与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用，属于小麦育种领域。所述分子标记为SNPS

【技术实现步骤摘要】
与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及一种分子标记及其应用，具体涉及一种与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记及其在小麦辅助育种及遗传改良中的应用，属于小麦分子生物技术与育种


技术介绍

[0002]小麦是世界上最重要的三大粮食作物之一，是人们重要的能量摄入和蛋白质来源。穗粒数、单位面积穗数和千粒重是构成小麦产量的三大要素。研究表明，穗粒数增加可为提高小麦产量做出极大贡献，将穗粒数作为小麦高产育种的主攻目标是非常有效的。每穗小穗数、每小穗粒数和可育小花数决定了穗粒数，进而显著影响小麦产量。揭示小麦小穗数形成的遗传基础，对于培育优质高产的小麦品种具有重要的理论及实践意义。
[0003]小麦每穗小穗数是由多基因控制的复杂数量性状，受多个基因位点的共同调控且易受到环境影响，是影响小麦产量的重要因素之一。小麦常规育种效率低、时间长，育种进程缓慢，近年来随着现代分子生物学技术的快速发展，极大地提高了复杂性状遗传位点研究的准确性。对控制重要性状的基因进行定位和作图，遗传分离群体的构建和自然群体的选择及其表型与基因型的获取是开展 QTL 定位的前提。
[0004]在以往的研究中，通过对重组自交系（RIL）群体、DH群体、F2群体和回交群体中的小穗数进行遗传作图，发现许多控制小穗数的QTL几乎遍布所有染色体。Kato K 和Miura H等利用RIL群体在5A染色体上检测到三个控制总小穗数的QTL。Ma Z和Zhao D等利用RIL群体和F2群体在1B、2D、3B、5A、5B、7A和7D染色体上检测到控制小穗数的QTL，并在1A、2D、3B、6A、7A和7D染色体上定位到控制可育小穗数的QTL。Chen D 和 Wu X等通过构建F
2:3
群体进行小穗数QTL定位，在1A、1D、4A、3D和7B染色体上分别检测到5个相关QTL位点。
[0005]虽然目前报道了大量的小穗数QTL位点，但与之紧密连锁的分子标记仍较少，限制了分子标记的应用。分子标记辅助育种是利用分子标记与决定目标性状位点紧密连锁的关系，通过检测分子标记进而检测目的基因的存在，从而能够快速、准确、高效、不受环境条件干扰地在育种早期选择目标性状，加快育种效率。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的在于：提供一种与小麦每穗小穗数主效QTL
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qSnps
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7D紧密连锁的分子标记及其应用。
[0007]为了实现上述目标，本专利技术采用如下的技术方案：一种与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记，所述分子标记为SNPS
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7D10，其位于小麦的7D染色体上，核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示，序列长度391bp，可由SEQ ID NO:1所示的上游引物和SEQ ID NO:2所示的下游引物扩增得到，所述上游引物和下游引物均为单链DNA分子。
[0008]前述的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10的应用包括：在
鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状中的应用，以及在选育具有增加每穗小穗数基因型的小麦中的应用。
[0009]前述的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状或选育具有增加每穗小穗数基因型的小麦的方法，包括以下步骤：步骤1：提取待测小麦品种或品系的基因组DNA；步骤2：以待测小麦品种或品系的基因组DNA为模板，用SEQ ID NO:1所示的上游引物和SEQ ID NO:2所示的下游引物进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；步骤3：将得到的PCR扩增产物在6.0%的非变性聚丙烯酰胺凝胶上稳压电泳分离，如果出现了分子量大小为391bp的扩增片段，则该小麦品种或品系含有增加小麦每穗小穗数的等位基因，如果没有出现分子量大小为391bp的扩增片段，则该小麦品种或品系不含有增加小麦每穗小穗数的等位基因。
[0010]优选的，在步骤2中，PCR扩增反应体系为10μl，具体包括：0.5μl浓度为10μmol/l的SEQ ID NO:1所示的上游引物；0.5μl浓度为10μmol/l的SEQ ID NO:2所示的下游引物；1μl浓度为50ng/μl的DNA模板；5μl 2
×
Taq PCR预混试剂；3μl ddH2O。
[0011]优选的，在步骤2中，PCR扩增程序具体如下：95℃预变性5min；95℃变性30s，57℃退火30s，72℃延伸40s，循环34次；72℃延伸5min，12℃保存。
[0012]优选的，在步骤3中，电泳缓冲液为1
×
TBE，电泳采用 147V恒压，电泳时间为2.5h。
[0013]本专利技术的有益之处在于：（1）本专利技术提供的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10充分体现了小麦品种或品系的每穗小穗数主效QTL
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qSnps
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7D，以待测小麦品种或品系的基因组DNA为模板，用SEQ ID NO:1所示的上游引物和SEQ ID NO:2所示的下游引物对小麦品种或品系进行PCR扩增，能精准地判断小麦品种或品系是否具有该每穗小穗数主效QTL
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qSnps
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7D，从而能够快速筛选出具有增加小麦每穗小穗数的小麦品种或品系用于育种，加快高产优质小麦新品种的选育进程；（2）利用本专利技术提供的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状或选育具有增加每穗小穗数基因型的小麦时，只需检测PCR扩增产物的特性，就可以辨别小麦每穗小穗数主效QTL
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qSnps
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7D基因位点的增效变异存在与否，从而预测小麦的每穗小穗数表型，用于指导小麦产量性状改良的育种工作，除（1）中所述优点外，还具有以下优点：所鉴定材料受环境影响较小，选择目标明确，节约生产成本，小麦品种或品系的选择效率和质量大大提高，直接实现了目标基因在小麦种质资源以及育种后代中鉴定的目的，为小麦育种提供更多新的每穗小穗数基因标记资源。
附图说明
[0014]图1是小麦每穗小穗数主效QTL
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qSnps
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7D在7D染色体上的作图区间及InDel 标记
SNPS
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7D10位置图，其中，空心长方形代表染色体，染色体左侧是分子标记的名称，染色体右侧数字是分子标记在染色体上的位置，单位是Mb；图中共有两种分子标记，SNPS
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7D10为InDel标记，其余为SNP标记；染色体右侧黑色的长方形分别表示每穗小穗数在不同环境下的QTL作图区间；图2是分子标记SNPS
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7D10在KJ
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RIL群体的部分家系中的PCR扩增结果图，其中，M是50bp DNA L本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记为SNPS
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7D10，其位于小麦的7D染色体上，是InDel标记，核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示，序列长度391bp，可由SEQ ID NO:1所示的上游引物和SEQ ID NO:2所示的下游引物扩增得到，所述上游引物和下游引物均为单链DNA分子。2.权利要求1所述的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10在鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状中的应用。3.权利要求1所述的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10在选育具有增加每穗小穗数基因型的小麦中的应用。4.利用权利要求1所述的与小麦每穗小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记SNPS
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7D10鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状或选育具有增加每穗小穗数基因型的小麦的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：提取待测小麦品种或品系的基因组DNA；步骤2：以待测小麦品种或品系的基因组DNA为模板，用SEQ ID NO:1所示的上游引物和SEQ ID NO:2...

【专利技术属性】
技术研发人员：秦冉，曹鸣苏，陈林渠，郭浩儒，刘志霄，史欣瑶，田赵飒爽，黄振杰，郭庆杰，崔法，赵春华，吴永振，孙晗，
申请(专利权)人：鲁东大学，
类型：发明
国别省市：