一种药物肝毒性预测方法、装置、系统和介质制造方法及图纸

本申请提供了一种药物肝毒性预测方法、装置、系统和介质，该方法包括：将与待预测药物接触后人肝脏细胞进行测序，得到待预测药物接触后人肝脏细胞的基因组表达谱；根据表达谱，计算当前基因通路中包含基因的差异倍数绝对值的和，作为当前基因通路的毒性分数；根据当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到当前基因通路的Z值；当Z值大于1.5时，则预测待预测药物具有肝毒性。从而本申请无需大量的活体动物作为实验基础，即可进行准确、及时、有效和灵敏的药物肝毒性预测，在安全、环保和动物保护等方面具有较好的优势。具有实验周期短和耗费较小等优点。有实验周期短和耗费较小等优点。有实验周期短和耗费较小等优点。

【技术实现步骤摘要】
一种药物肝毒性预测方法、装置、系统和介质


[0001]本申请涉及生物医药领域，特别涉及一种药物肝毒性预测方法、装置、系统和介质。

技术介绍

[0002]药物安全性是决定创新药物研发成败的关键因素，临床前安全性评价是确定新药安全性能指标并减少其毒性作用的重要依据。在药物研发早期以及临床使用中对药物肝毒性进行预测对于提高研发成功率和合理用药具有重要意义。
[0003]传统的药物肝毒性预测方法主要是基于体内外实验模型对药物的毒性安全进行评估，该方法需要大量的活体动物进行实验基础，具有实验周期长、耗费高等缺点。随着安全、环保、动物保护等方面的法规要求日益严格，全球化的市场竞争也要求药物开发周期大幅缩减。由于药物肝毒性发生机制复杂，如何提高药物肝毒性预测的准确性以及适用性，依然面临重大挑战。因此，如何克服传统药物肝毒性预测方法所存在的缺点，开发高效的药物肝毒性预测方法具有重要意义。

