【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于调节SCN2A的化合物和方法
[0001]序列表
[0002]本申请与电子格式的序列表一起提交。序列表作为名称为BIOL0373WOSEQ_ST25.txt的文件提供,创建于2021年8月2日,大小为850KB。序列表电子格式的信息通过引用整体并入本文。
[0003]本文提供了用于减少细胞或受试者中SCN2A RNA的量或活性,并且在某些情况下减少细胞或受试者中SCN2A蛋白的量的化合物、方法和药物组合物。此类化合物、方法和药物组合物可用于改善与电压门控钠通道蛋白相关的疾病或障碍的至少一种症状或标志,所述疾病或障碍诸如例如发育性和癫痫性脑病、智力残疾或自闭症谱系障碍。此类症状和标志包括但不限于癫痫发作、张力减退、感觉统合障碍、运动发育延迟和功能障碍、智力和认知功能障碍、运动和平衡功能障碍、视觉功能障碍、语言和言语延迟、胃肠障碍、神经发育延迟、睡眠问题和癫痫的意外猝死。
技术介绍
[0004]人类基因SCN2A编码人类SCN2A蛋白,即电压门控钠通道NaV1.2的α
‑
1亚单位。SCN2A中的突变与多种神经发育和智力疾病和障碍相关,诸如发育性和癫痫性脑病(DEE),包括早发性癫痫性脑病(EE)、迟发性癫痫性脑病和良性家族性新生儿
‑
婴儿癫痫发作(BFNIS);SCN2A中的突变也与智力残疾(ID)和/或自闭症谱系障碍(ASD)相关,伴有或不伴有癫痫发作(Wolff, M.,等人,2019,Epilepsia60,S59
‑
S67;Sanders, ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种寡聚化合物,其包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,其中所述修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SCN2A核酸的等长部分至少90%互补,并且其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一个选自修饰的糖部分和修饰的核苷间键的修饰。2.一种寡聚化合物,其包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,并且具有包含SEQ ID NO:16
‑
2531的任何核碱基序列的至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或20个连续核碱基的核碱基序列,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一个选自修饰的糖部分和修饰的核苷间键的修饰。3.一种寡聚化合物,其包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,并且具有包含SEQ ID NO:2532
‑
2539的任何核碱基序列的至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个或18个连续核碱基的核碱基序列,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一个选自修饰的糖部分和修饰的核苷间键的修饰。4.如权利要求1至3中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:2的等长部分至少90%互补,并且与SEQ ID NO:1的等长部分不超过50%互补。5.一种寡聚化合物,其包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,其中a)所述修饰的寡核苷酸的核碱基序列包含至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个与SEQ ID NO:2的核碱基199863
‑
199905、227493
‑
22755、243124
‑
243204、247823
‑
247921、254142
‑
254177、168911
‑
168945、170026
‑
170061、183519
‑
183562、188630
‑
188668、199912
‑
199962、227419
‑
227450或238173
‑
238192的等长部分互补的连续核碱基,条件是所述修饰的寡核苷酸不包含超过六个LNA核苷;或者b)所述修饰的寡核苷酸的核碱基序列包含至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个与SEQ ID NO:2的核碱基243917
‑
244073、170174
‑
170200、176724
‑
176751、180772
‑
180801、183968
‑
184016、202877
‑
202906、224198
‑
224217、224199
‑
224218或243918
‑
243937的等长部分互补的连续核碱基,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一个选自修饰的糖部分和修饰的核苷间键的修饰。6.一种寡聚化合物,其包含由12至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,其中a)所述修饰的寡核苷酸的核碱基序列包含选自SEQ ID NO:336、488、2021、2097、2174、2250、2326、2403、2499、2500、2501、2502、2526;181、259、643、720、796、2504、2505、2506、2507、2508、2509、2510、2511、2512、2513、2514、2521;491、567、644、721、797、2177、2253、2315、2329、2406、2527;29、30、107、108、185、186、263、264、341、342、419、420、1796、1871、1948、2025、2101、2178、2254、2330、2503、2517、2522;1016、1093、1104、1169、1246、1323、1400、1477、1554、1708、1785、1860、1937、2014、1631、2090、2539;18、96、485、561、638、715、791、868、2247、2323、2400;174、1328、1405、1482、1559、1636、1713、1790、1865、1942、2019;20、98、253、332、410、1406、1483、1560、1637、1714、1791、1866、1943;21、411、1407、1484、1561、1638、1715;24、414、871、948、1025、1100;25、337、415、490、566、2099、2176、2252、2328、2405;和182的至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续的核碱基;条件是所述修饰的寡核苷酸不包含超过六个LNA核苷;或者
b)其中所述修饰的寡核苷酸的核碱基序列包含选自SEQ ID NO:1090、1166、2484、2485、2487、2493、2496、2497、2498、2533、2534、2535、2537;302、1513、1667、1744、1819、1896、1973;148、226、1364、1441、1518、1595、1672、1749;227、1292、1369、1446、1523、1600、1677、1754、1829;228、1679、1756、1831、1908、1985、2061、2138、2214、2290;1226、1303、1380、1457、1534、1611;2079;2523;和2477的序列的至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续的核碱基其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一个选自修饰的糖部分和修饰的核苷间键的修饰。7.如权利要求1至6中任一项所述的寡聚化合物,其包含由12个至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,并且具有包含SEQ ID NO:2487、2493、2510或2514中的任一者的至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或20个连续核碱基的核碱基序列。8.如权利要求1至6中任一项所述的寡聚化合物,其包含由12个至30个连接的核苷组成的修饰的寡核苷酸,并且具有包含SEQ ID NO:2534的至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个或18个连续核碱基的核碱基序列。9.如权利要求1至8中任一项所述的寡聚化合物,其中当在所述修饰的寡核苷酸的整个核碱基序列上测量时,所述修饰的寡核苷酸具有与SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2的核碱基序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%互补的核碱基序列。10.如权利要求9所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸与SEQ ID NO:2的核碱基序列的基因内区域;SEQ ID NO:2的核碱基序列的非翻译区域;或者SEQ ID NO:2的核碱基序列的内含子/外显子连接区域至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%互补。11.如权利要求1至10中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO:2的核碱基序列的外显子区域不超过50%、不超过60%、不超过70%、不超过80%、不超过90%或不超过95%互补。12.如权利要求1至11中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸由10个至25个、10个至30个、10个至50个、12个至20个、12个至25个、12个至30个、12个至50个、13个至20个、13个至25个、13个至30个、13个至50个、14个至20个、14个至25个、14个至30个、14个至50个、15个至20个、15个至25个、15个至30个、15个至50个、16个至18个、16个至20个、16个至25个、16个至30个、16个至50个、17个至20个、17个至25个、17个至30个、17个至50个、18个至20个、18个至25个、18个至30个、18个至50个、19个至20个、19个至25个、19个至30个、19个至50个、20个至25个、20个至30个、20个至50个、21个至25个、21个至30个、21个至50个、22个至25个、22个至30个、22个至50个、23个至25个、23个至30个或23个至50个连接的核苷组成。13.如权利要求1至11中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸由17至19个或21至30个连接的核苷组成。14.如权利要求1至13中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸由16个、17个、18个、19个或20个连接的核苷组成。15.如权利要求14所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸由20个连接的核苷组
