一种菠萝种资源鉴定的SNP分子标记及应用制造技术

本发明专利技术涉及生物分子标记技术领域，公开了一种用于菠萝种资源鉴定的SNP分子标记及应用。本发明专利技术通过对110份菠萝种质资源进行重测序，开发了44个能将菠萝种质完全区分开的SNP分子标记。本发明专利技术的SNP分子标记可用于菠萝种质资源鉴定及遗传多样性分析，具有适用的品种种类更多、成本低、效率高等优点。效率高等优点。效率高等优点。

【技术实现步骤摘要】
一种菠萝种资源鉴定的SNP分子标记及应用


[0001]本专利技术属于生物分子标记
，具体地涉及一种用于菠萝种资源鉴定的SNP分子标记及应用。

技术介绍

[0002]菠萝(Ananas comosus(L.)Merr)是凤梨科凤梨属的热带亚热带果树。通过人工杂交创制新种质是菠萝新品种选育的有效手段。因此对已有种质资源进行分类、鉴定有助于杂种优势的利用，对菠萝育种具有重要意义。
[0003]菠萝种质资源传统的分类主要是基于表型性状来进行，主要分为卡因、皇后、西班牙和波多黎各四类。但表型鉴定易受环境条件的影响和人为主观因素的干扰，对研究结果造成一定的影响。而DNA分子标记技术是根据基因组中DNA片段差异来判断个体间遗传信息的差异，不受环境条件和人为主观因素的影响，在种质资源遗传多样性分析、遗传图谱的构建、基因定位与克隆以及分子标记辅助育种等方面具有重要作用。目前主要利用EST
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SSR(Wo
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hrmann et al.,2011)、RAPD(王健胜等，2015)、AFLP(Kato et al.,2本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种菠萝种质资源鉴定的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记包括以下SNP位点：
2.一种扩增权利要求1所述SNP分子标记的引物组，其特征在于，所述引物组的引物序列分别如SEQ ID NO.1
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132所示。3.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物组在菠萝种质资源基因分型中的应用，其特征在于，对所述SNP分子标记的引物序列进行荧光标记后，进行PCR扩增，检测待测位点的荧光信号值进行基因分型。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，对所述菠萝SNP分子标记的两条特异性引物5
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端分别标记不同的荧光序列。5.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物组在菠萝种质资源分类中的应用，其特征在于，包括：利用所述SNP分子标记的引物序列对菠萝种质进行基因分型，通过构建距离矩阵，构建进化树，和/或进行群体PCoA的分析。6.根据权利要求5所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：林文秋，吴青松，张秀梅，孙伟生，刘胜辉，姚艳丽，高云飞，杨如艳，
申请(专利权)人：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所，
类型：发明
国别省市：