位点特异性抗体偶联物及其制备方法技术

技术编号:37134004 阅读:21 留言:0更新日期:2023-04-06 21:32
本申请提供了位点特异性蛋白质偶联物及其制备方法。所述蛋白质偶联物包含蛋白质和寡糖,其中所述寡糖包含(I),其中:所述GlcNAc直接或间接与所述蛋白质的氨基酸连接;所述Gal是半乳糖;所述(Fuc)是岩藻糖,b是0或1;所述Fuc*包含与目标分子(MOI)连接的岩藻糖或岩藻糖衍生物,所述蛋白质包含抗原结合片段和/或Fc片段。Fc片段。Fc片段。Fc片段。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】位点特异性抗体偶联物及其制备方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2020年8月21日提交的标题为“抗体偶联物和用于制备抗体偶联物的化学酶N

聚糖编辑策略”的申请号为PCT/CN2020/110607的PCT申请的优先权的权益,所述申请的全部内容通过引用并入本文。

技术介绍

[0003]抗体偶联物,即通过连接子与目标分子(MOI)偶联的抗体,在本领域是已知的。它们独特的性质组合了单克隆抗体(mAb)的特异性和MOI的活性(诸如毒性)。抗体

偶联物作为将高效药物递送至肿瘤的强效试剂,具有极小的脱靶毒性。大约有数百种抗体偶联药物已经被FDA批准或正在进行临床/临床前评估。。
[0004]本领域已知的抗体

偶联物通常有几个缺陷。例如,大多数经FDA批准或正在进行临床评估的ADC通过修饰天然氨基酸侧链(赖氨酸、半胱氨酸)与有效载荷偶联,导致药物

抗体比(DAR)的随机分布。这种ADC的异质混合物已被证明显示出低疗效和窄治疗窗。此外,这种连接不稳定,导致高本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种蛋白质偶联物,其包含蛋白质和寡糖,其中所述寡糖包含的结构,其中:所述GlcNAc与所述蛋白质的氨基酸直接或间接连接;所述Gal是半乳糖;所述(Fuc)是岩藻糖,b是0或1;所述Fuc*包含岩藻糖或岩藻糖衍生物和目标分子(MOI);所述蛋白质包含抗原结合片段和/或Fc片段。2.如权利要求1所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖是N

连接的寡糖。3.如权利要求1

2中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖与所述蛋白质的天冬酰胺(Asn)残基连接。4.如权利要求1

3中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖中的所述GlcNAc与所述蛋白质的Asn残基直接连接。5.如权利要求1

3中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖中的所述GlcNAc与所述寡糖的糖连接。6.如权利要求5所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖中的所述GlcNAc与所述寡糖的甘露糖连接。7.如权利要求1

6中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质包含Fc片段。8.如权利要求1

7中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质包含Fc片段,并且所述寡糖与所述Fc片段连接。9.如权利要求1

8中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖与所述Fc片段的CH2结构域连接。10.如权利要求1

9中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述寡糖与所述Fc片段的Asn297连接,所述Fc片段根据Kabat编号系统编号。11.如权利要求1

10中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质是抗体。12.如权利要求1

11中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质是抗体,并且所述蛋白质偶联物能够与抗原结合,任选地,所述蛋白质偶联物具有与相应抗体相似的对抗原的结合亲和力。13.如权利要求12所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质偶联物的结合亲和力是所述相应抗体的结合亲和力的约0.1%至约100000%。14.如权利要求12

13中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质偶联物的结合亲和力是所述相应抗体的结合亲和力的约1%至约10000%。15.如权利要求12

14中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质偶联物的结合亲和力是所述相应抗体的结合亲和力的约10%至约1000%。16.如权利要求12

15中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质偶联物的结合亲和力是所述相应抗体的结合亲和力的约50%至约200%。17.如权利要求11

16中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述抗体是单克隆抗体。18.如权利要求11

17中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述抗体是IgG抗体。
19.如权利要求11

18中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述抗体是人源化抗体。20.如权利要求1

19中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc*的岩藻糖或岩藻糖衍生物通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与所述GlcNAc连接。21.如权利要求1

20中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Gal通过Galβ1,4GlcNAc键联与所述GlcNAc连接。22.如权利要求1

