用于确定吞噬细胞吞噬能力的方法、装置、设备和介质制造方法及图纸

提供了一种用于确定吞噬细胞吞噬能力的方法，包括：获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，吞噬细胞图像和目标细胞图像是从通过对共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的；将目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，多个亮度子带是通过对目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；确定多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；确定吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及基于多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，确定吞噬细胞对目标细胞的吞噬能力。吞噬能力。吞噬能力。

【技术实现步骤摘要】
用于确定吞噬细胞吞噬能力的方法、装置、设备和介质


[0001]本公开涉及细胞激活状态测定
，具体涉及一种用于确定吞噬细胞吞噬能力的方法、装置、电子设备、计算机可读存储介质和计算机程序产品。

技术介绍

[0002]流式细胞荧光分选技术流式细胞技术(Flow Cytometry,FC)中的设门/圈选(Gate)技术，通过荧光激活细胞分选(Fluorescence Activated Cell Sorter,FACS)的输出值(荧光亮度是否大于预设阈值)判定被巨噬细胞吞噬的肿瘤细胞是否为阳性细胞(阳性细胞表示肿瘤细胞在巨噬细胞中存在)，统计阳性细胞的数量，判断药物的作用下巨噬细胞的吞噬能力。阳性细胞的数量越多，则表明巨噬细胞的吞噬能力越强。但缺乏对阳性细胞的阳性表达强弱的判别，无法实现定量分析。
[0003]另外，需要流式细胞技术进行大量的生物实验来评估巨噬细胞的吞噬能力。而流式细胞仪器的通量较低，同时还耗费大量人力和物力，导致在筛选药物的任务中无法进行大规模生物实验验证，影响药物筛选的实验规模和效率。

