【技术实现步骤摘要】
一种浮游藻类细胞荧光
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明场显微图像自动标注方法
[0001]本专利技术属于资源与环境领域，尤其是浮游植物图像识别相关领域，具体涉及一种浮游藻类细胞荧光
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明场显微图像自动标注方法。
技术介绍
[0002]浮游藻类多样性监测是水质生物评价的重要组成部分，对保护水生态环境具有重要意义。传统的显微镜检藻类群落鉴定方法需要专业人员操作，且费时费力。不同浮游藻类细胞图像之间有非常明显的形态差异，基于图像识别的浮游藻类监测方法通过提取藻细胞图像的形态、颜色、纹理特征完成藻的分类，在浮游藻类细胞监测中起着举足轻重的作用。
[0003]图像分割是识别浮游藻细胞图像的重要步骤，传统的图像分割方法如阈值法、边缘监测法等的分割结果不稳定，容易将完整的藻细胞分割成几部分以及将背景杂质分割出来。近年来，基于卷积神经网络的图像识别方法如Mask RCNN在浮游藻细胞图像分割中得到了较好的应用。然而，训练卷积神经网络需要大量的标注数据，而目前标注浮游藻类细胞图像仍然是依赖于在LabelMe等标注工具中通过人工...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种浮游藻类细胞荧光
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明场显微图像自动标注方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤(1)在荧光
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明场双通道显微成像仪器中同步采集浮游藻类细胞的显微荧光图像和显微明场图像；步骤(2)将荧光图像转化为灰度图，并采用大律法将灰度荧光图像转化为二值化图像；步骤(3)使用十字形结构元M对二值化图像进行形态学开运算，以消除由于噪声因素引起的孤立点：步骤(4)使用十字形结构元M对二值化图像进行形态学膨胀操作；步骤(5)确定二值图像中的连接区域，从而实现自动绘制浮游藻细胞的轮廓，并生成训练MaskRCNN网络所需的实例掩码图；步骤(6)，标注每个实例掩码图对应的藻种，构建浮游藻类细胞图像数据集；步骤(7)，首先使用COCO数...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵南京，贾仁庆，殷高方，徐敏，胡翔，黄朋，梁天泓，
申请(专利权)人：中国科学院合肥物质科学研究院，
类型：发明
国别省市：
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