21中任一项所述的蛋白质偶联物,其中(Fuc)的所述岩藻糖通过α1,6键联与所述GlcNAc连接。23.如权利要求1

22中任一项所述的蛋白质偶联物,其中Fuc*的所述MOI包含活性部分。24.如权利要求23所述的蛋白质偶联物,其中所述MOI的所述活性部分包含化学活性部分、酶促活性部分、生物活性部分和/或药学活性部分。25.如权利要求23

24中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述MOI的所述活性部分包含化学活性部分和/或酶促活性部分。26.如权利要求23

25中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述MOI的所述活性部分包含能够参与连接反应的官能团Y1。27.如权利要求26所述的蛋白质偶联物,其中所述Y1包含能够参与生物正交反应的功能性部分。28.如权利要求26

27中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y1包含选自以下组的功能性部分:叠氮、末端炔、环状炔、四嗪、1,2,4

三嗪、末端烯、反式环辛烯、环丙烯、降冰片烯、酮、醛、氨氧基、硫醇、马来酰亚胺及它们的衍生物。29.如权利要求26

28中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y1包含选自以下组的功能性部分:能性部分:其中R1和R2的每一种独立地选自以下组:氢、卤素、C1‑
C
22
烷基、C5‑
C
22
(杂)芳基、C7‑
C
22
烷基(杂)芳基和C7‑
C
22
(杂)芳基烷基,其中所述烷基各自任选被一个或多个选自以下组的杂原子中断:O、N和S,并且其中所述烷基、(杂)芳基、烷基(杂)芳基和(杂)芳烷基各自独立地任选地被取代。30.如权利要求26

29中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y1包含选自以下组的功能性部分::31.如权利要求23

24中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述MOI的所述活性部分包含P,并且所述P是生物学和/或药物活性物质。
32.如权利要求31所述的蛋白质偶联物,其中所述P是药学活性物质。33.如权利要求31

32中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含细胞毒素、激动剂、拮抗剂、抗病毒剂、抗菌剂、放射性同位素或放射性核素、金属螯合剂、寡核苷酸、肽、多肽、蛋白质或其任意组合。34.如权利要求31

33中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含细胞毒素、激动剂、拮抗剂、抗病毒剂、抗菌剂、寡核苷酸、肽、多肽或其任意组合。35.如权利要求31

34中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含细胞毒素、激动剂、拮抗剂或其任意组合。36.如权利要求31

32中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含抗肿瘤剂。37.如权利要求36的蛋白质偶联物,其中所述P包含导致细胞损伤或细胞死亡的物质。38.如权利要求31

37中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含细胞毒素。39.如权利要求38所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含选自以下组的细胞毒素:DNA损伤剂、拓扑异构酶抑制剂和微管抑制剂。40.如权利要求38

39中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含选自以下组的细胞毒素:吡咯并苯二氮卓、奥瑞他汀、美登素、多卡霉素、微管溶素、烯二炔、多柔比星、基于吡咯的驱动蛋白纺锤体蛋白抑制剂、卡利奇霉素、鹅膏蕈碱、喜树碱。41.如权利要求38

40中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述P包含选自以下组的细胞毒素:MMAE、DXd、MMAF、seco

DUBA和DM4。42.如权利要求31

41中任一项所述的蛋白质偶联物,所述MOI任选地包含权利要求26

30中任一项所述的所述Y1与官能团Y2之间的连接反应之后的剩余基团Y1Y2。43.如权利要求42所述的蛋白质偶联物,其中所述Y1Y2位于Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物与所述P之间。44.如权利要求42

43中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y2包含能够参与生物正交反应的功能性部分。45.如如权利要求42

44中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y2包含选自以下组的功能性部分:叠氮、末端炔、环状炔、四嗪、1,2,4

三嗪、末端烯、反式环辛烯、环丙烯、降冰片烯、酮、醛、氨氧基、硫醇、马来酰亚胺及它们的衍生物。46.如权利要求42

45中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y2包含选自以下组的功能性部分:能性部分:其中R1和R2各自独立地选自以下组:氢、卤素、C1‑
C
22
烷基、C5‑
C
22
(杂)芳基、C7‑
C
22
烷基(杂)芳基和C7‑
C
22
(杂)芳基烷基,其中所述烷基各自任选被一个或多个选自以下组的杂原子中断:O、N和S,并且其中所述烷基、(杂)芳基、烷基(杂)芳基和(杂)芳烷基各自独立地任选地被取代。47.如权利要求42

