与菠菜抗霜霉病基因RPF2紧密连锁的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及植物分子遗传育种技术领域，具体涉及与菠菜抗霜霉病基因RPF2紧密连锁的SNP分子标记及其应用。本发明专利技术提供的SNP分子标记为KMR2

【技术实现步骤摘要】
molecular marker linked to Pfs
‑
1.Phytopathology,98(8):894
‑
900.)；Feng等利用BSA开发了与RPF1、RPF2和RPF3连锁的InDel、SCAR标记(Feng,C.,Correll,JC.,Kammeijer,KE.,Koike,ST.(2014).Identification of new races and deviating strains of the spinach downy mildew pathogen Peronospora farinosa f.sp.spinaciae.Plant Disease,98(1):145
‑
152.)，但这些标记准确度较低，稳定性较差，不适宜用于大规模的分子标记辅助选择育种，严重影响菠菜霜霉病抗性育种的进程。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的是提供一种与菠菜抗霜霉病基因RPF2紧密连锁的SNP分子标记以及该分子标记的检测引物。本专利技术的另一目的是提供该分子标记及其检测引物的应用。
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.与菠菜抗霜霉病基因RPF2紧密连锁的SNP分子标记，其特征在于，其为分子标记KMR2
‑1‑
2，其多态性位点位于菠菜3号染色体的第1371076位，多态性为C/T。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，多态性位点位于如SEQ ID NO.1所示序列的第45位，多态性为C/T。3.根据权利要求1或2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记由序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.4所示的引物扩增得到，或者由序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物扩增得到。4.根据权利要求1～3任一项所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的基因型为TT或CT，对应于含有菠菜抗霜霉病基因RPF2，表现为抗霜霉病；所述SNP分子标记的基因型为CC，对应于不含有菠菜抗霜霉病基因RPF2。5.用于检测权利要求1～4任一项所述的SNP分子标记的特异性引物组，其特征在于，其包含具有如SEQ ID NO.2
‑
3所示序列的正向引物以及具有如SEQ ID NO.4所示序列的反向引物；优选地，所述正向引物的5
’
端还连接有荧光标签序列。6.含有权利要求5所述的特异性引物组的试剂盒。7.权利要求1～4任一项所述的SNP分子标记或权利要求5所述的特异性引物组或权利要求6所述的试剂盒的如下任一种应用：(1)在鉴定菠...

【专利技术属性】
技术研发人员：钱伟，刘志远，徐兆生，张合龙，王晓武，武剑，
申请(专利权)人：中国农业科学院蔬菜花卉研究所，
类型：发明
国别省市：