本发明专利技术提供一种荧光漂白后恢复实验图像处理方法及装置,其中方法包括:接收输入的待分析样本图像,所述待分析样本图像中包括至少一个漂白结构;根据用户输入确定所述待分析样本图像的类型;在所述待分析样本图像为位移样本的情况下,对所述位移样本中的各个漂白结构分别进行位移校正和数据分析;在所述待分析样本图像为稳定样本的情况下,对所述稳定样本中的各个漂白结构分别进行数据分析。本发明专利技术能够实现对待分析样本图像中的漂白结构进行批量数据分析,以及对位移样本中的发生位移的漂白结构进行批量运动校正,节省了大量的时间和人力成本,提高了荧光漂白后恢复实验数据分析的效率。效率。效率。
【技术实现步骤摘要】
荧光漂白后恢复实验图像处理方法及装置
[0001]本专利技术涉及计算机
,尤其涉及一种荧光漂白后恢复实验图像处理方法及装置。
技术介绍
[0002]荧光漂白后恢复实验(Fluorescence recovery after photobleaching,FRAP),是指使用强激光来刺激样品的一个区域,使其中荧光标记的分子漂白,不再发出荧光信号,然后使用低强度激光来跟踪由非漂白区域荧光分子同时向内扩散到漂白区域和漂白分子向外扩散引起的荧光的恢复。通过分析荧光信号的恢复情况可以获取荧光分子的动力学数据如扩散系数、结合常数等。这一方法通过检测生物大分子的动力学数据广泛应用于生物学研究中。
[0003]FRAP实验主要分为3个部分,先采集漂白前的图像,然后进行漂白结构(region of interest,ROI)漂白,最后采集漂白后的时间序列图像,获取荧光恢复数据。FRAP数据分析,即统计ROI内(即漂白结构对应的)的荧光强度随时间变化情况,得到FRAP曲线。FRAP实验需要长时间的检测样本信号,实验过程中存在样品结构漂移及运动等问题,需要随时间更改ROI的位置,以保证检测结果的准确性。
[0004]目前缺乏批量数据分析与样品漂移运动校正的方法。现有的数据分析方法是手动逐个文件分析,有些甚至需要逐帧更改ROI的位置,耗费大量的时间和人力成本。
技术实现思路
[0005]本专利技术提供一种荧光漂白后恢复实验数据处理方法及装置,用以解决现有技术中荧光漂白后恢复实验数据处理效率低的缺陷,实现高效处理荧光漂白后恢复实验数据。
[0006]第一方面,本专利技术提供一种荧光漂白后恢复实验图像处理方法,包括:
[0007]接收输入的待分析样本图像,所述待分析样本图像中包括至少一个漂白结构;
[0008]根据用户输入确定所述待分析样本图像的类型;
[0009]在所述待分析样本图像为位移样本的情况下,对所述位移样本中的各个漂白结构分别进行位移校正和数据分析;
[0010]在所述待分析样本图像为稳定样本的情况下,对所述稳定样本中的各个漂白结构分别进行数据分析。
[0011]可选地,所述对所述位移样本中的各个漂白结构分别进行位移校正和数据分析包括:
[0012]获取所述各个漂白结构对应的位移前位置;
[0013]基于所述位移前位置对所述待分析样本图像进行裁剪,获得所述各个漂白结构对应的子图像;
[0014]将各个漂白结构的位置校正为对应子图像中的位移前位置,获得各个漂白结构对应的校正后的子图像;
[0015]对所述各个校正后的子图像中的漂白结构进行数据分析。
[0016]可选地,所述将各个漂白结构的位置校正为对应子图像中的位移前位置,获得各个漂白结构对应的校正后的子图像,包括:
[0017]通过移动所述各个漂白结构,将所述各个漂白结构与各自对应的子图像中的位移前位置进行对齐,获得各个漂白结构对应的校正后的子图像。
[0018]可选地,所述方法还包括:
[0019]保存校正后的子图像;和/或
[0020]保存校正前的子图像。
[0021]可选地,所述对所述稳定样本中的各个漂白结构分别进行数据分析,包括:
[0022]取消所述各个漂白结构的选中状态;
[0023]对所述各个漂白结构依次进行数据分析。
[0024]可选地,所述数据分析的步骤包括:
[0025]获取各个漂白结构对应的数据结果;
[0026]对所述数据结果进行归一化处理,获得归一化数据;
[0027]筛选所述归一化数据,获得筛选后数据;
[0028]对所述筛选后的数据进行统计分析,基于各个漂白结构对应的荧光信息恢复的平均水平获得荧光漂白后恢复实验FRAP曲线。
[0029]可选地,在所述待分析样本图像的数量为多个的情况下,基于所述荧光漂白后恢复实验图像处理方法,逐一对各个所述待分析样本图像进行处理。
[0030]第二方面,本专利技术还提供一种荧光漂白后恢复实验图像处理装置,包括:
[0031]接收单元,用于接收输入的待分析样本图像,所述待分析样本图像中包括至少一个漂白结构;
[0032]确定单元,用于根据用户输入确定所述待分析样本图像的类型;
[0033]位移样本分析单元,用于在所述待分析样本图像为位移样本的情况下,对所述位移样本中的各个漂白结构分别进行位移校正和数据分析;