46中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y2包含选自以下组的功
能性部分::48.如权利要求42

47中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述基团Y1Y2选自以下组:选自以下组:其中R1和R2是如上定义的。49.如权利要求42

48中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Y1和所述Y2包含选自以下组的功能性部分:a)Y1包含并且Y2包含b)Y1包含并且Y2包含、c)Y1包含并且Y2包含以及d)Y1包含、并且Y2包含其中R1和R2是如上定义的。50.如权利要求1

49中任一项所述的蛋白质偶联物,其中Fuc*的所述MOI任选地包含L,并且L是连接子。51.如权利要求50所述的蛋白质偶联物,其中所述L是可切割的连接子。52.如权利要求50

51中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述L是酸不稳定连接子、氧化还原活性连接子、光活性连接子和/或蛋白水解可切割的连接子。53.如权利要求50

52中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述L是vc

PAB连接子、GGFG连接子或二硫键连接子。54.如权利要求50

53中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述L位于Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物与所述P之间。55.如权利要求50

53中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述L位于Fuc*的所述岩藻
糖或岩藻糖衍生物与所述Y1之间。56.如权利要求50

53中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述L位于Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物与所述Y1Y2之间。57.如权利要求1

56中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc*的所述MOI任选地包含F,并且F是接头。58.如权利要求57所述的蛋白质偶联物,其中所述F是其中所述F是其中所述FL是间隔子,s是0或1,任选地s是1。59.如权利要求57

58中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述F是其中所述FL是间隔子,s是0或1,任选地s是1。60.如权利要求57

58中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述F是其中所述FL是间隔子,s是0或1,任选地s是1。61.如权利要求58

60中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述FL是多肽、PEG、烷基和/或其衍生物或以上的组合。62.如权利要求58

61中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述FL具有选自以下组的结构:构:其中所述结构的左端向Fuc连接。63.如权利要求57

62中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述F位于Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物与所述P之间。64.如权利要求57

62中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述F位于Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物与所述Y1之间。65.如权利要求57

62中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述F位于Fuc*的所述岩藻
糖或岩藻糖衍生物与所述Y1Y2之间。66.如权利要求1

65中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc*是Fuc

(F)
m

(L)
n

Y1,Fuc

(F)
m

(L)
n

P或Fuc

(F)
m

(L)
n

Y1Y2‑
(FL

)
m


(L

)
n


P,其中Fuc是所述Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物,F是接头,L是连接子,P是生物和/或药学活性物质,Y1是官能团,FL

是与FL相同定义的间隔子,L

是与L相同定义的连接子,m是0或1,n是0或1,m

是0或1,并且n

是0或1。67.如权利要求1

66中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc*是Fuc

Y1、Fuc

F

Y1、Fuc

F

L

P、Fuc

F

P、Fuc

Y1Y2‑
FL
’‑
L
’‑
P、Fuc

Y1Y2‑
FL
’‑
P、Fuc

Y1Y2‑
L
’‑
P,Fuc

F

Y1Y2‑
L
’‑
P、Fuc

F

Y1Y2‑
FL
’‑
P或Fuc

F

Y1Y2‑
FL
’‑
L
’‑
P,其中Fuc是所述Fuc*的所述岩藻糖或岩藻糖衍生物,F是接头,L是连接子,P是生物活性和/或药学活性物质,Y1是官能团,FL

是与FL相同定义的间隔子,并且L

是与L相同定义的连接子。68.如权利要求1

67中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc如下式所示并且所述Fuc*如下式所示69.如权利要求1

68中任一项所述的蛋白质偶联物,其包含1

20个70.如权利要求1

3和5

69中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc*通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与的末端LacNAc的GlcNAc连接,其中是GlcNAc,是通过α1,6键联与核心GlcNAc连接的岩藻糖(Fuc),是甘露糖,

