TFEB激活和溶酶体生物发生的方法以及用于其的组合物技术

本公开涉及不依赖于mTORC1活性而激活TFEB的方法，通过增强细胞内膜表面的GABARAP/FNIP/FLCN复合物定位来激活TFEB的方法，表征TFEB激活剂的方法，和治疗TRPML1相关的疾病、病症或疾患的方法，以及用于所述方法的组合物。物。物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】TFEB激活和溶酶体生物发生的方法以及用于其的组合物
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2020年8月3日提交的美国临时申请第63/060,611号和2021年2月17日提交的美国临时申请第63/150,520号的优先权，所述临时申请整体并入本文。
[0003]序列表
[0004]根据37CFR 1.52(e)(5)，ASCII文本文件形式的序列表(名称为“2013075
‑
0043_SL.txt”，创建于2021年7月22日，并且大小为4,821字节)通过引用整体并入本文。

技术介绍

[0005]离子稳态和酸性pH是溶酶体降解能力的紧密关联的决定因素，并且这些特性的改变可导致疾病。虽然已知溶酶体膜通道调控离子通量，但溶酶体如何局部感测此类变化和细胞如何反应尚不清楚。

技术实现思路

[0006]本公开尤其提供了如下见解：通过GABARAP蛋白质(GABARAP、GABARAPL1、GABARAPL2)的脂质化和后续接合来刺激、稳定、定位和/或以其他方式增加GABARAP/FLCN/FNIP复合物的膜定位可不依赖于mTORC1活性而激活TFEB和/或可以其他方式增加自噬。
[0007]可选地或另外地，在一些实施方案中，本公开提供了如下见解：激动TRPML1可刺激、稳定、定位和/或以其他方式增加LAMP1阳性胞质表面(例如，溶酶体膜表面)的GABARAP/FLCN/FNIP复合物的水平。
[0008]本公开还提供了用于评估增加自噬和/或激动TRPML1和/或刺激、稳定、定位和/或以其他方式增加LAMP1阳性胞质表面(例如，溶酶体膜表面)的GABARAP/FLCN/FNIP复合物水平的剂的技术；再进一步地，本公开还提供了如下的见解：此类剂可用于治疗某些疾病、病症或疾患，包括可能与负责GABARAP膜定位的接合机制的缺陷相关的和/或可能受益于自噬增加的那些疾病、病症或疾患。
[0009]在一个方面，本公开提供了不依赖于mTORC1活性而激活TFEB的方法，所述方法包括使系统与TRPML1激动剂接触的步骤，所述系统包含含有LAMP
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1、vATP酶或GABARAP的膜以及GABARAP/FLCN/FNIP复合物的组分，使得所述膜处的GABARAP/FLCN/FNIP复合物的水平升高。在一些实施方案中，包含LAMP
‑
1vATP酶或GABARAP的膜限定了隔室。在一些实施方案中，隔室是或包含溶酶体。在一些实施方案中，膜是或包含溶酶体膜。在一些实施方案中，溶酶体膜是完整溶酶体的一部分。在一些实施方案中，溶酶体处于细胞中。
[0010]在另一方面，本公开提供了不依赖于mTORC1活性而激活TFEB的方法，所述方法包括施用TRPML1激动剂的步骤。在一些实施方案中，施用步骤包括使系统与TRPML1激动剂接触，其中所述系统包含溶酶体膜和GABARAP/FLCN/FNIP复合物的组分。
[0011]在一些实施方案中，系统在编码接合机制蛋白质的基因(接合机制基因)和/或编码GABARAP/FLCN/FNIP复合物的组分的基因中具有多态性或突变。在一些实施方案中，接合机制基因选自由Atg3、Atg5、Atg7、Atg12、Atg16L1和其组合组成的组。在一些实施方案中，
接合途径基因是Atg16L1。在一些实施方案中，多态性是T300A。
[0012]在一些实施方案中，TRPML1激动剂属于选自由多肽、核酸、脂质、碳水化合物、小分子、金属和其组合组成的组的化学类别。
[0013]在一些实施方案中，施用步骤包括在多种条件下将系统暴露于TRPML1激动剂并持续足够的时间，使得相对于在所述暴露之前的情况，在所述系统中观察到一种或多种CLEAR网络基因的表达或活性增强和/或可检测的胞吐活性、自噬、溶酶体贮积物质清除和溶酶体生物发生中的一者或多者的增强。在一些实施方案中，施用步骤包括在多种条件下将系统暴露于TRPML1激动剂并持续足够的时间，使得相对于在所述暴露之前的情况，在所述系统中观察到选自表1的一种或多种基因的表达或活性增强。
[0014]在一些实施方案中，TRPML1激动剂的特征在于，当评估对CLEAR网络基因的表达的影响时，其显示出比在饥饿条件下观察到的更受限的影响。在一些实施方案中，TRPML1激动剂的特征在于，在可比条件下，其存在时的TRPML1水平或活性高于其不存在时的TRPML1水平或活性。
[0015]在一些实施方案中，TRPML1激动剂是直接激动剂，因为其与TRPML1相互作用。在一些实施方案中，TRPML1激动剂是间接激动剂，因为其不直接与TRPML1相互作用。
