水产动物选择指数制定方法及选择育种方法技术

本发明专利技术公开了一种水产动物选择指数制定方法及选择育种方法，解决现有技术制定选择指数存在的不利于制定配种方案以及影响选择育种的准确性和可靠性的问题。所述水产动物选择指数制定包括：获取所有个体或家系的所有育种目标性状的测定值以及所有个体或家系的近交系数；根据所述测定值，获取每个性状的育种值、每个性状的平均育种值以及育种值标准差；根据所述近交系数确定所有个体或家系的平均近交系数和近交系数标准差；计算性状标准化育种值;计算标准化近交系数；根据所述性状标准化育种值和所述标准化近交系数，计算综合育种值；根据所述综合育种值确定选择指数。根据所述综合育种值确定选择指数。根据所述综合育种值确定选择指数。

【技术实现步骤摘要】
水产动物选择指数制定方法及选择育种方法


[0001]本专利技术属于水产遗传育种
，具体地说，是涉及水产动物选择指数制定方法及水产动物选择育种方法。

技术介绍

[0002]水产动物选择育种中，采用多个性状同时选择可提高育种目标的综合遗传进展和经济效益。当前多性状选择育种研究中，通常是依据家系或个体的选择指数实现家系或个体的选择或淘汰。
[0003]现有技术中，在制定家系或个体的选择指数时，首先按照下述标准化公式计算性状标准化育种值：然后，按照下述公式计算选择指数：按照下述公式计算选择指数：p
′
＝[p1p2…
p
n
]，v
i
′
＝[v
i1
v
i2
…
v
in
]。其中，i表示个体编号或者家系编号，j表示性状编号，n表示性状的个数，v
ij
表示第i个个体或家系的第j个性状的标准化育种值，a
ij
表示第i个个体或家系的第j个性状的育种值，表示第j个性状的平均育种值，σ
j
表示第j个性状的育种值标准差，I
i
表示第i个个体或家系的选择指数，r为控制选择指数间变异程度大小的变量，p
j
表示第j个性状的加权值，p
′
表示n个性状加权值构成的向量，v
i
′
表示第i个个体或家系的育种目标性状的标准化育种值向量。
[0004]采用上述方法制定选择指数，将每个性状的育种值标准化成均值为0、标准差为1的一组数据，获得的各性状的育种值在标准化后的取值范围是不固定的，多个性状的标准化育种值在综合为选择指数后取值范围也是不固定的。由此将导致在后续利用最优化算法制定配种方案时，需要多次迭代才能收敛，寻找最优解的过程相对复杂，不容易正确地收敛到最优解。此外，选择指数制定过程仅考虑了性状的育种值，没有反映出个体或家系自身的近交情况，不能全面体现个体或家系的育种价值，影响了遗传选择育种的准确性和可靠性。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的之一在于提供一种水产动物选择指数制定方法，解决现有技术制定选择指数存在的不利于制定配种方案以及影响选择育种的准确性和可靠性的问题。
[0006]为实现上述专利技术目的，本专利技术采用下述技术方案予以实现：
[0007]一种水产动物选择指数制定方法，所述方法包括：
[0008]获取所有个体或家系的所有育种目标性状的测定值以及所有个体或家系的近交系数F
i
；
[0009]根据所述测定值，获取每个性状的育种值a
ij
、每个性状的平均育种值以及育种值标准差σ
j
；根据所述近交系数F
i
确定所有个体或家系的平均近交系数F和近交系数标准差σ
′
；
[0010]计算性状标准化育种值a
′
ij
：
[0011]计算标准化近交系数F
i
′
：
[0012]根据所述性状标准化育种值a
′
ij
和所述标准化近交系数F
i
′
，计算综合育种值Y
i
：
[0013]根据所述综合育种值Y
i
确定选择指数I
i
：
[0014]其中，a
′
ij
表示第i个个体或家系的第j个性状的标准化育种值；a
ij
表示第i个个体或家系的第j个性状的育种值；表示第j个性状的平均育种值；σ
j
表示第j个性状的育种值标准差；Tanh表示双曲函数；F
i
表示第i个个体或家系的近交系数；表示平均近交系数；σ
′
表示近交系数标准差，σ
′
≠0；F
i
′
表示第i个个体或家系的标准化近交系数；m1、k1、q1、m2、k2、q2均为大于0的常数；Y