是通过Galβ1,4GlcNAc键联与GlcNAc连接的半乳糖,并且是抗体或Fc

融合蛋白。71.如权利要求1

4和7

69中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述Fuc*通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与的核心GlcNAc连接,其中是GlcNAc,是通过α1,6键联与核心GlcNAc连接的岩藻糖(Fuc),

是通过Galβ1,4GlcNAc键联与GlcNAc连接的半乳糖,是抗体或Fc

融合蛋白,b是0或1。72.如权利要求1

3、5

70中任一项所述的蛋白质偶联物,所述蛋白质偶联物包含4个
并且如下式所示其中是GlcNAc,是通过α1,6键联与GlcNAc连接的岩藻糖(Fuc),是甘露糖,

是通过Galβ1,4GlcNAc键联与GlcNAc连接的半乳糖,Fuc*通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与GlcNAc连接,并且是抗体或Fc

融合蛋白。73.如权利要求1

4、7

69和71中任一项所述的蛋白质偶联物,所述蛋白质偶联物包含2个并且如下式所示其中是GlcNAc,是通过α1,6键联与GlcNAc连接的岩藻糖(Fuc),

是通过Galβ1,4GlcNAc键联与GlcNAc连接的半乳糖,Fuc*通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与GlcNAc连接,是抗体或Fc

融合蛋白并且b是0或1。74.如权利要求1

4、7

69、71和73中任一项所述的蛋白质偶联物,所述蛋白质偶联物包含2个并且如下式所示其中是GlcNAc,是通过Galβ1,4GlcNAc键联与GlcNAc连接的半乳糖,Fuc*通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与GlcNAc连接,并且是抗体或Fc

融合蛋白。75.如权利要求1

4、7

69、71和73中任一项所述的蛋白质偶联物,所述蛋白质偶联物包含2个并且如下式所示其中是GlcNAc,是通过α1,6键联与GlcNAc连接的岩藻糖(Fuc),

是通过Galβ1,4GlcNAc键联与GlcNAc连接的半乳
糖,Fuc*通过Fuc*α1,3GlcNAc键联与GlcNAc连接,并且是抗体或Fc

融合蛋白。76.如权利要求1

75中任一项所述的蛋白质偶联物,其中所述蛋白质偶联物是用于治疗疾病的蛋白质偶联物。77.如权利要求1

75中任一项所述的蛋白质偶联物,当所述MOI包含Y1时,所述蛋白质偶联物用于制备疾病治疗试剂。78.一种组合物,其包含权利要求1

77中任一项所述的蛋白质偶联物。79.如权利要求78所述的组合物,其包含权利要求1

3、5

70、72和76

77中任一项所述的蛋白质偶联物,具有约2.4

4的MOI与抗体的比率(MAR)。80.如权利要求79所述的组合物,其具有约为3.2

4的平均MAR。81.如权利要求79

80中任一项所述的组合物,其具有约为3.5

4的平均MAR。82.如权利要求79

81中任一项所述的组合物,其具有约为4的平均MAR。83.如权利要求78所述的组合物,其包含如权利要求1

4、7

69、71和73

77中任一项所述的蛋白质偶联物,其具有约为0.5

2的平均MOI与抗体的比率(MAR)。84.如权利要求83所述的组合物,其具有约为1.6

2的平均MAR。85.如权利要求83

84中任一项所述的组合物,其具有约为2的平均MAR。86.一种方法,其用于制备权利要求1

77中任一项所述的蛋白质偶联物或权利要求78

85中任一项所述的组合物。87.一种用于制备蛋白质偶联物的方法,其包括步骤(a):在催化剂存在的情况下,使岩藻糖衍生物供体Q

Fuc*

与包含寡糖的蛋白质接触,其中所述寡糖包含

GlcNAc(Fuc)
b

Gal,以获得包含的蛋白质偶联物,其中:所述GlcNAc与所述蛋白质的氨基酸直接或间接连接;所述Gal是半乳糖;所述(Fuc)是岩藻糖,b是0或1;所述Fuc*

包含岩藻糖或岩藻糖衍生物和目标分子(MOI

);所述蛋白质包含抗原结合片段和/或Fc片段;所述Q

Fuc*

是包含所述Fuc*

的分子。88.如权利要求87所述的方法,其包括将获得的包含的蛋白质偶联物交换到缓冲液中。89.如权利要求88所述的方法,其中所述缓冲液是制剂缓冲液或储存缓冲剂。90.如权利要求87