技术实现思路

[0004]提供一种缓解、减轻或者甚至消除上述问题中的一个或多个的机制将是有利的。
[0005]根据本公开的一方面，提供了一种用于确定吞噬细胞吞噬能力的方法，包括：获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，其中，吞噬细胞图像包含多个吞噬细胞对象，目标细胞图像包含多个目标细胞对象，吞噬细胞图像和目标细胞图像是从通过对共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的；将目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，多个亮度子带是通过对目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；确定多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；确定吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及基于多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，确定吞噬细胞对目标细胞的吞噬能力。
[0006]根据本公开的另一方面，提供了一种用于确定扰动条件对吞噬细胞吞噬能力的增强或抑制作用的方法，包括：获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，其中，吞噬细胞图像包含多个吞噬细胞对象，目标细胞图像包含多个目标细胞对象，吞噬细胞图像和目标细胞图像是从通过对经受扰动条件的共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的，扰动条件包括以下至少一项：在预定持续时间内暴露于预定浓度的化合物、对吞噬细胞和/或目标细胞中的候选基因进行基因编辑；将目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，多个亮度子带是通过对目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；确定多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；确定吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及基于多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和吞噬细胞图像
所包含的吞噬细胞对象的数目，确定扰动条件增强或抑制吞噬细胞对目标细胞的吞噬能力。
[0007]根据本公开的另一方面，提供了一种靶点筛选方法，包括：分别确定吞噬细胞和/或目标细胞中的多个不同候选基因对吞噬细胞吞噬目标细胞的吞噬能力的增强或抑制作用，其中，针对多个不同候选基因中的每个候选基因，确定包括：获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，其中，吞噬细胞图像和目标细胞图像是从通过对经受扰动条件的共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的，扰动条件包括对吞噬细胞和/或目标细胞中的该候选基因进行基因编辑，吞噬细胞图像包含多个吞噬细胞对象，目标细胞图像包含多个目标细胞对象；将目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，多个亮度子带是通过对目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；确定多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；确定吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及基于多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，确定基因编辑增强或抑制吞噬细胞对目标细胞的吞噬能力；以及从多个不同候选基因中选择至少一个候选基因和/或至少一个候选基因所表达的蛋白质作为靶点，其中，所选择的至少一个候选基因被确定具有增强吞噬能力的作用。
[0008]根据本公开的另一方面，提供了一种用于确定吞噬细胞吞噬能力的装置，包括：第一模块，用于获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，其中，吞噬细胞图像包含多个吞噬细胞对象，目标细胞图像包含多个目标细胞对象，吞噬细胞图像和目标细胞图像是从通过对共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的；第二模块，用于将目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，多个亮度子带是通过对目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；第三模块，用于确定多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；第四模块，用于确定吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及第五模块，用于基于多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，确定吞噬细胞对目标细胞的吞噬能力。
[0009]根据本公开的另一方面，提供了一种用于确定扰动条件对吞噬细胞吞噬能力的增强或抑制作用的装置，包括：第六模块，用于获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，其中，吞噬细胞图像包含多个吞噬细胞对象，目标细胞图像包含多个目标细胞对象，吞噬细胞图像和目标细胞图像是从通过对经受扰动条件的共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的，扰动条件包括以下至少一项：在预定持续时间内暴露于预定浓度的化合物、对吞噬细胞和/或目标细胞中的候选基因进行基因编辑；第七模块，用于将目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，多个亮度子带是通过对目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；第八模块，用于确定多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；第九模块，用于确定吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及第十模块，用于基于多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，确定扰动条件增强或抑制吞噬细胞对目标细胞的吞噬能力。
[0010]根据本公开的另一方面，提供了一种电子设备，包括：处理器；以及存储器，存储器
存储有可被处理器执行的指令，指令在由处理器执行时，使处理器执行上述任一方面所述的方法。
[0011]根据本公开的另一方面，提供了一种存储有指令的非瞬时计算机可读存储介质，指令在由处理器执行时，使处理器执行上述任一方面所述的方法。
[0012]根据本公开的另一方面，提供了一种计算机程序产品，包括：指令，其中，指令在被处理器执行时，使处理器执行上述任一方面所述的方法。
[0013]根据在下文中所描述的实施本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于确定吞噬细胞吞噬能力的方法，包括：获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，其中，所述吞噬细胞图像包含多个吞噬细胞对象，所述目标细胞图像包含多个目标细胞对象，所述吞噬细胞图像和所述目标细胞图像是从通过对共培养的吞噬细胞和目标细胞进行拍摄得到的高内涵图像中提取的；将所述目标细胞图像分解成多个子带图像，每个子带图像包括所述目标细胞图像的具有落入多个亮度子带中的一个相应亮度子带中的亮度值的像素，所述多个亮度子带是通过对所述目标细胞图像的像素的亮度范围进行划分而得到；确定所述多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目；确定所述吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目；以及基于所述多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和所述吞噬细胞图像所包含的所述吞噬细胞对象的数目，确定所述吞噬细胞对所述目标细胞的吞噬能力。2.如权利要求1所述的方法，其中，所述基于所述多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目和所述吞噬细胞图像所包含的所述吞噬细胞对象的数目，确定所述吞噬细胞对所述目标细胞的吞噬能力，包括：计算所述多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目的加权和与所述吞噬细胞对象的数目的比值，其中，所述比值指示所述吞噬细胞对所述目标细胞的吞噬能力，所述多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目对应的权重系数与相应亮度子带的亮度范围呈正相关。3.如权利要求1所述的方法，其中，所述确定所述多个子带图像分别包含的目标细胞对象的相应数目，包括：对于所述多个子带图像进行灰度化处理；对于灰度化后的所述多个子带图像中的子带图像，基于自适应阈值算法对该子带图像进行图像分割，以得到包含第一数目第一子区域的第一图像，其中，所述第一子区域指示目标细胞区域，所述第一数目为该子带图像所包含的目标细胞对象的数目。4.如权利要求3所述的方法，其中，所述确定与所述多个子带图像分别对应的多个目标细胞对象数目，还包括：基于分水岭算法将所述第一图像进行分割，以得到包含第二数目第一子区域的第二图像，其中，所述第二数目大于或等于所述第一数目，所述第二数目为该子带图像所包含的目标细胞对象的数目。5.如权利要求4所述的方法，其中，所述确定与所述多个子带图像分别对应的多个目标细胞对象数目，还包括：将所述第二数目第一子区域中至少一个第一子区域过滤掉，以得到第三数目第一子区域，其中，所述至少一个第一子区域中的每一个的面积小于第一面积阈值和/或所述至少一个第一子区域中的每一个的面积大于第二面积阈值，所述第三数目为该子带图像所包含的目标细胞对象的数目。6.如权利要求5所述的方法，还包括：在所述基于自适应阈值算法对该子带图像进行分割之前，对该子带图像进行高斯模糊处理。7.如权利要求1所述的方法，其中，所述确定所述吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象
的数目，包括：对于所述吞噬细胞图像进行灰度化处理；基于自适应阈值算法对灰度化后的所述吞噬细胞图像进行图像分割，以得到包含第四数目第二子区域的第四图像，其中，所述第二子区域指示吞噬细胞对象区域，所述第四数目为所述吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目。8.如权利要求7所述的方法，其中，所述确定所述吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，还包括：基于分水岭算法将所述第四图像进行图像分割，以得到包含第五数目子区域的第五图像，其中，所述第五数目大于或等于所述第四数目，所述第五数目为所述吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目。9.如权利要求8所述的方法，其中，所述确定所述吞噬细胞图像所包含的吞噬细胞对象的数目，还包括：将所述第五数目第二子区域中至少一个第二子区域过滤掉，得到第六数目第二子区域，其中，所述至少一个第二子区域中的每一个的面积小于第三面积阈值和/或所述至少一个第一子区域中的每一个的面积大于第四面积阈值。10.如权利要求9所述的方法，还包括：在所述基于自适应阈值算法对所述吞噬细胞图像进行分割之前，对所述吞噬细胞图像进行高斯模糊处理。11.如权利要求1
‑
10任一项所述的方法，其中，所述获取吞噬细胞图像和目标细胞图像，包括：获取高内涵细胞成像系统对共培养的吞噬细胞和目标细胞拍摄的高内涵图像，其中，所述高内涵图像具有第一颜色通道和第二颜色通道，所述第一颜色通道对应所述吞噬细胞对象，所述第二颜色通道对应所述目标细胞对象；对所述高内涵图像进行预处理，以生成彩色图像；根据所述彩色图像的所述第一颜色通道对应的图像信息，生成所述吞噬细胞图像；以及根据所述彩色图像的所述第二颜色通道对应的图像信息，生成所述目标细胞图像。12.如权利要求11所述的方法，其中，所述第一颜色通道为绿色通道，所述第二颜色通道为红色通道。13.如权利要求11所述的方法，其中，所述对所述高内涵图像进行预处理包括...

【专利技术属性】
技术研发人员：王辰龙，杨常美，宋乐，
申请(专利权)人：百图生科北京智能技术有限公司，
类型：发明
国别省市：