[0016]在另一方面，本公开提供了治疗TRPML1相关的疾病、病症或疾患的方法，所述方法包括向患有或易患TRPML1相关的疾病、病症或疾患的受试者施用TRPML1激动剂的步骤。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患是或包含炎症性疾患。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患是或包含溶酶体贮积症。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患是或包含聚谷氨酰胺病症。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患是或包含神经退行性蛋白病。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患是感染性疾病。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患选自由克罗恩病(Crohn's Disease)、庞贝病(Pompe Disease)、帕金森病(Parkinson's Disease)、亨廷顿病(Huntington's Disease)、阿茨海默病(Alzheimer's Disease)、脊髓延髓肌萎缩、α
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抗胰蛋白酶缺乏症和多发性硫酸酯酶缺乏症组成的组。在一些实施方案中，TRPML1相关的疾病、病症或疾患是克罗恩病。
[0017]在另一方面，本公开提供了通过增强细胞内膜表面的GABARAP/FNIP/FLCN复合物定位来激活TFEB的方法。在一些实施方案中，细胞内膜表面是细胞内隔室的胞质表面。在一些实施方案中，细胞内隔室是溶酶体。在一些实施方案中，细胞内隔室是线粒体。在一些实施方案中，细胞内隔室是内质网。在一些实施方案中，细胞内隔室是病原体液泡。在一些实施方案中，细胞内隔室是内体结构。
[0018]在一些实施方案中，方法包括施用TRPML1激动剂。在一些实施方案中，TFEB激活不依赖于mTORC1活性。
[0019]在另一方面，本公开提供了表征TFEB激活剂的方法，所述方法包括评估对一种或多种细胞内膜表面的FLCN定位和/或GABARAP/FNIP/FLCN复合物的水平的影响。
[0020]在另一方面，本公开提供了治疗接合机制相关的(“CMA”)疾病、病症或疾患或者GABARAP/FNIP/FLCN复合物相关的疾病、病症或疾患的方法，所述方法包括施用TRPML1激动剂的步骤。在一些实施方案中，疾病、病症或疾患是或包含克本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种不依赖于mTORC1活性而激活TFEB的方法，所述方法包括以下步骤：使系统与TRPML1激动剂接触，所述系统包含：包含LAMP
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1、vATP酶或GABARAP的膜；以及GABARAP/FLCN/FNIP复合物的组分；使得所述膜处的所述GABARAP/FLCN/FNIP复合物的水平升高。2.如权利要求1所述的方法，其中包含LAMP
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1vATP酶或GABARAP的所述膜限定了隔室。3.如权利要求2所述的方法，其中所述隔室是或包含溶酶体。4.如权利要求1所述的方法，其中所述膜是或包含溶酶体膜。5.如权利要求5所述的方法，其中所述溶酶体膜是完整溶酶体的一部分。6.如权利要求3或权利要求6所述的方法，其中所述溶酶体处于细胞中。7.一种不依赖于mTORC1活性而激活TFEB的方法，所述方法包括以下步骤：施用TRPML1激动剂。8.如权利要求7所述的方法，其中所述施用步骤包括使系统与所述TRPML1激动剂接触，其中所述系统包含：溶酶体膜；和GABARAP/FLCN/FNIP复合物的组分。9.如权利要求1
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8中任一项所述的方法，其中所述系统在以下中具有多态性或突变：编码接合机制蛋白质的基因(接合机制基因)和/或编码所述GABARAP/FLCN/FNIP复合物的组分的基因。10.如权利要求9所述的方法，其中所述接合机制基因选自由Atg3、Atg5、Atg7、Atg12、Atg16L1和其组合组成的组。11.如权利要求10所述的方法，其中所述接合途径基因是Atg16L1。12.如权利要求11所述的方法，其中所述多态性是T300A。13.如权利要求1
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12中任一项所述的方法，其中所述TRPML1激动剂属于选自由多肽、核酸、脂质、碳水化合物、小分子、金属和其组合组成的组的化学类别。14.如权利要求8所述的方法，其中所述施用步骤包括在多种条件下将所述系统暴露于所述TRPML1激动剂并持续足够的时间，使得相对于在所述暴露之前的情况，在所述系统中观察到一种或多种CLEAR网络基因的表达或活性增强和/或可检测的胞吐活性、自噬、溶酶体贮积物质清除和溶酶体生物发生中的一者或多者的增强。15.如权利要求8所述的方法，其中所述施用步骤包括在多种条件下将所述系统暴露于所述TRPML1激动剂并持续足够的时间，使得相对于在所述暴露之前的情况，在所述系统中观察到选自表1的一种或多种基因的表达或活性增强。16.如权利要求7所述的方法，其中所述TRPML1激动剂的特征在于，当评估对CLEAR网络基因的表达的影响时，其显示出比在饥饿条件下观察到的更受限的影响。17.如权利要求1或权利要求7所述的方法，其中所述TRPML1激动剂的特征在于，在可比条件下，其存在时的TRPML1水平或活性高于其不存在时的TRPML1水平或活性。18.如权利要求1或权利要求7所述的方法，其中所述TRPML1激动剂是直接激动剂，因为其与TRPML1相互作用。19.如权利要求1或权利要求7所述的方法，其中所述TRPML1激动剂是间接激动剂，因为
其不直接与TRPML1相互作用。20.一种治疗TRPML1相关的疾病、病症或疾患的方法，所述方法包括以下步骤...

【专利技术属性】
技术研发人员：J，
申请(专利权)人：卡斯玛治疗公司，
类型：发明
国别省市：