双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用制造技术

本发明专利技术属于生物技术领域，尤其是涉及双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用。本发明专利技术利用二代测序技术对162头双峰驼进行基因组重测序，通过与骆驼非脂固体率性状进行全基因组关联分析，鉴定出EVX2基因中与双峰驼驼乳中非脂固体率高/低相关的分子标记。该标记位于5号染色体48754135bp位点，发生C>A单碱基突变(g.48754135C>A)，该突变位点可以提高驼奶的非脂固体率，利用该标记能针对双峰驼的驼非脂固体率性状开展分子标记辅助选择。驼的驼非脂固体率性状开展分子标记辅助选择。驼的驼非脂固体率性状开展分子标记辅助选择。

【技术实现步骤摘要】
双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用


[0001]本专利技术属于生物
，尤其是涉及双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用。

技术介绍

[0002]双峰驼乳营养成分多、胰岛素含量高、易消化吸收而深受销费者喜爱，在国内外市场上供不应求。但是我国双峰驼品种原始，未进行过乳用性驼的定向选育，平均产乳水平较低，日产乳量仅1kg/峰左右，而个别驼日产量可达6kg以上，个体间差异极大，选育提高产乳量的空间很大。但有关双峰驼产奶性状相关基因研究报道较少，而利用现代生物分子标记辅助双峰驼育种提高产奶性能的技术尚未见报道。目前乳用性状分子水平上的研究多集中在牛、羊上，而双峰驼乳用性能的研究则主要集中于表型数据的收集与整理及初期泌乳规律和泌乳特性的分析上。因此，亟待进一步从分子遗传水平深入研究双峰驼泌乳机制及调控机理，是加快双峰驼乳用性能提高的主要途径之一。双峰驼是内蒙古特色畜种资源，双峰驼役用的作用已经大大减弱，正在由传统的单一的生产方式向生产专门化、商品化的方向转变。驼产品主要包括：驼乳、驼肉、驼皮、驼骨等。驼乳是其中重要一个本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种双峰驼产奶性状相关基因EVX2作为与双峰驼产奶性状相关的分子遗传标记的应用，其特征在于，EVX2基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产奶性状具体是指双峰驼非脂固体率。3.一种与双峰驼非脂固体率相关的SNP分子标记，其特征在于，位于双峰驼5号染色体48754135处核酸位点，该位点的碱基为C或A，包含在EVX2基因内含子内，其中，EVX2基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。4.权利要求3所述SNP分子标记进行选育或辅助选育双峰驼泌乳相关品种或品系的方法，其特征在于，是选育或辅助选育非脂固体率高/低的双峰驼。5.根据权利要求4所述SNP分子标记进行选育或辅助选育双峰驼泌乳相关品种或品系的方法，其特征在于，基于所述SNP分子标记选育或辅助选育非脂固体率高/低的双峰驼详细步骤为：采集双峰驼组织样或血液样本，提取双峰驼基因组DNA，检测双峰驼的第5号染色体48754135核苷酸的序列为C或A，确定待测双峰驼的基因型是CC、CA或AA型，根据需要选择AA基因型或者CC基因型的双峰驼进行下一步选种和/或育种。6.根据权利要求5所述SNP分子标记进行选育或辅助选育双峰驼泌乳相关品种或品系的方法，其特征在于，所述AA基因型双峰驼非脂固体率高于CA型双峰驼，CA基因型双峰驼非脂固体率则高于CC基因型双峰驼。7.一种鉴定权利要求3所述SNP分子标记的方法，其特征在于，具体步骤为：1)记录产奶性状：采集并获取双峰驼产奶性状，记录其乳脂率及其影响因素，包括群体、年份、胎次、年龄、饲养方式、采样日期；2)获取双峰驼样本：采取对应双峰驼耳部组织样本，收集于离心管中，加入无水乙醇浸没样品，密封编号后于
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80℃保存备用；3)基因组DNA提取：按照动物组织样DNA提取试剂盒说明书的流程，提取骆驼基因组DNA样品，使用NanoDrop 2000检测DNA样品的浓度和质量，并采用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性；4)基因组重测序采用Illumina公司标准建库流程制备测序文库，用Hiseq测序平台进行双峰驼基因组重测序，测序深度为4x；5)检测变异位点：用PLINK软件对测得的原始文库数据进行过滤处理，以减少碱基错误对结果造成的影响，过滤标准如下：(1)去除带接头的序列；(2)去除无法确定碱基信息的序列；(3)当单端序列含有质量低于5，需要去除此对序列；(4)仅保留双端序列；6)全基因组关联分析：采用Vcftools软...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘佳佳，孟和，周浩，秦超，朱见深，蒋升瑶，杨文豪，王丽媛，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：