用于确定肠内微生物群系指数的装置、方法及存储指令的存储介质制造方法及图纸

技术编号:37400027 阅读:7 留言:0更新日期:2023-04-30 09:28
本公开提出一种用于确定肠内微生物群系指数的装置。根据本公开的装置可以从检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息,基于检查信息确定关于肠内微生物相似度的第一信息、关于肠内有害微生物比率的第二信息、关于肠内有益微生物比率的第三信息和/或关于肠内微生物多样性的第四信息,并基于确定的信息确定指示对象的肠内微生物群系的状态的肠内微生物群系指数。系指数。系指数。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于确定肠内微生物群系指数的装置、方法及存储指令的存储介质


[0001]本公开涉及一种用于确定肠内微生物群系指数的技术。

技术介绍

[0002]人体内有众多的微生物共生,这些微生物分布在呼吸器官、口腔和皮肤等处,但大部分存在于包括大肠在内的消化器官中。此时共生的微生物未引起疾病而聚集的情况叫做正常菌群。正常菌群起到防止对人有害的病原性微生物附着于人体的作用。尤其是肠,由于数百种微生物形成复杂的生态系统并生活,因此人们维持正常菌群以维持健康状态非常重要,正常菌群和肠内免疫系统一同起作用而维持平衡状态,这被称为稳态(Homeostasis)。但是,如果由于外部因素导致正常菌群不平衡,或者正常菌群与有害的病原性微生物之间的比例发生变化而脱离正常范围,则成为失调状态(dysbiosis)。最近的研究表明,肠内发生的失调状态与各种症状或多种疾病有关,据报道与包括具有代表性的炎症性肠病在内的代谢综合症、肥胖、糖尿病、心血管疾病等有关。
[0003]因此,为了确定个人的健康状况或个人所具有的疾病的危险性,准确了解肠内菌群状态非常重要。随着新一代测序技术(Next

Generation Sequencing,NGS)和能够分析广泛的基因组信息的生物信息学的发展,快速分析肠内菌群变得可能。肠内微生物群系(microbiome)意味着这样分析的肠内微生物群落的所有遗传信息,肠内微生物群系可以用于了解肠内菌群状态。
[0004]不过,肠内菌群状态不是以几种微生物物种为基础来简单化推导出的,而是应该从生态学角度来了解的。这是因为肠内菌群本身就是数百种微生物构成的复杂的生态系统。但是,现有的诊断方法片面依赖肠内检测的微生物的已知的功能性特性,或者利用对象的健康记录而受到限制。此外,如果肠内微生物群系的状态未被正确诊断,则试图调节肠内微生物群系的尝试(例:摄取益生菌)的效率可能会降低。
[0005]因此,需要综合考虑肠内微生物群系的生态指标来诊断对象者的健康状态的方法。另外,需要基于对象的肠内微生物群系详细区分肠类型,提出适合于对象的肠类型的肠内微生物群系调节方法。

