【技术实现步骤摘要】
基于ARL6IP5基因及关联基因的肿瘤免疫疗效预测模型
[0001]本专利技术涉及生物信息学和生物医学，具体涉及瘤免疫疗效预测模型的制备。
技术介绍
[0002]目前研究认为肿瘤是仅次于心血管疾病的第二大死因，恶性肿瘤更是新世纪危害人类健康的主要疾病之一，也是全球较大的公共卫生问题之一，给社会带来极大的疾病负担。肿瘤是多种因素长期共同作用引发的基因异常疾病。当机体受到环境中的化学、物理、病毒等致癌物质的影响，和/或因自身遗传、内分泌、性别、年龄等因素的作用，发生一系列基因异常改变，形成肿瘤。肿瘤患者的临床表现与瘤体性质、部位、生长速度等因素有关。病变早期多无显著症状，随瘤体增长，出现肿块、疼痛、出血、梗阻等局部症状，以及发热、乏力、贫血、消瘦等全身症状。
[0003]各种肿瘤治疗的手段有化疗、靶向治疗、手术治疗、放疗、生物疗法等，肿瘤患者在肿瘤治疗中得到一定受益；但是肿瘤治疗策略中仍存在一些失误，这些失误不仅使患者遭受不少治疗之苦，而且在部分肿瘤中预后得不到很好的改善，又因为治疗费用高，最终结果导致患者生活质量下降，...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种制备肿瘤患者免疫治疗敏感性预测模型的方法，所述方法包括如下步骤：S01数据获取：获取免疫治疗患者病理组织的二代测序转录组的ARL6IP5基因及其关联基因的TPM表达值和患者免疫治疗疗效的实际诊断值；S02构建模型：将上述两个值作为预变量数据输入层输入神经网络模型，在神经网络模型中的隐藏层进行数据拟合；通过输出层输出一组0到1之间的数值；经过训练优化后形成肿瘤患者免疫治疗的预后模型；S03评估模型性能：以受试者工作特征曲线下面积(area under the receiver operating curve，AUC)来评估模型性能；当AUC大于0.5时，模型具有预测价值，且越接近于1，预测效能越强。2.如权利要求1所述制备肿瘤患者免疫治疗敏感性预测模型的方法，其特征在于，所述ARL6IP5基因及其关联基因共853个基因，如下所示：TANK，FCGR1C，PDCD6IP，SRRM5，SH2B3，C2CD4D，TROAP，PARP3，TOM1L1，SLFN12L，ABCB6，CDH11，ARPC4，ACTR2，ARPC2，RASGRP1，PLXNC1，TRIM28，LPAR6，CDK3，LHFPL2，MPZL2，PLIN3，IGSF6，SF3B4，CDK2AP2，ZNF267，CNPY2，TRIM22，BTN3A3，PEMT，CLEC10A，TIMM44，PFDN6，TADA3，CAP1，CRTAP，MYBBP1A，NOP56，ATG7，ARL6IP5，SLC34A2，TXNRD2，CDC42EP3，MYL12A，TAF6L，CD226，TNFSF13B，CTSC，NEK6，CYSLTR1，STARD10，FAM114A2，HCP5，CD300C，PPARGC1A，TXNL4A，GADD45G，EHMT2，HNRNPA0，RAB32，GLIPR1，RAB31，ADRM1，BTN3A1，CAPN10，KPTN，PTP4A3，CHKA，KLHL2，LYST，SLCO2B1，ADAT3，GPN1，VSIG4，TMEM106A，RNF13，TWF2，CMTM1，LACTB，NLRP3，MAL2，CARD16，TMEM200A，SLC25A26，FCHO2，ZMYND19，ARAP2，TAGAP，PIK3AP1，ANKRD22，AGAP4，CLK3，GYLTL1B，CCR1，CCR5，CCR6，CCR8，DCUN1D3，CMTM3，SNX20，TTC39C，IRGQ，ZNF428，CNN3，DRAM2，C1orf162，DIS3L2，MBOAT2，SGPP2，ZNF513，PQLC3，CD200R1，DCBLD2，KLF6，TMEM42，SLC31A2，ADK，PPM1M，OCIAD2，GNPDA2，C4orf36，EMB，ADORA2B，CREBL2，HDX，ADORA3，NEK7，C20orf96，CRYBB1，PARP4，CSF1R，CSF2RA，CSF2RB，LOC145837，C15orf61，CTNNB1，LSM14B，YDJC，CTSB，SLC16A14，CTSO，CTSS，CX3CR1，SH3D19，RASGEF1B，CYBB，SH3RF2，CYLD，LOC154761，VKORC1L1，CXorf38，DAB2，CLECL1，SPRED1，SLFN5，DCN，BBS12，MMAA，SGMS2，PAPD4，DACT2，C10orf128，DNMT3A，DOCK2，DPP4，DPYD，DR1，DVL2，GPR183，AHR，MPZL3，