成。16.如权利要求14所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸由18个连接的核苷组成。17.如权利要求1至16中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一种包含修饰的糖部分的修饰的核苷。18.如权利要求17所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一种包含双环糖部分的修饰的核苷。19.如权利要求18所述的寡聚化合物,其中是双环糖部分包含4
’‑2’
桥,其中4
’‑2’
桥选目
‑
CH2‑
O
‑
;和
‑
CH(CH3)
‑
O
‑
。20.如权利要求17至19中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸不包含超过六个双环糖部分。21.如权利要求17所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸不包含双环糖部分。22.如权利要求17至20中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸不包含超过六个LNA糖部分。23.如权利要求17至21中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸不包含LNA糖部分。24.如权利要求17至23中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一种包含非双环修饰的糖部分的修饰的核苷。25.如权利要求24所述的寡聚化合物,其中所述非双环修饰的糖部分是2
’‑
MOE糖部分或2
’‑
OMe糖部分。26.如权利要求17至25中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一种包含糖替代物的修饰的核苷。27.如权利要求26所述的寡聚化合物,其中所述糖替代物是吗啉代、修饰的吗啉代、PNA、THP和F
‑
HNA中的任一者。28.如权利要求1至27中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸是gapmer。29.如权利要求1至28中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由1至6个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由6至10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由1至6个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。30.如权利要求1至28中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由1至6个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由6至10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由1至6个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含修饰的糖部分,并且每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。31.如权利要求29所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:
由5个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由5个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。32.如权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由5个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由5个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。33.如权利要求29所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由6个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由4个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。34.如权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由6个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由4个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。35.如权利要求29所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由4个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由6个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。36.如权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由4个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由10个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由6个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。37.如权利要求29所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由4个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由8个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由6个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中
每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。38.如权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由4个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由8个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由6个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。39.如权利要求29所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由6个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由8个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由4个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。40.如权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由6个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由8个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由4个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。41.如权利要求29所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由5个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由8个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由5个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,并且至少六个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。42.如权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含:由5个连接的5
’‑
区域核苷组成的5
’‑
区域;由8个连接的中心区域核苷组成的中心区域;和由5个连接的3
’‑
区域核苷组成的3
’‑
区域;其中每个所述5
’‑
区域核苷和每个所述3
’‑
区域核苷包含2
’‑
MOE修饰的糖部分,每个所述中心区域核苷包含2
’‑
β
‑
D
‑
脱氧核糖基糖部分。43.如权利要求29或权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述5
’‑
区域或所述3
’‑
区域包含至少一种双环核苷。44.如权利要求29或权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述5
’‑
区域或所述3
’‑
区域包含至少一种不是双环核苷的核苷。45.如权利要求29或权利要求30所述的寡聚化合物,其中所述5
’‑
区域或所述3
’‑
区域包含至少一种不是LNA核苷的核苷。46.如权利要求1至45中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少
一个修饰的核苷间键。47.如权利要求46所述的寡聚化合物,其中至少一个修饰的核苷间键是硫代磷酸酯核苷间键。48.如权利要求46或权利要求47的寡聚化合物,其中每个核苷间键是修饰的核苷间键。49.如权利要求48所述的寡聚化合物,其中每个核苷间键是硫代磷酸酯核苷间键。50.如权利要求46至47中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸的至少一个核苷间键是磷酸二酯核苷间键。51.如权利要求1至46中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸的每一个核苷间键独立地选自磷酸二酯键或硫代磷酸酯核苷间键。52.如权利要求1至47或50至51中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸的至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个或至少18个核苷间键是硫代磷酸酯核苷间键。53.如权利要求46的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸的核苷间键基序选自soooossssssssssooss、sooooossssssssssoss、sooossssssssssoooss、soosssssssssoooss、soooossssssssoss和sooosssssssssooss,其中s=硫代磷酸酯核苷间键,o=磷酸二酯核苷间键。54.如权利要求1至53中任一项所述的寡聚化合物,其中所述修饰的寡核苷酸包含至少一种修饰的核碱基。55.如权利要求54所述的寡聚化合物,其中所述修饰的核碱基是5
‑
甲基胞嘧啶。56.如权利要求1至55中任一项所述的...
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