针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统技术方案

本发明专利技术公开一种针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统，包括：数据采集模块、数据比对模块、数据处理模块和数据过滤模块，其中，数据采集模块、数据比对模块、数据处理模块和数据过滤模块依次连接；数据采集模块用于采集测序原始数据和参考基因组数据；数据比对模块用于对测序原始数据和参考基因组数据进行数据比对，得到比对数据；数据处理模块用于对比对数据进行处理，得到处理数据；数据过滤模块用于对处理数据进行过滤，得到最终分析结果。本发明专利技术筛选过滤测得细胞集合中的非人细胞，从数据分析的角度弥补了流式分选等实验技术手段的精度不足，可以为下游更细化精准的单细胞水平转录水平数据分析剔除噪声和干扰。扰。扰。

【技术实现步骤摘要】
针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统


[0001]本专利技术涉及高通量转录组分析
，特别涉及一种针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统。

技术介绍

[0002]单细胞转录组测序(Single
‑
cell RNA Sequencing，scRNA
‑
Seq)在单个细胞水平上分析基因表达，并基于单个细胞的基因表达谱描述其动态特征及功能成为可能。它能够识别量化罕见的细胞类型、新的细胞状态和细胞间通信网络等，这一强大的技术已迅速被广泛应用于生物学领域，包括神经科学、癌症和发育生物学等，正在彻底改变我们对挖掘复杂组织特征的认知。人源化动物是一类携带人的功能基因、细胞、组织和/或器官的动物模型，是干细胞研究、生物医学研究中非常有价值的模型。针对人源化动物器官/组织的单细胞测序越来越广泛的被应用于肿瘤免疫、药物筛选、移植免疫等领域。尽管在测序前会通过流式分选将人细胞筛选出来，但是由于分选精度等因素，现有流式分选技术无法100％分离非人细胞，经qPCR分析验证，流式分选后的人细胞仍然可能存在非人细本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统，其特征在于，包括：数据采集模块、数据比对模块、数据处理模块和数据过滤模块，其中所述数据采集模块、数据比对模块、数据处理模块和数据过滤模块依次连接；所述数据采集模块用于采集测序原始数据和参考基因组数据；所述数据比对模块用于对所述测序原始数据和所述参考基因组数据进行数据比对，得到比对数据；所述数据处理模块用于对所述比对数据进行处理，得到处理数据；所述数据过滤模块用于对所述处理数据进行过滤，得到最终分析结果。2.根据权利要求1所述的针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统，其特征在于：所述测序原始数据包括人源化动物器官组织的单细胞转录组测序数据；所述参考基因组数据包括人类基因组和人源化动物所属物种基因组。3.根据权利要求2所述的针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统，其特征在于：所述数据比对模块包括基于人类基因组比对单元和基于非人类基因组比对单元；其中，所述基于人类基因组比对单元用于所述人类基因组和所述人源化动物器官组织的单细胞转录组测序数据进行数据比对，得到第一比对数据；所述基于非人类基因组比对单元用于所述人源化动物所属物种基因组和所述人源化动物器官组织的单细胞转录组测序数据进行数据比对，得到第二比对数据。4.根据权利要求1所述的针对人源化动物单细胞转录组测序的非人细胞过滤系统，其特征在于：所述数据处理模块包括：数据读取单元、数据质控单元、数据降维单元和数据聚类单元；其中，所述数据读取单元用于读取所述比对数据并构建分析对象；所述数据质控单元用于基于若干质控指标获取高质量细胞数据集；所述数据降维单元用于对所述高质量细胞数据集进行主成分提取，得到降维数据；所述数据聚类单...

【专利技术属性】
技术研发人员：付聪，董帅，侯欣彤，胡正，杨永广，
申请(专利权)人：吉林大学第一医院，
类型：发明
国别省市：