ANO6，FAM24B，AIF1，SERPINB1，ELF1，TMEM201，ELK3，EMP1，EMP3，AIM1，GAPT，STK32A，ENO3，NAIF1，STOM，ESRRA，ETV1，EVI2A，EVI2B，F13A1，SAMD9L，FCER1G，FCGR1A，FCGR1B，FCGR2A，FCGR2B，BEND6，FCGR3A，LEMD2，ZBTB12，C6orf136，TFEC，FKBP2，NINL，ACIN1，TNIK，ENDOD1，RAP1GAP2，FRMD4B，FLNA，ANKRD28，DPY19L1，ESYT1，FRAT2，FBXO46，TDRD7，TRAM1，FOLR2，SCRIB，MORC3，ARL2BP，FPR1，TMEM50A，FPR3，CLEC5A，CORO1C，HSPBP1，STX12，RAB38，SDF2L1，PPIL2，ALOX5，ALOX5AP，IFIT5，NAALADL2，MBLAC1，NAPSB，LYSMD2，PRPF40B，VAX2，RHBDD3，TNFAIP8，RNF19A，RCHY1，SAMHD1，TIPARP，CHMP2B，RNF167，SPATS2L，RAB11FIP5，CCDC9，IRF2BP1，GIMAP2，PTPN22，GMEB2，FBXL3，PHGDH，FBXL5，TSPAN17，FBXO8，GBE1，GBP2，GBP3，MYOF，TIMM13，DAZAP1，OSTF1，BSCL2，GPR110，OPLAH，RNF11，TPK1，NPTN，SIGLEC7，PELP1，DAPP1，SIGLEC9，SRPX2，HPGDS，APOBEC3C，GLI4，MAT2B，GNA15，GNAI2，GNG10，SNHG10，CDRT4，C19orf54，SIRPB2，RNF149，DLL1，IAH1，C3orf38，DPH3，GPR34，FAM115C，ZNF775，GPS2，GPX1，OSTM1，NDUFAF4，RANGRF，CD274，GSTP1，BRF1，USP25，ICOS，SNX10，SNX11，DSE，MDFIC，PILRA，GLTSCR1，SH3KBP1，SLC40A1，ANXA2，ANXA2P1，
ANXA2P2，NCKAP1L，ANXA5，EHD4，HIF1A，HLA
‑
B，HLA
‑
DMB，HLA
‑
DOA，HLA
‑
DPA1，HLA
‑
DPB1，HLA
‑
DQA1，HLA
‑
DQA2，HLA
‑
DRA，HLA
‑
DRB1，MR1，HMGB3，HNMT，EIF4E3，SLC29A2，DDX51，HRH1，APEH，ICAM1，B4GALNT4，IRF8，TMEM173，IDH3B，IDS，IFI16，IFNAR1，IFNAR2，IFNGR1，IFNGR2，AMIGO2，TICAM2，FAS，IL7，IL7R，IL10RB，IL15，TNFRSF9，IL18，ILF3，IMPA2，CXCL10，IRAK2，IRF2，ITGA1，ITGA2，ITGA3，ITGA4，ITGAM，ITGAV，ITGB2，ITGB6，ACADVL，ITPA，JAK1，JAK2，TRIM23，AREG，LOC374443，WASH3P，SFT2D2，RBM43，KCNJ11，ARF4，KCNN4，RHOA，THEMIS，TMEM189，TMEM81，RHOC，LAIR1，LAMP2，LCP1，LCP2，LGALS3，ARHGDIB，C4orf3，LNPEP，LUM，LYN，MAN2A1，MAP4，AGAP6，MAZ，PIM3，MBNL1，MEF2C，MFGE8，MITF，MLH1，MNDA，MRC1，MXRA7，MSH5，ASPH，MSN，MSR1，MUTYH，MYD88，NAGA，ATF4，NBN，NCF2，NCF4，NDUFV1，GIMAP6，NFKB1，NOP2，CNOT3，NOTCH2，ATP2A3，NT5E，ODF2，OGG1，P2RX7，SPRN，RRM2B，IL21R，PNPLA8，ARHGEF3，TRAT1，CLEC4A，TMED5，LAP3，CALHM2，THAP4，KLHL5，ABHD5，SH3GLB1，SBDS，INSIG2，ZNF580，CRBN，CKLF，ABI3，SHISA5，SCAND1，TLR7，TLR8，KRCC1，MS4A4A，CRLF3，POLK，SRRT，PDHA1，DHRS7，MRPL48，YPEL5，CDK5RAP1，SELT，CAB39，PFAS，PGM1，...
【专利技术属性】
技术研发人员：李威，潘元明，王敬慧，韦攀建，
申请(专利权)人：首都医科大学附属北京胸科医院，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。