i
表示第i个个体或家系的综合育种值；n表示性状的总数；p
j
表示第j个性状的加权值，为已知值；w
i
表示第i个个体或家系的近交系数加权值，为已知值；I
i
表示第i个个体或家系的选择指数；N表示个体或家系的总数；分别表示N个综合育种值中的最小值和最大值。
[0015]本申请的一些实施例中，所述m1的取值范围为：0＜m1＜1；所述m2的取值范围为：0＜m2＜1；所述k1的取值范围为：0＜k1≤0.02；所述k2的取值范围为：0＜k2≤0.02。
[0016]本申请的一些实施例中，所述m1、k1、m2、k2满足：m1＝m2＝0.5，k1＝k2＝0.01。
[0017]本申请的一些实施例中，所述q1、q2满足：q1＝q2＝1。
[0018]本申请的一些实施例中，所述近交系数加权值w
i
满足：
‑
1≤w
i
≤0。
[0019]本申请的一些实施例中，所述近交系数加权值w
i
满足：w
i
＝
‑
0.1。
[0020]本专利技术的目的之二在于提供一种水产动物选择育种方法，提高选择育种的准确性、可靠性及高效性。
[0021]为实现上述专利技术目的，本专利技术法采用下述技术方案来实现：
[0022]一种水产动物选择育种方法，所述方法包括：
[0023]获取测试个体的个体选择指数和测试家系的家系选择指数；
[0024]根据留种方案、所述个体选择指数和所述家系选择指数，选择留种家系和所述留种家系中的留种个体；
[0025]根据所述留种家系和所述留种个体进行选择育种；
[0026]所述个体选择指数和所述家系选择指数采用上述权利要求1至6中任一项所述的水产动物选择指数制定方法制定。
[0027]与现有技术相比，本专利技术的优点和积极效果是：
[0028]本专利技术提供的水产动物选择指数制定方法，采用双曲函数处理性状育种值、平均育种值及育种值标准差，获得各性状的标准化育种值，使得标准化后的育种值的数据分布不变，基于标准化后的育种值确定的选择指数的取值范围固定，在后续利用最优化算法制定配种方案时，能够快速地收敛而获得最优解，提高了基于选择指数进行选择育种的高效性；本专利技术提供的水产动物选择指数制定方法，引入反映个体或家系的近交情况的近交系数，并将近交系数进行标准化，再基于标准化近交系数与标准化育种值确定综合育种值，最
后根据综合育种值制定选择指数，使得选择指数能够更全面地反映个体或家系的育种价值，进而提高了基于选择指数进行选择育种的准确性和可靠性。
[0029]结合附图阅读本专利技术的具体实施方式后，本专利技术的其他特点和优点将变得更加清楚。
附图说明
[0030本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种水产动物选择指数制定方法，其特征在于，所述方法包括：获取所有个体或家系的所有育种目标性状的测定值以及所有个体或家系的近交系数F
i
；根据所述测定值，获取每个性状的育种值a
ij
、每个性状的平均育种值以及育种值标准差σ
j
；根据所述近交系数F
i
确定所有个体或家系的平均近交系数和近交系数标准差σ
′
；计算性状标准化育种值a
′
ij
：计算标准化近交系数F
i
′
：根据所述性状标准化育种值a
′
ij
和所述标准化近交系数F
i
′
，计算综合育种值Y
i
：根据所述综合育种值Y
i
确定选择指数I
i
：其中，a
′
ij
表示第i个个体或家系的第j个性状的标准化育种值；a
ij
表示第i个个体或家系的第j个性状的育种值；表示第j个性状的平均育种值；σ
j
表示第j个性状的育种值标准差；Tanh表示双曲函数；F
i
表示第i个个体或家系的近交系数；表示平均近交系数；σ
′
表示近交系数标准差，σ
′
≠0；F
i
′
表示第i个个体或家系的标准化近交系数；m1、k1、q1、m2、k2、q2均为大于0的常数；Y
i
表示第i个个体或家系的综合育种值；n表示性状的总数；p

【专利技术属性】
技术研发人员：隋娟，栾生，孔杰，代平，孟宪红，罗坤，曹家旺，谭建，傅强，陈宝龙，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院黄海水产研究所，
类型：发明
国别省市：