流感易感标志物和基于该标志物的流感高危人群预测模型的构建方法与应用技术

本发明专利技术公开了流感易感标志物和基于该标志物的流感高危人群预测模型的构建方法与应用，该流感易感标志物为“AMFR”、“HBQ1”、“DHRS9”、“SLC35E2A”、“BANK1”、“CD79A”、“TXNDC5”、“H2BC5”和“PRKY”的组合。该标志物和基于其建立的流感风险预测模型是基于健康成年人基线水平转录组的数据得到的，能够用于筛选健康成年人中甲型流感H3N2易感个体，AUC为0.94、准确度为0.91、精确度为1、召回率为0.75、F1评分为0.86，具有较好的准确度。具有较好的准确度。具有较好的准确度。

【技术实现步骤摘要】
流感易感标志物和基于该标志物的流感高危人群预测模型的构建方法与应用


[0001]本专利技术属于分子生物学领域，具体涉及流感易感标志物和基于该标志物的流感高危人群预测模型的构建方法与应用。

技术介绍

[0002]流感病毒在人类和动物中定期引起季节性流行病，偶尔还会引起严重的流行病。全球每年约有300万至500万例严重病例，约有29万至65万人死于季节性流感引起的呼吸系统疾病，在全世界范围造成严重的公共卫生问题，亟需开发更有效的药物、疫苗及相关的防护措施来遏制流感病毒的传播、流行与爆发。因此，开发设计更有效、更具针对性的药物、疫苗及相关的防护措施是当前流感病毒研究的重中之重。
[0003]流感病毒的感染范围广，可感染任何年龄段的人。但是暴露在同一流感病毒环境的人往往会出现不同的结局，例如有的人症状轻微，有的人症状危重，但有的人无症状。这表明个体对流感的易感性存在差异。流感易感性的差异导致人群患病风险不同。精准识别高风险人群，对流感的精准预防和治疗以及新药和疫苗的研发至关重要，将有助于减轻人类流感的疾病负担。
[0004]相关技术中，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组流感易感标志物，其特征在于，所述流感易感标志物为ADORA3、CD36、ANXA3、PPP1R15A、ABHD2、ANKRD11、RPS23、UQCRH、ACOX1和DSC1；所述流感优选包括H3N2。2.一种流感高危人群预测模型的构建方法，包括如下步骤：(1)采集受试者样本中的基因数据，筛选出流感相关的基线数据进行使用；(2)从基线数据中筛分出有症状和无症状受试者数据，分别进行差异表达分析和共表达网络分析，选取差异表达分析和共表达网络分析后的交集基因作为候选基因；(3)基于候选基因，采用随机森林构建得到流感高危人群预测模型；其中，所述候选基因包括权利要求1所述的流感易感标志物。3.根据权利要求2所述的构建方法，其特征在于，所述差异表达分析中错误预测百分比的基因≤0.05。4.根据权利要求2所述的构建方法，其特征在于，所述共表达网络分析的步骤包括：(1)采用R中的Hclust函数分层聚类方法对样本进行聚类；(2)利用WGCNAR包中的函数选择软阈值计算软阈值功率β，计算皮尔逊相关性，并使用皮尔逊相关性结果构造具有软阈值功率β的加权邻接矩阵；(3)将加权邻接矩阵转化为拓扑重叠测度，根据拓扑重叠测度的...

【专利技术属性】
技术研发人员：杜向军，唐静，韩婧琳，魏杰，王奕涵，林毅珊，唐康，曾金锋，邱泽凯，陈绎霖，程佩文，
申请(专利权)人：中山大学，
类型：发明
国别省市：