确定受试者由轻中度COVID-19病程到重或危重病程的倾向性的方法技术

公开了一种用于确定受试者由轻度或中度COVID

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】确定受试者由轻中度COVID
‑
19病程到重或危重病程的倾向性的方法

技术实现思路

[0001]本专利技术公开了一种确定受试者由轻度或中度COVID
‑
19病程到重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性的方法。该方法可用于对患者群体进行分级、诊断SASR
‑
CoV
‑
2感染、预测受试者COVID
‑
19病程、督导患COVID
‑
19的受试者的治疗和/或监测现有和新型治疗药物对COVID
‑
19的疗效。

技术介绍

[0002]2019冠状病毒病(COVID
‑
19)是由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS
‑
CoV
‑
2)引起的，该病毒是一种具有高度传染性的人畜共患病毒，据信其利用血管紧张素转换酶2(ACE2)作为细胞进入受体。COVID
‑
19的临床表现涉及广泛的症状和疾病轨迹。
[0003]了解促使从严重疾病恢复的免疫反应的性质是开发针对COVID
‑
19的有效疗法的关键。冠状病毒，包括严重急性呼吸综合症(SARS
‑
CoV)和中东呼吸综合症(MERS)，通常会引起强烈的炎症反应和相关的淋巴细胞减少症。
[0004]对COVID
‑
19患者的研究报告了炎性单核细胞和中性粒细胞的增加以及淋巴细胞的急剧减少，并且报告了严重疾病中含有IL/>‑
1β、IL
‑
6和TNF
‑
α的炎性环境。尽管进行了这些分析，SARS
‑
CoV
‑
2感染过程中的免疫反应动力学及其与临床轨迹的可能相关性仍然是未知的。
[0005]最近的一项研究由Lucas等预先发表(《自然》，“纵向分析揭示严重COVID
‑
19中的免疫失灵(longitudinal analyses reveal immunological misfiring in severe COVID
‑
19)”，https://doi.org./10.1038/s41586
‑
020
‑
2588
‑
y)。作者检测了COVID
‑
19患者和对照组的多种细胞因子和趋化因子。在统计评估中，针对各个生物标志物报告了严重或中度病程之间的明显差异化，但早期、中期和晚期样品被汇集用于此评估。此外，作者没有调整多重检验的p值。因此，在本文的结论中，没有报告以统计学显著的方式从疾病早期出现的样本中预测重度或危重疾病的生物标志物。
[0006]因此，仍然需要找到基于生物标志物的方法，以确定受试者由轻度或中度COVID
‑
19病程到重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性。
具体实施方式
[0007]本专利技术(发现)分析了来自16名COVID
‑
19患者在三个不同的时期的53份血液样品中的超过349种的生物标志物(蛋白质和非蛋白质)，并识别了许多可以确定患者重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性的生物标志物。此外，对来自106名COVID
‑
19患者的106份血液样品进行了分析，以验证急性期的研究结果。
[0008]因此，本专利技术一方面涉及一种用于确定受试者由轻度或中度COVID
‑
19病程到重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性的方法，包括以下步骤：
[0009]a)确定从受试者获得的样品中至少一种生物标志物的量；
[0010]b)确定所述至少一种生物标志物的量与所述至少一种生物标志物的参考量的差异；
[0011]其中所述参考量是患有轻度或中度COVID
‑
19疾病的受试者中相应生物标志物的量；并且
[0012]其中所述差异|logFC|为至少0.5。
[0013]与参考量相比为至少0.5的|logFC|的差异表明该受试者具有重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性。在其他实施方案中，优选|logFC|为至少1.0、甚至更优选|logFC|为至少1.5、甚至更优选|logFC|为至少2.0、并且|logFC|高达2.5、高达3.0、或甚至|logFC|高达3.5、高达4.0、高达5.0。因此，logFC在0.5
‑
5.0之间的生物标志物是优选的生物标志物，甚至更优选在1.0
‑
4.0之间的logFC，又甚至更优选在1.5
‑
3.5之间的logFC，最优选在2.0
‑
3.5之间的logFC。
[0014]所述差异还必须在至少一个时期(即急性期、中期和/或晚期)中是显著的。显著性由“调整后的p值(即针对多重检验调整的p值)”描述并表明显著性水平。在这一方面，“显著”是指调整后的p值小于0.05(根据邦弗朗尼和霍赫贝格法(Bonferroni and Hochberg)对多重检验进行调整)。在一个实施方案中，所述p值小于0.05；在另一个实施方案中，所述p值小于0.01；在另一个实施方案中，所述p值小于0.005；在另一个实施方案中，所述p值小于0.001；在又另一个实施方案中，所述p值小于5
ⅹ
10
‑3；在又另一个实施方案中，所述p值小于1
ⅹ
10
‑3；在又另一个实施方案中，所述p值小于5
ⅹ
10
‑4；在又另一个实施方案中，所述p值小于1x10