技术实现思路

[0006]本公开提供一种用于确定肠内微生物群系指数的技术。
[0007]作为本公开的一方面,可以提出用于确定肠内微生物群系指数的装置。根据本公开的一方面的装置,可以包括:通信电路;一个以上的处理器;及一个以上的存储器,存储当由所述一个以上的处理器执行时用于使所述一个以上的处理器执行运算的指令。所述一个以上的处理器,可以利用所述通信电路,从而从一个以上的检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息,可以基于上述检查信息确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所
述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息;可以基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息确定指示所述对象的微生物群系(microbiome)的状态的肠内微生物群系指数。
[0008]在一个实施例中,所述一个以上的处理器,可以利用所述通信电路,从而将指示所述肠内微生物群系指数的信息发送到所述对象的装置。
[0009]在一个实施例中,所述一个以上的存储器还可以存储对于所述基准试样的信息,所述一个以上的处理器,可以基于所述检查信息及对于所述基准试样的信息,确定所述生物试样内各微生物物种的存在比率的分布与所述基准试样内各微生物物种的存在比率的分布之间的相似度,可以基于所述相似度确定所述第一信息。
[0010]在一个实施例中,所述一个以上的处理器,可以基于所述检查信息,确定相对于所述生物试样内预设置的共生微生物物种及有害微生物物种、所述有害微生物物种的存在比率,可以基于所述存在比率,确定所述第二信息。
[0011]在一个实施例中,所述一个以上的处理器,可以基于所述检查信息,确定所述生物试样内预先设置的有益微生物物种的存在比率,可以基于所述存在比率,确定所述第三信息。
[0012]在一个实施例中,所述一个以上的处理器,可以基于所述检查信息,确定所述生物试样内的所有微生物物种的数量及所述所有微生物物种各自的存在比率的分布均匀程度,可以基于所述所有微生物物种的数量及所述均匀程度,确定所述第四信息。
[0013]在一个实施例中,所述一个以上的处理器,可以应用在各所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息中预先设置的加权值,从而确定所述肠内微生物群系指数。
[0014]作为本公开的一方面,可以提出用于确定肠内微生物群系指数的方法。根据本公开的一方面的方法,可以在包括一个以上的处理器、以及一个以上的存储器的装置中被执行,所述存储器存储要由所述一个以上的处理器执行的指令。确定肠内微生物群系指数的方法,可以包括以下步骤:所述一个以上的处理器,从一个以上的检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息;所述一个以上的处理器,基于所述检查信息确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息;以及,所述一个以上的处理器,基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息,确定指示所述对象的微生物群系的状态的肠内微生物群系指数。
[0015]作为本公开的一方面,可以提出存储有用于确定肠内微生物群系指数的指令的非暂时性计算机可读存储介质。存储于根据本公开的一方面的存储介质的指令,作为在计算机执行的指令,当由一个以上的处理器执行时,所述一个以上的处理器,可以基于对于从一个以上的检查装置获得的对象的生物试样的检查信息,确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息,可以基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息,确定指示所述对象的微生物群系的状态的肠内微生物群系指数。
[0016]作为本公开的一方面,可以提出用于确定肠类型的装置。根据本公开的一方面的装置,可以包括:通信电路;一个以上的处理器;及一个以上的存储器,存储当由所述一个以上的处理器执行时用于使所述一个以上的处理器执行运算的指令。所述一个以上的处理器,可以利用所述通信电路,从而从一个以上的检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息,可以基于指示基于所述检查信息中对于所述生物试样的炎症特异性生物标志物的数值和/或所述检查信息而确定的所述对象的肠胃微生物群系的状态的肠内微生物群系指数,将所述对象的肠类型确定为第一类型,可以从所述一个以上的存储器获得与所述肠类型相关的肠管理信息,所述肠管理信息可以指示具有所述肠类型的所述对象的肠内微生物群系调节方案。
[0017]在一个实施例中,所述一个以上的处理器,可以利用所述通信电路,从而将本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种装置,包括:通信电路;一个以上的处理器;以及一个以上的存储器,存储当由所述一个以上的处理器执行时使所述一个以上的处理器执行运算的指令,其中,所述一个以上的处理器,利用所述通信电路,从一个以上的检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息,基于所述检查信息确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息,基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息,确定指示所述对象的肠内微生物群系(microbiome)的状态的肠内微生物群系指数。2.