据权利要求7所述的等温扩增核酸的结果判定方法，其特征在于，所述均值的计算公式为：；所述信号同比增速计算公式为：；其中，表示某一时刻起第一信号数据集的均值，表示某一时刻对应的信号数据，表示某一时刻的前i个单位时间点的信号数据，t表示某一时刻对应的时间点，i表示某一时刻的前i个单位时间点对应的时间点，表示某一时刻起相邻单位时间点间隔的第一信号数据集的均值，表示某一时刻起相邻单位时间点间隔第一信号数据集中对应的信号数据，且所述信号数据的起始时间点为所述扩增分界点对应的时间点Findex，
表示某一时刻起相邻单位时间点间隔第一信号数据集中对应的前s个单位时间点的信号数据，i...

【专利技术属性】
技术研发人员：葛永兵，贺志民，陈翀，
申请(专利权)人：广州普世君安生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：