‑4；在又另一个实施方案中，所述p值小于5x10
‑5；在又另一个实施方案中，所述p值小于1
ⅹ
10
‑5；在又另一个实施方案中，所述p值小于5x10
‑6；在又另一个实施方案中，所述p值小于1
ⅹ
10
‑6；在又另一个实施方案中，所述p值高达5
ⅹ
10
‑7；在又另一个实施方案中，所述p值高达1
ⅹ
10
‑7；在又另一个实施方案中，所述p值高达1
ⅹ
10
‑8；在又另一个实施方案中，所述p值高达1
ⅹ
10
‑9；在又另一个实施方案中，所述p值高达1
ⅹ
10
‑
10
。
[0015]优选的“调整后的p值在一个实施方案中介于4.3
ⅹ
10
‑
10
‑
5.5
ⅹ
10
‑3之间，在另一个实施方案中介于1.2
ⅹ
10
‑9‑
3.4
ⅹ
10
‑2之间，在另一个实施方案中介于1.本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于确定受试者由轻度或中度COVID
‑
19病程到重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性的方法，包括以下步骤：a)从所述受试者获得的样品中确定至少一种生物标志物的量；b)确定所述至少一种生物标志物的量与所述至少一种生物标志物的参考量的差异；其中所述样品是在COVID
‑
19疾病的特定时间段
‑‑
急性期、中期或晚期获得的，其中所述参考量是患有轻度或中度COVID
‑
19疾病的受试者体内相应生物标志物的量；和其中所述差异|logFC|为至少0.5。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，与所述参考量相比的差异，|logFC|为至少0.5、优选至少1.0表明所述受试者具有重度或危重COVID
‑
19病程的倾向性。3.根据前述权利要求中至少一项所述的方法，其特征在于，所述差异通过小于5*10
‑2的调整后p值确定为在统计学上是显著的。4.根据权利要求1
‑
3中至少一项所述的方法，其特征在于，在来自所述受试者的样品中，所述至少一种生物标志物选自：SLAF1、S10A8/9、BTLA、AREG、FGF2、CD47、CXCR5、TNR16、I13R2、IGF1R、CD81、CD28、VEGF165b/VEGFA、IL2、IL15、HMGB1和ALBU，以及它们的组合和/或其异构体、片段和/或变体。5.根据权利要求1
‑
3中至少一项所述的方法，其特征在于，在来自所述受试者的样品中，所述至少一种生物标志物选自：MUC1、CCL3、CALB1、ANGP2、CATB、ACVL1、MPIP2、SFRP5、IGF1、MTOR、FAF1、SLIP、PRTN3、TYRO3、CADH5、S10AC、SPIT1、S100B、CADH1、LEG4、DMB、RARR2、2A5D、I22R2、FGF9、CDN1A、ISK1、MMP9、SPRC、PEPC、ANGL3、IBP1、IL26、BASI、CORIN、IFI27、FABPI、IBP2、AMBP、IL1B、TSP1、S10AD和TOP1，以及它们的组合和/或其异构体、片段和/或变体。6.根据权利要求1
‑
3中至少一项所述的方法，其特征在于，在来自所述受试者的样品中，所述至少一种生物标志物选自至少两种来自以下的生物标志物：AREG、CD81和FGF2；CD81、HAVR2和TBB3；CXCR5、CD81和FGF2；SLAF1和CXCR5；CCL2和I13R2；CCL2和CD81；CCL2和FGF2；CCL2和CF47；UTER和I13R2；S10A8/9、CCL2、AREG和ERBB2；S10A8/9、CCL2和AREG；S10A8/9、CEAM1,3,5,6,8和ERBB2；S10A8/9和CD45RB；S10A8/9和CEAM1,3,5,6,8；S10A8/9、CCL2和IL15；S10A8/9、CCL2和VEGF165b；S10A8/9、ALBU和CCL2；S10A8/9、ALBU和I13R2；S10A8/9、ALBU和IGF1R；S10A8/9、CD8A和CCL2；S10A8/9和ERBB2；TSP1、AREG和SLAF1；CCL2、IGLC1和I13R2；CD81、SLAF1和CD14；CD81、SLAF1和TSP1；CD81和CD14；CD81、CD14和CXCR5；以及它们的组合和/或其异构体、片段和/或变体。7.根据权利要求1
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3中至少一项所述的方法，其特征在于，至少两种生物标志物选自权利要求4和/或权利要求5。8.根据权利要求1
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3中至少一项所述的方法，其特征在于，至少两种生物标志物选自至少两个不同的簇组，该簇组选自1簇组、2簇组和3簇组。9.根据权利要求1
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3中至少一项所述的方法，其特征在于，所述采集样品的时间段是在受试者被检测为SARS
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CoV
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2感染阳性和/或从首次症状出现后不到9天。10.根据权利要求9所述的方法，...

【专利技术属性】
技术研发人员：K，
申请(专利权)人：赛欧米克斯股份有限公司，
类型：发明
国别省市：