根据权利要求1所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,利用所述通信电路,将指示所述肠内微生物群系指数的信息发送到所述对象的装置。3.根据权利要求1所述的装置,其中,所述一个以上的存储器还存储对于所述基准试样的信息,所述一个以上的处理器,基于所述检查信息及对于所述基准试样的信息,确定所述生物试样内各微生物物种的存在比率的分布与所述基准试样内各微生物物种的存在比率的分布之间的相似度,基于所述相似度确定所述第一信息。4.根据权利要求1所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,基于所述检查信息,确定对于所述生物试样内预设置的共生微生物物种及有害微生物物种的所述有害微生物物种的存在比率,基于所述存在比率确定所述第二信息。5.根据权利要求1所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,基于所述检查信息,确定所述生物试样内预先设置的有益微生物物种的存在比率,基于所述存在比率确定所述第三信息。6.根据权利要求1所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,基于所述检查信息,确定所述生物试样内的所有微生物物种的数量及所述所有微生物物种各自的存在比率的分布均匀程度,基于所述所有微生物物种的数量及所述均匀程度,确定所述第四信息。7.根据权利要求1所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,应用在各所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息中预先设置的加权值,从而确定所述肠内微生物群系指数。
8.一种由装置执行的方法,所述装置包括一个以上的处理器及存储要由所述一个以上的处理器执行的指令的一个以上的存储器,所述方法包括以下步骤:由所述一个以上的处理器,从一个以上的检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息;由所述一个以上的处理器,基于所述检查信息确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息;以及由所述一个以上的处理器,基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息,确定指示所述对象的肠内微生物群系的状态的肠内微生物群系指数。9.一种非暂时性计算机可读存储介质,其存储有当由一个以上的处理器执行时使所述一个以上的处理器执行运算的指令,所述指令使所述一个以上的处理器执行以下步骤:基于对于从一个以上的检查装置获得的对象的生物试样的检查信息,确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息;以及基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息,确定指示所述对象的肠内微生物群系的状态的肠内微生物群系指数。10.一种装置,包括:通信电路;一个以上的处理器;以及一个以上的存储器,存储当由所述一个以上的处理器执行时使所述一个以上的处理器执行运算的指令,其中,所述一个以上的处理器,利用所述通信电路,从一个以上的检查装置获得对于对象的生物试样的检查信息,基于指示基于所述检查信息中对于所述生物试样的炎症特异性生物标志物的数值和/或所述检查信息而确定的所述对象的肠内微生物群系的状态的肠内微生物群系指数,将所述对象的肠类型确定为第一类型,从所述一个以上的存储器获得与所述肠类型相关的肠管理信息,所述肠管理信息指示具有所述肠类型的所述对象的肠内微生物群系调节方案。11.根据权利要求10所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,利用所述通信电路,将指示所述肠类型的信息及所述肠管理信息发送到所述对象的装置。12.根据权利要求10所述的装置,其中,所述炎症特异性生物标志物为选自变形菌(Proteobacteria)门(Phylum)微生物及梭杆菌(Fusobacterium)属(Genus)微生物中的至少一种。13.根据权利要求12所述的装置,其中,如果对于所述生物试样的所述变形菌门微生物的存在比率超过10%或者对于所述生
物试样的所述梭杆菌属微生物的存在比率超过1%,则所述一个以上的处理器将所述肠类型确定为所述第一类型。14.根据权利要求10所述的装置,其中,如果对于所述生物试样的所述炎症特异性生物标志物的数值满足预先设置的第一标准和/或所述肠内微生物群系指数满足预先设置的第二标准,则所述一个以上的处理器将所述肠类型确定为所述第一类型。15.根据权利要求10所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,基于所述检查信息确定关于预先设置的基准试样和所述生物试样之间的微生物相似度的第一信息、关于所述对象的肠内有害微生物比率的第二信息、关于所述对象的肠内有益微生物比率的第三信息及关于所述对象的肠内微生物多样性的第四信息,基于所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息,确定所述肠内微生物群系指数。16.根据权利要求15所述的装置,其中,所述一个以上的处理器,应用在各所述第一信息、所述第二信息、所述第三信息及所述第四信息中预先设置的加权值,从而确定所述肠内微生物群系指数。17.根据权利要求10所述的装置,其中,...

【专利技术属性】
技术研发人员:闵义基吴炫昔金南逸林廷玟金恩惠
申请(专利权)人:希杰生物科技株式会社
类型:发明
国别省市:

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