89中任一项所述的方法,其中所述催化剂是岩藻糖基转移酶或其功能变体或片段。91.如权利要求90所述的方法,其中所述岩藻糖基转移酶是α

1,3

岩藻糖基转移酶或其功能变体或片段。
92.如权利要求90

91中任一项所述的方法,其中所述岩藻糖基转移酶来源于细菌、线虫、吸虫或哺乳动物。93.如权利要求90

92中任一项所述的方法,其中所述岩藻糖基转移酶来源于幽门螺杆菌。94.如权利要求90

93中任一项所述的方法,其中所述岩藻糖基转移酶包含如GenBank登录号AAD07710.1或其功能变体或片段中所示的氨基酸序列。95.如权利要求90

94中任一项所述的方法,其中所述岩藻糖基转移酶包含如SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4中所示的氨基酸序列。96.如权利要求87

95中任一项所述的方法,其中所述寡糖是N

连接的寡糖。97.如权利要求87

96中任一项所述的方法,其中所述寡糖与所述蛋白质的Asn残基连接。98.如权利要求87

97中任一项所述的方法,其中所述寡糖中的所述GlcNAc与所述蛋白质的Asn残基直接连接。99.如权利要求87

98中任一项所述的方法,其中所述寡糖中的所述GlcNAc与所述寡糖的糖连接。100.如权利要求99所述的方法,其中所述寡糖中的所述GlcNAc与所述寡糖的甘露糖连接。101.如权利要求87

100中任一项所述的方法,其中所述蛋白质包含Fc片段。102.如权利要求87

101中任一项所述的方法,其中所述寡糖与所述Fc片段连接。103.如权利要求87

102中任一项所述的方法,其中所述寡糖与所述Fc片段的CH2结构域连接。104.如权利要求87

103中任一项所述的方法,其中所述寡糖与所述Fc片段的Asn297连接,所述Fc片段根据Kabat编号系统编号。105.如权利要求87

104中任一项所述的方法,其中所述蛋白质是抗体。106.如权利要求87

105中任一项所述的方法,其中所述蛋白质是抗体,并且所述蛋白质偶联物具有与其对应抗体相似的对抗原的结合亲和力。107.如权利要求106所述的方法,其中所述获得的蛋白质偶联物的结合亲和力为所述相应抗体的结合亲和力的约0.1%至约100000%。108.如权利要求106

107中任一项所述的方法,其中所述获得的蛋白质偶联物的结合亲和力为所述相应抗体的结合亲和力的约1%至约10000%。109.如权利要求106

108中任一项所述的方法,其中所述获得的蛋白质偶联物的结合亲和力为所述相应抗体的结合亲和力的约10%至约1000%。110.如权利要求106

109中任一项所述的方法,其中所述获得的蛋白质偶联物的结合亲和力为所述相应抗体的结合亲和力的约50%至约200%。111.如权利要求105

110中任一项所述的方法,其中所述抗体是单克隆抗体。112.如权利要求105

111中任一项所述的方法,其中所述抗体是IgG抗体。113.如权利要求105

112中任一项所述的方法,其中所述抗体是人源化抗体。114.如权利要求87

113中任一项所述的方法,其中所述Gal通过Galβ1,4GlcNAc键联与所述GlcNAc连接。
115.如权利要求87

114中任一项所述的方法,其中所述(Fuc)的所述岩藻糖通过α1,6键联与所述GlcNAc连接。116.如权利要求87

115中任一项所述的方法,其中所述Q

Fuc*'包含核糖核苷酸二磷酸。117.如权利要求87

116中任一项所述的方法,其中所述Q

Fuc*

包含二磷酸尿苷(UDP)、二磷酸鸟苷(GDP)或二磷酸胞苷(CDP)。118.如权利要求87

117中任一项所述的方法,其中所述Q

Fuc*'是GDP

Fuc*
...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨熠
申请(专利权)人:岩唐生物科技杭州有限责任公司
类型:发明
国别省市:

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