一种用于肝癌诊断的生物标志物的组合物及其应用制造技术

一种含有生物标记物的组合物，所述生物标志物包括FOXD2

【技术实现步骤摘要】
一种用于肝癌诊断的生物标志物的组合物及其应用


[0001]本专利技术涉及一种用于肝癌诊断的生物标志物的组合物及其用途。

技术介绍

[0002]肝细胞癌(HCC)起源于肝脏实质细胞的癌变，是全球癌症发病及死亡的主要原因之一。根据2018年全球癌症数据报道得知每年约有84.1万人被确诊为肝癌，而有78.2万人死于该疾病。目前已知病毒感染(包括HBV、HCV)、饮食(包括大量饮酒、吃霉变食物)、不良生活方式(如肥胖、吸烟)、以及其他疾病(如2型糖尿病、血吸虫感染)等是引起肝癌的主要危险因素。尽管乙肝疫苗纳入国家免疫计划，但仅限于年轻人HBV感染率及其所致肝癌发病率大幅度降低，年长者所面临的形势依然很严峻。所以探究早期诊断标志物对于肝癌疾病的预防和控制很关键。
[0003]癌症转录组的特征是蛋白编码和非编码转录本的异常表达和相互调控关系。竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)网络是通过将蛋白编码与非编码RNA二者的功能结合起来构成的。近年来，越来越多的学者聚焦于探索ceRNA在癌症的功能作用。微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non
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coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)、假基因、病毒转录本等均可以在人体中发挥ceRNA功能，参与生理与病理状态下ceRNA大网络调控机制。其中miRNA属于ncRNA的一类，是由22
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25个核苷酸组成，主要作用于靶基因的表达。而miRNA表达格局的改变会受到基因座突变、表观遗传甲基化、转录因子调控或成熟miRNA加工过程失调等影响。lncRNA长度大于200bp，包含3
′
多聚(a)尾巴、5
′
帽子以及启动子，虽不能编码蛋白质，但其在有机体的正常发育及肿瘤发生过程中仍起着关键作用。circRNA在结构上呈共价闭环结构的单链，是由线性RNA的5
′
端和3
′
端直接连接而成的ceRNAs，主要存在于细胞质，也不能够编码蛋白，相比线性RNA稳定性更好。这些非编码RNA构成人体内ceRNA网络池，在人体发育和疾病的进程中实现相互通信和共同调节。例如lncRNA UCA1作为miR
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182
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5p海绵，正向调节Delta
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like ligand 4(DLL4)的表达，促进肾癌细胞恶性表型。
[0004]癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划和GEO(Gene Expression Omnibus)等数据库作为生物信息学分析中不可或缺的公共数据库，研究者能够从中下载肿瘤相关的数据进行分析，来挖掘某些基因在特定肿瘤中的表达趋势，为进一步探索肿瘤发病机制奠定基础，极大地促进了对癌症生物学研究。
[0005]目前，血清AFP、肝脏超声，影像学检查包括CT、MRI、PET、SPECT等在肝癌诊断中各有优势，确诊方式依然为病理活检。新的诊断标志物有血清甲胎蛋白异质体(lensculinaris agglutinin
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reactive fraction of AFP,AFP
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L3)和异常凝血酶原(protein induced by vitamin Kabsence/antagonist
‑Ⅱ
,PIVKAⅡ)等，但临床实用性差。肝癌的治疗主要包括手术切除、肝动脉栓塞、射频消融和放化疗等，但是由于难以早期明确诊断，治疗效果不尽人意，肝癌患者的预后依然很差。因此，探索肝癌有价值的分子标志物及治疗靶点，对于HCC的攻克至关重要。

技术实现思路

[0006]本专利技术提供如下技术方案：
[0007]一种含有生物标记物的组合物，所述生物标志物包括FOXD2
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AS1、miR
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5p和STMN1基因。
[0008]根据本专利技术的组合物，所述FOXD2
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AS1是一种长非编码RNA(lncRNA)，miR
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5p是一种小分子RNA(miRNA)，STMN1是一种信使RNA(mRNA)。
[0009]根据本专利技术的组合物，所述生物标志物还进一步包括COL15A1和CCNE2基因。
[0010]根据本专利技术的组合物，所述COL15A1和CCNE2均为一种信使RNA(mRNA)。
[0011]本专利技术还提供本专利技术上述的生物标志物的组合物用于肝细胞癌诊断和预后评估。
[0012]具体的，本专利技术含有生物标志物的组合物的应用方式如下所述：与对照组相比，来自于待诊断或待评估的样本的上述生物标志物的浓度发生变化，由此可诊断样本的来源是否患有肝癌。
[0013]因此，本专利技术还提供一种用于肝癌诊断的组合物，所述组合物包含生物标志物的检测试剂，所述生物标志物包括FOXD2
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AS1、miR
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5p和STMN1基因。优选的，进一步包括COL15A1和CCNE2基因。
[0014]根据本专利技术的组合物，所述检测试剂为，基于核酸水平能够定量分析出所述生物标志物的试剂。
[0015]根据本专利技术的组合物，所述核酸水平的检测试验为用于核酸扩增反应，聚合酶链反应，实时荧光定量聚合酶链反应、逆转录聚合酶链反应的试剂。
[0016]所述核酸水平的检测试剂包含所述生物标志物的核酸序列，用于特异性的识别所述核酸序列的引物。
[0017]本领域技术人员可以理解，在确定生物标志物后，所上述各种检测生物标志物的试剂和方法是本领域技术人员公知或者根据技术手段可以确定地。
[0018]本专利技术还提供上述组合物的用途，其用于肝癌诊断剂或诊断试剂盒的制备。
[0019]本专利技术所述的生物标志物是指在肝癌个体和正常个体之间的受差异调节的基因。所述的诊断是指，判定检查对象对特定疾病(例如肝癌)的感受性，是否患有该疾病，以及治疗时的状态监测。所述的预后评估包括判断在被诊断为肝癌并接受治疗之后的恢复状态。本专利技术所述的样本是患者的肿瘤实体组织穿刺标本。
[0020]有益效果
[0021]本专利技术研究发现，lncRNA FOXD2
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AS1、miRNA miR
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5p和mRNA STMN1、COL15A1、CCNE2基因在肝癌组织中的相对表达量比癌旁组织普遍要高，表明这5个基因在肝癌组织中呈上调表达。本专利技术还发现FOXD2
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AS1与miR
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5p之间具有靶向调控关系。miR
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5p与STMN1之间具有靶向调控关系，而miR
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5p与COL15A1、CCNE2之间无靶向调控关系，但是COL15A1在分化程度(p＝0.036)、病灶大小(p＝0.028)及TNM分本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种含有生物标记物的组合物，所述生物标志物包括FOXD2
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AS1、miR
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5p和STMN1基因。2.根据权利要求1的组合物，所述生物标志物还进一步包括COL15A1和CCNE2基因。3.一种用于肝癌诊断的组合物，所述组合物包含生物标志物的检测试剂，所述生物标志物包括FOXD2
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AS1、miR
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5p和STMN1基因。优选的，进一步包括COL15A1和CCNE2基因。4.根据权利要求3所述的组合物，所述检测试剂为...

【专利技术属性】
技术研发人员：王利新，董辉，
申请(专利权)人：宁夏医科大学总医院，
类型：发明
国别省市：