[0034]稳定样本分析单元,用于在所述待分析样本图像为稳定样本的情况下,对所述稳定样本中的各个漂白结构分别进行数据分析。
[0035]第三方面,本专利技术还提供一种电子设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述程序时实现如第一方面所述荧光漂白后恢复实验数据处理方法。
[0036]第四方面,本专利技术还提供一种非暂态计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该计算机程序被处理器执行时实现如第一方面所述荧光漂白后恢复实验图像处理方法。
[0037]本专利技术实施例提供的荧光漂白后恢复实验图像处理方法及装置,能够实现对待分析样本图像中的漂白结构进行批量数据分析,以及对位移样本中的发生位移的漂白结构进行批量运动校正,避免了相关技术中采用人工手动逐个分析待分析样本图像中的漂白结构,甚至需要逐帧更改ROI的位置的问题,节省了大量的时间和人力成本,提高了荧光漂白后恢复实验数据分析的效率。
附图说明
[0038]为了更清楚地说明本专利技术或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作一简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图是本专利技术的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0039]图1是本专利技术实施例提供的荧光漂白后恢复实验图像处理方法的流程示意图之一;
[0040]图2是本专利技术实施例提供的对位移样本中的各个漂白结构进行位移校正的流程示意图;
[0041]图3是本专利技术实施例提供的荧光漂白后恢复实验图像处理方法的流程示意图之二;
[0042]图4是本专利技术实施例提供的荧光漂白后恢复实验图像处理方法的流程示意图之三;
[0043]图5是本专利技术实施例提供的荧光漂白后恢复实验图像处理装置的结构示意图;
[0044]图6是本专利技术实施例提供的电子设备的结构示意图。
具体实施方式
[0045]为使本专利技术的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将结合本专利技术中的附图,对本专利技术中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例是本专利技术一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本专利技术保护的范围。
[0046]下面结合图1-图4描述本专利技术实施例提供的荧光漂白后恢复实验图像处理方法。
[0047]图1是本专利技术实施例本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种荧光漂白后恢复实验图像处理方法,其特征在于,包括:接收输入的待分析样本图像,所述待分析样本图像中包括至少一个漂白结构;根据用户输入确定所述待分析样本图像的类型;在所述待分析样本图像为位移样本的情况下,对所述位移样本中的各个漂白结构分别进行位移校正和数据分析;在所述待分析样本图像为稳定样本的情况下,对所述稳定样本中的各个漂白结构分别进行数据分析。2.根据权利要求1所述的荧光漂白后恢复实验图像处理方法,其特征在于,所述对所述位移样本中的各个漂白结构分别进行位移校正和数据分析包括:获取所述各个漂白结构对应的位移前位置;基于所述位移前位置对所述待分析样本图像进行裁剪,获得所述各个漂白结构对应的子图像;将各个漂白结构的位置校正为对应子图像中的位移前位置,获得各个漂白结构对应的校正后的子图像;对所述各个校正后的子图像中的漂白结构进行数据分析。3.根据权利要求2所述的荧光漂白后恢复实验图像处理方法,其特征在于,所述将各个漂白结构的位置校正为对应子图像中的位移前位置,获得各个漂白结构对应的校正后的子图像,包括:通过移动所述各个漂白结构,将所述各个漂白结构与各自对应的子图像中的位移前位置进行对齐,获得各个漂白结构对应的校正后的子图像。4.根据权利要求1所述的荧光漂白后恢复实验图像处理方法,其特征在于,所述方法还包括:保存校正后的子图像;和/或保存校正前的子图像。5.根据权利要求1所述的荧光漂白后恢复实验图像处理方法,其特征在于,所述对所述稳定样本中的各个漂白结构分别进行数据分析,包括:取消所述各个漂白结构的选中状态;对所述各个漂白结构依次进行数据分析。6.根据权...
【专利技术属性】
技术研发人员:曹慧珍,王文娟,王瑾瑜,
申请(专利权)人:清华大学,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。