技术实现思路

[0004]有鉴于此，提供该
技术实现思路
部分以便以简要的形式介绍构思，这些构思将在后面的具体实施方式部分被详细描述。该
技术实现思路
部分并不旨在标识要求保护的技术方案的关键特征或必要特征，也不旨在用于限制所要求的保护的技术方案的范围。
[0005]本申请的目的在于提供一种药物肝毒性预测方法、装置、系统和介质，可以准确有效的进行药物肝毒性预测，在安全、环保、动物保护等方面具有较好的优势。具有实验周期短、耗费较小等优点。
[0006]为实现上述目的，本申请有如下技术方案：
[0007]第一方面，本申请实施例提供了一种药物肝毒性预测方法，包括：
[0008]将与待预测药物接触后人肝脏细胞进行测序，得到所述待预测药物接触后人肝脏细胞的基因组表达谱；
[0009]根据所述表达谱，计算当前基因通路中包含基因的差异倍数绝对值的和，作为所述当前基因通路的毒性分数；
[0010]根据所述当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到所述当前基因通路的Z值；
[0011]当所述Z值大于1.5时，则预测所述待预测药物具有肝毒性。
[0012]在一种可能的实现方式中，所述根据所述当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到所述当前基因通路的Z值，包括：
[0013][0014]其中，Z为所述Z值，X为所述当前基因通路的毒性分数，μ0为所述平均值，σ为所述标准差值。
[0015]在一种可能的实现方式中，所述当前基因通路，包括：细胞周期基因通路、复制基因通路、化学致癌基因通路、细胞凋亡基因通路、溶酶体基因通路、坏死性凋亡基因通路、p53信号基因通路、细胞衰老基因通路、胆管增生基因通路、肝纤维化基因通路、肝脂肪变性基因通路、细胞核分裂调节基因通路、造血调节基因通路、甘油磷脂合成基因通路、细胞坏死基因通路或白细胞浸润基因通路。
[0016]在一种可能的实现方式中，所述测序包括：高通量测序。
[0017]第二方面，本申请实施例提供了一种药物肝毒性预测装置，包括：
[0018]测序单元，用于将与待预测药物接触后人肝脏细胞进行测序，得到所述待预测药物接触后人肝脏细胞的基因组表达谱；
[0019]毒性分数计算单元，用于根据所述表达谱，计算当前基因通路中包含基因的差异倍数绝对值的和，作为所述当前基因通路的毒性分数；
[0020]Z值计算单元，用于根据所述当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到所述当前基因通路的Z值；
[0021]预测单元，用于当所述Z值大于1.5时，则预测所述待预测药物具有肝毒性。
[0022]在一种可能的实现方式中，所述Z值计算单元，具体用于计算得到所述当前基因通路的Z值：
[0023][0024]其中，Z为所述Z值，X为所述当前基因通路的毒性分数，μ0为所述平均值，σ为所述标准差值。
[0025]在一种可能的实现方式中，所述当前基因通路，包括：细胞周期基因通路、复制基因通路、化学致癌基因通路、细胞凋亡基因通路、溶酶体基因通路、坏死性凋亡基因通路、p53信号基因通路、细胞衰老基因通路、胆管增生基因通路、肝纤维化基因通路、肝脂肪变性基因通路、细胞核分裂调节基因通路、造血调节基因通路、甘油磷脂合成基因通路、细胞坏死基因通路或白细胞浸润基因通路。
[0026]在一种可能的实现方式中，所述测序包括：高通量测序。
[0027]第三方面，本申请实施例提供了一种药物肝毒性预测系统，包括：
[0028]存储器，用于存储计算机程序；
[0029]处理器，用于执行所述计算机程序时实现如上述所述药物肝毒性预测方法的步骤。
[0030]第四方面，本申请实施例提供了一种计算机可读介质，所述计算机可读介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理执行时实现如上述所述药物肝毒性预测方法的步骤。
[0031]与现有技术相比，本申请实施例具有以下有益效果：
[0032]本申请实施例提供了一种药物肝毒性预测方法、装置、系统和介质，该方法包括：将与待预测药物接触后人肝脏细胞进行测序，得到待预测药物接触后人肝脏细胞的基因组表达谱；根据表达谱，计算当前基因通路中包含基因的差异倍数绝对值的和，作为当前基因
通路的毒性分数；根据当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到当前基因通路的Z值；当Z值大于1.5时，则预测待预测药物具有肝毒性。从而本申请无需大量的活体动物作为实验基础，即可进行准确、有效和灵敏的药物肝毒性预测，在安全、环保和动物保护等方面具有较好的优势。具有实验周期短和耗费较小等优点。
附图说明
[0033]为了更清楚地说明本申请实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本申请的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其它的附图。
[0034]结合附图并参考以下具体实施方式，本公开各实施例的上述和其他特征、优点及方面将变得更加明显。贯穿附图中，相同或相似的附图标记表示相同或相似的元素。应当理解附图是示意性的，原件和元素不一定按照比例绘制。
[0035]图1示出了本申请实施例提供的一种药物肝毒性预测方法的流程图；
[0036]图2示出了本申请实施例提供的待预测药物为马兜铃内酰胺II时计算得到的Z值的热力示意图；
[0037]图3示出了本申请实施例提供的待预测药物为斑蝥、苍耳子或苍术时计算得到的Z值的热力示意图；
[0038]图4示出了本申请实施例提供的一种药物肝毒性预测装置的示意图。
具体实施方式
[0039]为使本申请的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂，下面结合附图对本申请的具本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种药物肝毒性预测方法，其特征在于，包括：将与待预测药物接触后人肝脏细胞进行测序，得到所述待预测药物接触后人肝脏细胞的基因组表达谱；根据所述表达谱，计算当前基因通路中包含基因的差异倍数绝对值的和，作为所述当前基因通路的毒性分数；根据所述当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到所述当前基因通路的Z值；当所述Z值大于1.5时，则预测所述待预测药物具有肝毒性。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述当前基因通路的毒性分数、多个预设基因通路多次计算得到的基因通路的毒性分数的平均值和标准差值，计算得到所述当前基因通路的Z值，包括：其中，Z为所述Z值，X为所述当前基因通路的毒性分数，μ0为所述平均值，σ为所述标准差值。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述当前基因通路，包括：细胞周期基因通路、复制基因通路、化学致癌基因通路、细胞凋亡基因通路、溶酶体基因通路、坏死性凋亡基因通路、p53信号基因通路、细胞衰老基因通路、胆管增生基因通路、肝纤维化基因通路、肝脂肪变性基因通路、细胞核分裂调节基因通路、造血调节基因通路、甘油磷脂合成基因通路、细胞坏死基因通路或白细胞浸润基因通路。4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述测序包括：高通量测序。5.一种药物肝毒性预测装置，其特征在于，包括：测序单元，用于将与待预测药物接触后人肝脏细胞进行测序，得到所述待预测药物接触后人肝脏细胞的基因组表达谱；毒性分数计算单元，用于根据所述表达谱，计算当前...

【专利技术属性】
技术研发人员：张晓玲，郭弘妍，王辉，商雪琪，程京，
申请(专利权)人：博奥生物集团有限公司，
类型：发明
国别省市：